RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380221.7

TRAPPC10-202, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.85■■■■■ 4.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.83■■■■■ 4.13
TRAPPC10-202ENST00000380221 MPHOSPH9Q99550 1183 aa40.81■■■■■ 4.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 PZPP20742 1482 aa40.81■■■■■ 4.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM5DQ9BY66 1539 aa40.8■■■■■ 4.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 DEPDC5O75140 1603 aa40.79■■■■■ 4.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.76■■■■■ 4.12
TRAPPC10-202ENST00000380221 REREQ9P2R6 1566 aa40.76■■■■■ 4.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 BCORL1Q5H9F3 1711 aa40.75■■■■■ 4.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.72■■■■■ 4.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.71■■■■■ 4.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.71■■■■■ 4.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.7■■■■■ 4.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.7■■■■■ 4.11
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
TRAPPC10-202ENST00000380221 GGT6Q6P531 493 aa40.68■■■■■ 4.1
TRAPPC10-202ENST00000380221 FOXD1Q16676 465 aa40.64■■■■■ 4.1
TRAPPC10-202ENST00000380221 AGLP35573 1532 aa40.64■■■■■ 4.1
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLSPNQ9HAW4 1339 aa40.64■■■■■ 4.1
TRAPPC10-202ENST00000380221 KANK1Q14678 1352 aa40.62■■■■■ 4.09
TRAPPC10-202ENST00000380221 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.62■■■■■ 4.09
TRAPPC10-202ENST00000380221 PKD2Q13563 968 aa40.61■■■■■ 4.09
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEP152O94986 1710 aa40.51■■■■■ 4.08
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.5■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 TET3O43151 1660 aa40.48■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.48■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 MLECQ14165 292 aa40.48■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 SIN3AQ96ST3 1273 aa40.47■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.46■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 ABCC3O15438 1527 aa40.45■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa40.45■■■■■ 4.07
TRAPPC10-202ENST00000380221 E9PCH4 1651 aa40.43■■■■■ 4.06
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEUROD1Q13562 356 aa40.39■■■■■ 4.06
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.39■■■■■ 4.06
TRAPPC10-202ENST00000380221 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.39■■■■■ 4.06
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.35■■■■■ 4.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.35■■■■■ 4.05
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.29■■■■■ 4.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLA2R1Q13018 1463 aa40.29■■■■■ 4.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 NPATQ14207 1427 aa40.28■■■■■ 4.04
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.24■■■■■ 4.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40.23■■■■■ 4.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP40.21■■■■■ 4.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPRTO14522 1441 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.21■■■■■ 4.03
TRAPPC10-202ENST00000380221 TRPM2O94759 1503 aa40.17■■■■■ 4.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 CCDC144AA2RUR9 1427 aa40.16■■■■■ 4.02
TRAPPC10-202ENST00000380221 TONSLQ96HA7 1378 aa40.1■■■■■ 4.01
TRAPPC10-202ENST00000380221 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa40.1■■■■■ 4.01
TRAPPC10-202ENST00000380221 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.1■■■■■ 4.01
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZMYM3Q14202 1370 aa40.1■■■■■ 4.01
TRAPPC10-202ENST00000380221 NOS1P29475 1434 aa40.07■■■■■ 4.01
TRAPPC10-202ENST00000380221 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.07■■■■■ 4
TRAPPC10-202ENST00000380221 CLTCL1P53675 1640 aa40.07■■■■■ 4
TRAPPC10-202ENST00000380221 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.06■■■■■ 4
TRAPPC10-202ENST00000380221 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa40.06■■■■■ 4
TRAPPC10-202ENST00000380221 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.05■■■■■ 4
TRAPPC10-202ENST00000380221 MROH2AA6NES4 1674 aa40.05■■■■■ 4
TRAPPC10-202ENST00000380221 SYNMO15061 1565 aa40.01■■■■■ 4
TRAPPC10-202ENST00000380221 ERVK-7P63135 1459 aa40■■■■□ 3.99
TRAPPC10-202ENST00000380221 MADDQ8WXG6 1647 aa39.99■■■■□ 3.99
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADAMTSL3P82987 1691 aa39.97■■■■□ 3.99
TRAPPC10-202ENST00000380221 L3MBTL2Q969R5 705 aa39.97■■■■□ 3.99
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa39.94■■■■□ 3.98
TRAPPC10-202ENST00000380221 C3P01024 1663 aa39.92■■■■□ 3.98
TRAPPC10-202ENST00000380221 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP39.92■■■■□ 3.98
TRAPPC10-202ENST00000380221 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP39.92■■■■□ 3.98
TRAPPC10-202ENST00000380221 PIK3C2BO00750 1634 aa39.91■■■■□ 3.98
TRAPPC10-202ENST00000380221 RGL3Q3MIN7 710 aa39.9■■■■□ 3.98
TRAPPC10-202ENST00000380221 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa39.89■■■■□ 3.98
TRAPPC10-202ENST00000380221 KIF1BO60333 1816 aa39.88■■■■□ 3.97
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP39.87■■■■□ 3.97
TRAPPC10-202ENST00000380221 IDI1Q13907 227 aa39.86■■■■□ 3.97
TRAPPC10-202ENST00000380221 PLPPR3Q6T4P5 718 aa39.86■■■■□ 3.97
TRAPPC10-202ENST00000380221 SLC52A1Q9NWF4 448 aa39.85■■■■□ 3.97
TRAPPC10-202ENST00000380221 CHGAP10645 457 aaKnown RBP39.81■■■■□ 3.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 TNRQ92752 1358 aa39.78■■■■□ 3.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 DCAF11Q8TEB1 546 aa39.78■■■■□ 3.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEURL4Q96JN8 1562 aa39.78■■■■□ 3.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 ADGRB3O60242 1522 aa39.77■■■■□ 3.96
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa39.74■■■■□ 3.95
TRAPPC10-202ENST00000380221 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.69■■■■□ 3.94
TRAPPC10-202ENST00000380221 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP39.69■■■■□ 3.94
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.67■■■■□ 3.94
TRAPPC10-202ENST00000380221 NBPF8Q3BBV2 869 aa39.66■■■■□ 3.94
TRAPPC10-202ENST00000380221 PTPRMP28827 1452 aa39.64■■■■□ 3.94
TRAPPC10-202ENST00000380221 STAG3Q9UJ98 1225 aa39.64■■■■□ 3.94
TRAPPC10-202ENST00000380221 IFT172Q9UG01 1749 aa39.6■■■■□ 3.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa39.59■■■■□ 3.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 NLRP1Q9C000 1473 aa39.59■■■■□ 3.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 A2ML1A8K2U0 1454 aa39.57■■■■□ 3.93
TRAPPC10-202ENST00000380221 PPLO60437 1756 aa39.55■■■■□ 3.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa39.55■■■■□ 3.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 PRAG1Q86YV5 1406 aa39.55■■■■□ 3.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa39.54■■■■□ 3.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 MYO3AQ8NEV4 1616 aa39.54■■■■□ 3.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa39.53■■■■□ 3.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 UBR1Q8IWV7 1749 aa39.53■■■■□ 3.92
TRAPPC10-202ENST00000380221 STAC3Q96MF2 364 aa39.52■■■■□ 3.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.8 ms