RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384354.1

RNU6-171P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 171, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-171P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-171P-201ENST00000384354 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 GGT6Q6P531 493 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP9.04□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 PPP6R1Q9UPN7 881 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 CPS1P31327 1500 aa9.04□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 MBD5Q9P267 1494 aa9.03□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP152O94986 1710 aa9.03□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 DEPDC5O75140 1603 aa9.02□□□□□ -0.96
RNU6-171P-201ENST00000384354 PKD2Q13563 968 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa9.02□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 PZPP20742 1482 aa9.01□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 KDM5DQ9BY66 1539 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 TNRQ92752 1358 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 UBR1Q8IWV7 1749 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 MROH1Q8NDA8 1641 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC7Q96NW7 1537 aa9□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 SYNMO15061 1565 aa8.99□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 UGGT1Q9NYU2 1555 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCNB3Q8WWL7 1395 aa8.98□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 MED14O60244 1454 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHIC1Q5VXU3 224 aa8.97□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP8.97□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa8.96□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa8.96□□□□□ -0.97
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCC3O15438 1527 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 NCOA2Q15596 1464 aa8.95□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF3BO15066 747 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 TOM1O60784 492 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 CCDC141Q6ZP82 1450 aa8.94□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 MTUS2Q5JR59 1369 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 MIA2Q96PC5 1412 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERVK-7P63135 1459 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 NLRP1Q9C000 1473 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM135AQ9P2D6 1515 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYO5BQ9ULV0 1848 aa8.93□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 PIK3C2BO00750 1634 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGEF5Q12774 1597 aa8.92□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 CEP162Q5TB80 1403 aa8.91□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAP3K1Q13233 1512 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 POTEAQ6S8J7 498 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 ANKLE2Q86XL3 938 aa8.9□□□□□ -0.98
RNU6-171P-201ENST00000384354 MAST1Q9Y2H9 1570 aa8.9□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 CROCC2H7BZ55 1655 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP8.89□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGAP23Q9P227 1491 aa8.89□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 LTKP29376 864 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLIT1O75093 1534 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 PHLPP1O60346 1717 aa8.88□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 NWD1Q149M9 1564 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 TET3O43151 1660 aa8.85□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP8.84□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP8.84□□□□□ -0.99
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRP6O75581 1613 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa8.83□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 GCC2Q8IWJ2 1684 aa8.82□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM94Q12767 1356 aa8.82□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 FAM135BQ49AJ0 1406 aa8.81□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 EFCAB6Q5THR3 1501 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 DUOX2Q9NRD8 1548 aa8.8□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 TXNDC2Q86VQ3 553 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP8.79□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 ADGRB3O60242 1522 aa8.79□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 SHPRHQ149N8 1683 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM2Q9UHN6 1383 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 SLC26A8Q96RN1 970 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa8.78□□□□□ -1
RNU6-171P-201ENST00000384354 PTPN23Q9H3S7 1636 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 DIP2AQ14689 1571 aa8.77□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 MYOM3Q5VTT5 1437 aa8.76□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP8.76□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 KIF15Q9NS87 1388 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 ABCC5O15440 1437 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 LMTK2Q8IWU2 1503 aa8.75□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPY4P0CV99 314 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 TSPY10P0CW01 314 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 IDI1Q13907 227 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 EP400Q96L91 3159 aa8.74□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 ZFYVE9O95405 1425 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 NOS1P29475 1434 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 ERBINQ96RT1 1412 aa8.73□□□□□ -1.01
RNU6-171P-201ENST00000384354 RSPH4AQ5TD94 716 aa8.73□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 94.3 ms