RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390935.1

RNA5SP18-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 18, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP18, Length 121 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP18-201ENST00000390935 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa12.08□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 MYO3AQ8NEV4 1616 aa12.08□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 KDM5DQ9BY66 1539 aa12.07□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 CROCC2H7BZ55 1655 aa12.07□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa12.07□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 DAPK1P53355 1430 aa12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 NCOA1Q15788 1441 aa12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 CERKQ8TCT0 537 aa12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa12.06□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 CHIC2Q9UKJ5 165 aa12.05□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 DUOX2Q9NRD8 1548 aa12.05□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 PTPRTO14522 1441 aa12.04□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 PZPP20742 1482 aa12.04□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 SHANK2Q9UPX8 1470 aa12.04□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM135AQ9P2D6 1515 aa12.04□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 TNRQ92752 1358 aa12.04□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 KIF15Q9NS87 1388 aa12.04□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 MROH1Q8NDA8 1641 aa12.03□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 A2ML1A8K2U0 1454 aa12.02□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 ABCC3O15438 1527 aa12.02□□□□□ -0.48
RNA5SP18-201ENST00000390935 CEP152O94986 1710 aa12.02□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 PKD2Q13563 968 aa12□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP12□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa12□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 ERBINQ96RT1 1412 aa12□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 PLA2R1Q13018 1463 aa12□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.97□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 DEPDC5O75140 1603 aa11.97□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa11.96□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 ERVK-7P63135 1459 aa11.96□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 NLRP1Q9C000 1473 aa11.96□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP11.96□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP11.96□□□□□ -0.49
RNA5SP18-201ENST00000390935 UGGT1Q9NYU2 1555 aa11.96□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADGRL2O95490 1459 aa11.95□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP11.95□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 KANK1Q14678 1352 aa11.94□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANKLE2Q86XL3 938 aa11.94□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 NEURL4Q96JN8 1562 aa11.93□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa11.93□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ITGAEP38570 1179 aa11.92□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa11.92□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 VWDEQ8N2E2 1590 aa11.92□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 UBR1Q8IWV7 1749 aa11.91□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 LMTK2Q8IWU2 1503 aa11.9□□□□□ -0.5
RNA5SP18-201ENST00000390935 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 IDI1Q13907 227 aa11.88□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 MED14O60244 1454 aa11.88□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 PIK3C2BO00750 1634 aa11.87□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 ROCK1Q13464 1354 aa11.87□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.87□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 IQGAP1P46940 1657 aa11.87□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 EFCAB6Q5THR3 1501 aa11.86□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 LTKP29376 864 aa11.86□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 TXNDC2Q86VQ3 553 aa11.86□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 STAG3Q9UJ98 1225 aa11.86□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 SYNMO15061 1565 aa11.85□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 NOS1P29475 1434 aa11.85□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 UNC13BO14795 1591 aa11.84□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 ARHGAP23Q9P227 1491 aa11.84□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.84□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLIT1O75093 1534 aa11.84□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 TET3O43151 1660 aa11.84□□□□□ -0.51
RNA5SP18-201ENST00000390935 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP11.83□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 STRCP1A6NGW2 1772 aa11.83□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM2Q9UHN6 1383 aa11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 CPS1P31327 1500 aa11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 GCC2Q8IWJ2 1684 aa11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC52A1Q9NWF4 448 aa11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 EID1Q9Y6B2 187 aa11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 MYO5BQ9ULV0 1848 aa11.81□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 E9PCH4 1651 aa11.81□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 NUP155O75694 1391 aa11.8□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.8□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 ADGRB3O60242 1522 aa11.79□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP11.78□□□□□ -0.52
RNA5SP18-201ENST00000390935 PIP4K2BP78356 416 aa11.77□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 SLC26A8Q96RN1 970 aa11.77□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.76□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa11.76□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 TOM1O60784 492 aa11.76□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 CHGAP10645 457 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 BCANQ96GW7 911 aa11.75□□□□□ -0.53
RNA5SP18-201ENST00000390935 NAIPQ13075 1403 aa11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 100.2 ms