RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379445.7

CTXN3-201, Transcript of cortexin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTXN3, Length 1,660 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3-201ENST00000379445 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP11.27□□□□□ -0.6
CTXN3-201ENST00000379445 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.26□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa11.25□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP11.24□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 MYT1LQ9UL68 1186 aa11.24□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 CEP162Q5TB80 1403 aa11.24□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.24□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 MTUS2Q5JR59 1369 aa11.24□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO41Q8TF61 875 aa11.23□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 PREX1Q8TCU6 1659 aa11.22□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 CCNB3Q8WWL7 1395 aa11.22□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa11.22□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.22□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
CTXN3-201ENST00000379445 TIAM1Q13009 1591 aa11.21□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa11.2□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 PLXNC1O60486 1568 aa11.2□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 ATP7AQ04656 1500 aa11.2□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.2□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 C3P01024 1663 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 MBD5Q9P267 1494 aa11.19□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 A2MP01023 1474 aa11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.16□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 LHX8Q68G74 356 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 SSUH2Q9Y2M2 353 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 NPATQ14207 1427 aa11.15□□□□□ -0.62
CTXN3-201ENST00000379445 NCOA2Q15596 1464 aa11.15□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF692Q9BU19 519 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 STRCQ7RTU9 1775 aa11.14□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 MROH2AA6NES4 1674 aa11.14□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa11.14□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 ZMYM3Q14202 1370 aa11.13□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 VPS8Q8N3P4 1428 aa11.13□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 CERKQ8TCT0 537 aa11.13□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.12□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 PTPRTO14522 1441 aa11.12□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 NCOA1Q15788 1441 aa11.12□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa11.11□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 ADGBQ8N7X0 1667 aa11.11□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 PTPRKQ15262 1439 aa11.1□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa11.1□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa11.09□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 GGT6Q6P531 493 aa11.09□□□□□ -0.63
CTXN3-201ENST00000379445 MAP3K1Q13233 1512 aa11.07□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 ARHGEF5Q12774 1597 aa11.07□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa11.07□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 MYO3AQ8NEV4 1616 aa11.07□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.07□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 CLEC11AQ9Y240 323 aa11.07□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 LTBP4Q8N2S1 1624 aa11.06□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 PLA2R1Q13018 1463 aa11.06□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 ARXQ96QS3 562 aa11.06□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.05□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.04□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 KDM5DQ9BY66 1539 aa11.04□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 KIF3BO15066 747 aa11.04□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 MAST1Q9Y2H9 1570 aa11.03□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 PZPP20742 1482 aa11.03□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 MYOM3Q5VTT5 1437 aa11.03□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 MIA2Q96PC5 1412 aa11.03□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.64
CTXN3-201ENST00000379445 A2ML1A8K2U0 1454 aa11.02□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa11.02□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 EVX2Q03828 476 aa11.01□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.01□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 TSPY4P0CV99 314 aa11.01□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 TSPY10P0CW01 314 aa11.01□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 TNRQ92752 1358 aa11□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 PKD2Q13563 968 aa11□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP11□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa10.99□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP10.98□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 ABCC3O15438 1527 aa10.98□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 NLRP1Q9C000 1473 aa10.97□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 NEURL4Q96JN8 1562 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 SHANK2Q9UPX8 1470 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.96□□□□□ -0.65
CTXN3-201ENST00000379445 ABCC5O15440 1437 aa10.95□□□□□ -0.66
CTXN3-201ENST00000379445 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
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