RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376098.4

PRAMEF17-201, Transcript of PRAME family member 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF17, Length 1,578 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF17-201ENST00000376098 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF17-201ENST00000376098 NCOA1Q15788 1441 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF17-201ENST00000376098 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF17-201ENST00000376098 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF17-201ENST00000376098 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF17-201ENST00000376098 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF17-201ENST00000376098 AGLP35573 1532 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF17-201ENST00000376098 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 KIF15Q9NS87 1388 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 ROCK1Q13464 1354 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 GCC2Q8IWJ2 1684 aa14.87□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 MLECQ14165 292 aa14.85□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 ERBINQ96RT1 1412 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 KIF3BO15066 747 aa14.84□□□□□ -0.03
PRAMEF17-201ENST00000376098 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa14.82□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 GGT6Q6P531 493 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 MADDQ8WXG6 1647 aa14.81□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 NAIPQ13075 1403 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 DEPDC5O75140 1603 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 HFM1A2PYH4 1435 aa14.8□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 MROH1Q8NDA8 1641 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 CEP152O94986 1710 aa14.79□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PRAMEF17-201ENST00000376098 UNC13BO14795 1591 aa14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 MROH2AA6NES4 1674 aa14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.74□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 C3P01024 1663 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.73□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 KANK1Q14678 1352 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa14.72□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 IQGAP3Q86VI3 1631 aa14.71□□□□□ -0.05
PRAMEF17-201ENST00000376098 ABCC3O15438 1527 aa14.71□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 PTPRMP28827 1452 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.69□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 TET3O43151 1660 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 NUP155O75694 1391 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 TRIM52Q96A61 297 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 ZMYM3Q14202 1370 aa14.68□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 LMTK2Q8IWU2 1503 aa14.67□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 DCAF8L1A6NGE4 600 aa14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 E9PCH4 1651 aa14.65□□□□□ -0.06
PRAMEF17-201ENST00000376098 EFCAB6Q5THR3 1501 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 HRCP23327 699 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 PCGF6Q9BYE7 350 aa14.64□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.63□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 PZPP20742 1482 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa14.62□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 NPATQ14207 1427 aa14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa14.59□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.07
PRAMEF17-201ENST00000376098 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 ERVK-7P63135 1459 aa14.58□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.57□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 PKD2Q13563 968 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.56□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 SYNMO15061 1565 aa14.55□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 TNRQ92752 1358 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 NOS1P29475 1434 aa14.54□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 MYO5BQ9ULV0 1848 aa14.52□□□□□ -0.08
PRAMEF17-201ENST00000376098 PIK3C2BO00750 1634 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 KIF1BO60333 1816 aa14.51□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 PTPRTO14522 1441 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 NLRP1Q9C000 1473 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 FKBP8Q14318 412 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 UGGT1Q9NYU2 1555 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 UBR1Q8IWV7 1749 aa14.49□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 TRPM2O94759 1503 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 CLTCL1P53675 1640 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 A2ML1A8K2U0 1454 aa14.48□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 PLA2R1Q13018 1463 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
PRAMEF17-201ENST00000376098 IDI1Q13907 227 aa14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms