RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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ZBED1-202ENST00000381222 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa19.38■□□□□ 0.69
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ZBED1-202ENST00000381222 PTPN23Q9H3S7 1636 aa19.23■□□□□ 0.67
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ZBED1-202ENST00000381222 ZBED9Q6R2W3 1325 aa19.2■□□□□ 0.66
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ZBED1-202ENST00000381222 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.17■□□□□ 0.66
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ZBED1-202ENST00000381222 ROCK1Q13464 1354 aa19.09■□□□□ 0.65
ZBED1-202ENST00000381222 RRP1P56182 461 aaKnown RBP19.08■□□□□ 0.65
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ZBED1-202ENST00000381222 NUTM2GQ5VZR2 741 aa19.08■□□□□ 0.65
ZBED1-202ENST00000381222 COG6Q9Y2V7 657 aa19.08■□□□□ 0.65
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ZBED1-202ENST00000381222 EID1Q9Y6B2 187 aa19.06■□□□□ 0.64
ZBED1-202ENST00000381222 CGNL1Q0VF96 1302 aa19.06■□□□□ 0.64
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ZBED1-202ENST00000381222 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP19.06■□□□□ 0.64
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ZBED1-202ENST00000381222 PANK1Q8TE04 598 aa18.96■□□□□ 0.63
ZBED1-202ENST00000381222 CABP1Q9NZU7 370 aa18.96■□□□□ 0.63
ZBED1-202ENST00000381222 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
ZBED1-202ENST00000381222 WAPLQ7Z5K2 1190 aa18.96■□□□□ 0.63
ZBED1-202ENST00000381222 DISP1Q96F81 1524 aa18.96■□□□□ 0.63
ZBED1-202ENST00000381222 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
ZBED1-202ENST00000381222 CD109Q6YHK3 1445 aa18.95■□□□□ 0.62
ZBED1-202ENST00000381222 ADAMTS12P58397 1594 aa18.95■□□□□ 0.62
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