RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000383282.3

NPHP3-202, Transcript of nephrocystin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3, Length 782 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-202ENST00000383282 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.72■■■■■ 4.27
NPHP3-202ENST00000383282 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.69■■■■■ 4.27
NPHP3-202ENST00000383282 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.69■■■■■ 4.27
NPHP3-202ENST00000383282 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP41.69■■■■■ 4.26
NPHP3-202ENST00000383282 LTBP4Q8N2S1 1624 aa41.69■■■■■ 4.26
NPHP3-202ENST00000383282 A2ML1A8K2U0 1454 aa41.66■■■■■ 4.26
NPHP3-202ENST00000383282 PZPP20742 1482 aa41.63■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.63■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 TNRQ92752 1358 aa41.63■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 MIA2Q96PC5 1412 aa41.62■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 MYOM3Q5VTT5 1437 aa41.61■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.61■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.6■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 MAST1Q9Y2H9 1570 aa41.58■■■■■ 4.25
NPHP3-202ENST00000383282 APLP2Q06481 763 aa41.56■■■■■ 4.24
NPHP3-202ENST00000383282 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41.55■■■■■ 4.24
NPHP3-202ENST00000383282 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP41.54■■■■■ 4.24
NPHP3-202ENST00000383282 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.45■■■■■ 4.23
NPHP3-202ENST00000383282 NLRP1Q9C000 1473 aa41.44■■■■■ 4.22
NPHP3-202ENST00000383282 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.43■■■■■ 4.22
NPHP3-202ENST00000383282 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.41■■■■■ 4.22
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC3O15438 1527 aa41.39■■■■■ 4.22
NPHP3-202ENST00000383282 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.38■■■■■ 4.21
NPHP3-202ENST00000383282 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.37■■■■■ 4.21
NPHP3-202ENST00000383282 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.37■■■■■ 4.21
NPHP3-202ENST00000383282 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP41.36■■■■■ 4.21
NPHP3-202ENST00000383282 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.35■■■■■ 4.21
NPHP3-202ENST00000383282 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP41.32■■■■■ 4.21
NPHP3-202ENST00000383282 SHANK2Q9UPX8 1470 aa41.32■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.31■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 PTPN23Q9H3S7 1636 aa41.3■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 KIF15Q9NS87 1388 aa41.3■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 ABCC5O15440 1437 aa41.29■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.29■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa41.28■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.27■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 ERVK-7P63135 1459 aa41.26■■■■■ 4.2
NPHP3-202ENST00000383282 DISP3Q9P2K9 1392 aa41.25■■■■■ 4.19
NPHP3-202ENST00000383282 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.25■■■■■ 4.19
NPHP3-202ENST00000383282 ERBINQ96RT1 1412 aa41.25■■■■■ 4.19
NPHP3-202ENST00000383282 FGD6Q6ZV73 1430 aa41.23■■■■■ 4.19
NPHP3-202ENST00000383282 CROCC2H7BZ55 1655 aa41.23■■■■■ 4.19
NPHP3-202ENST00000383282 DAPK1P53355 1430 aa41.22■■■■■ 4.19
NPHP3-202ENST00000383282 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP41.2■■■■■ 4.19
NPHP3-202ENST00000383282 CPS1P31327 1500 aa41.19■■■■■ 4.18
NPHP3-202ENST00000383282 CEP152O94986 1710 aa41.18■■■■■ 4.18
NPHP3-202ENST00000383282 MED14O60244 1454 aa41.18■■■■■ 4.18
NPHP3-202ENST00000383282 DEPDC5O75140 1603 aa41.18■■■■■ 4.18
NPHP3-202ENST00000383282 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.16■■■■■ 4.18
NPHP3-202ENST00000383282 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.12■■■■■ 4.17
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.12■■■■■ 4.17
NPHP3-202ENST00000383282 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.173e-7■■□□□ 12.8
NPHP3-202ENST00000383282 KANK1Q14678 1352 aa41.11■■■■■ 4.17
NPHP3-202ENST00000383282 CHIC2Q9UKJ5 165 aa41.09■■■■■ 4.17
NPHP3-202ENST00000383282 TOM1O60784 492 aa41.06■■■■■ 4.16
NPHP3-202ENST00000383282 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.06■■■■■ 4.16
NPHP3-202ENST00000383282 IQGAP1P46940 1657 aa41.05■■■■■ 4.16
NPHP3-202ENST00000383282 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
NPHP3-202ENST00000383282 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
NPHP3-202ENST00000383282 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.99■■■■■ 4.15
NPHP3-202ENST00000383282 PIP4K2BP78356 416 aa40.96■■■■■ 4.15
NPHP3-202ENST00000383282 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
NPHP3-202ENST00000383282 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.96■■■■■ 4.15
NPHP3-202ENST00000383282 ILDR2Q71H61 639 aa40.95■■■■■ 4.15
NPHP3-202ENST00000383282 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.92■■■■■ 4.14
NPHP3-202ENST00000383282 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.92■■■■■ 4.14
NPHP3-202ENST00000383282 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.92■■■■■ 4.14
NPHP3-202ENST00000383282 EID1Q9Y6B2 187 aa40.91■■■■■ 4.14
NPHP3-202ENST00000383282 SLIT1O75093 1534 aa40.91■■■■■ 4.14
NPHP3-202ENST00000383282 ADGRL2O95490 1459 aa40.9■■■■■ 4.14
NPHP3-202ENST00000383282 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.9■■■■■ 4.14
NPHP3-202ENST00000383282 LTKP29376 864 aa40.87■■■■■ 4.13
NPHP3-202ENST00000383282 HSPA1LP34931 641 aa40.83■■■■■ 4.13
NPHP3-202ENST00000383282 PIK3C2BO00750 1634 aa40.82■■■■■ 4.13
NPHP3-202ENST00000383282 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.81■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 LRRC7Q96NW7 1537 aa40.81■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 SYNMO15061 1565 aa40.8■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.79■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 IDI1Q13907 227 aa40.79■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.77■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.76■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 SOCS7O14512 581 aa40.76■■■■■ 4.12
NPHP3-202ENST00000383282 NOS1P29475 1434 aa40.75■■■■■ 4.11
NPHP3-202ENST00000383282 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.72■■■■■ 4.11
NPHP3-202ENST00000383282 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.71■■■■■ 4.11
NPHP3-202ENST00000383282 ALKQ9UM73 1620 aa40.67■■■■■ 4.1
NPHP3-202ENST00000383282 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.67■■■■■ 4.1
NPHP3-202ENST00000383282 ADGRB3O60242 1522 aa40.63■■■■■ 4.1
NPHP3-202ENST00000383282 ROCK1Q13464 1354 aa40.56■■■■■ 4.08
NPHP3-202ENST00000383282 TET3O43151 1660 aa40.56■■■■■ 4.08
NPHP3-202ENST00000383282 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
NPHP3-202ENST00000383282 SLC26A8Q96RN1 970 aa40.54■■■■■ 4.08
NPHP3-202ENST00000383282 KCNA6P17658 529 aa40.53■■■■■ 4.08
NPHP3-202ENST00000383282 BCANQ96GW7 911 aa40.52■■■■■ 4.08
NPHP3-202ENST00000383282 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
NPHP3-202ENST00000383282 UNC13BO14795 1591 aa40.5■■■■■ 4.07
NPHP3-202ENST00000383282 HDGFP51858 240 aaKnown RBP40.49■■■■■ 4.07
NPHP3-202ENST00000383282 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.46■■■■■ 4.07
NPHP3-202ENST00000383282 TMEM94Q12767 1356 aa40.46■■■■■ 4.07
NPHP3-202ENST00000383282 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP40.44■■■■■ 4.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms