RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373619.7

CITED1-202, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 886 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-202ENST00000373619 ARHGEF5Q12774 1597 aa22.22■■□□□ 1.15
CITED1-202ENST00000373619 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.21■■□□□ 1.15
CITED1-202ENST00000373619 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.2■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 VPS8Q8N3P4 1428 aa22.2■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 TNRQ92752 1358 aa22.16■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 PZPP20742 1482 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 DISP3Q9P2K9 1392 aa22.15■■□□□ 1.14
CITED1-202ENST00000373619 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
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CITED1-202ENST00000373619 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
CITED1-202ENST00000373619 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.11■■□□□ 1.13
CITED1-202ENST00000373619 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CITED1-202ENST00000373619 NLRP1Q9C000 1473 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED1-202ENST00000373619 UBAP1LF5GYI3 381 aa22.09■■□□□ 1.13
CITED1-202ENST00000373619 APLP2Q06481 763 aa22.09■■□□□ 1.13
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CITED1-202ENST00000373619 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
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CITED1-202ENST00000373619 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.08■■□□□ 1.12
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CITED1-202ENST00000373619 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.07■■□□□ 1.12
CITED1-202ENST00000373619 MYOM3Q5VTT5 1437 aa22.06■■□□□ 1.12
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CITED1-202ENST00000373619 CPS1P31327 1500 aa22.04■■□□□ 1.12
CITED1-202ENST00000373619 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.01■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 NEURL4Q96JN8 1562 aa22■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 DEPDC5O75140 1603 aa22■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 ABCC3O15438 1527 aa22■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP21.99■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 SHANK2Q9UPX8 1470 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 CEP152O94986 1710 aa21.98■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 TOM1O60784 492 aa21.97■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.96■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 IQGAP1P46940 1657 aa21.96■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
CITED1-202ENST00000373619 MED14O60244 1454 aa21.94■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 PTPN23Q9H3S7 1636 aa21.94■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 ERVK-7P63135 1459 aa21.93■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 ERBINQ96RT1 1412 aa21.92■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 KIF15Q9NS87 1388 aa21.92■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 SOCS7O14512 581 aa21.91■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 MROH1Q8NDA8 1641 aa21.91■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 KANK1Q14678 1352 aa21.9■■□□□ 1.1
CITED1-202ENST00000373619 PIP4K2BP78356 416 aa21.89■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 ILDR2Q71H61 639 aa21.89■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 VWDEQ8N2E2 1590 aa21.89■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.89■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa21.87■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 ABCC5O15440 1437 aa21.85■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 DAPK1P53355 1430 aa21.85■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa21.85■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 SYNMO15061 1565 aa21.85■■□□□ 1.09
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CITED1-202ENST00000373619 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa21.84■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 FGD6Q6ZV73 1430 aa21.83■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.83■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 EID1Q9Y6B2 187 aa21.83■■□□□ 1.09
CITED1-202ENST00000373619 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
CITED1-202ENST00000373619 HSPA1LP34931 641 aa21.79■■□□□ 1.08
CITED1-202ENST00000373619 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.78■■□□□ 1.08
CITED1-202ENST00000373619 SLIT1O75093 1534 aa21.78■■□□□ 1.08
CITED1-202ENST00000373619 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
CITED1-202ENST00000373619 STRCP1A6NGW2 1772 aa21.76■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 PIK3C2BO00750 1634 aa21.76■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 LRRC7Q96NW7 1537 aa21.75■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 CHIC2Q9UKJ5 165 aa21.75■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.75■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 LMTK2Q8IWU2 1503 aa21.73■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.72■■□□□ 1.07
CITED1-202ENST00000373619 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
CITED1-202ENST00000373619 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
CITED1-202ENST00000373619 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.7■■□□□ 1.06
CITED1-202ENST00000373619 LTKP29376 864 aa21.69■■□□□ 1.06
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CITED1-202ENST00000373619 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.65■■□□□ 1.06
CITED1-202ENST00000373619 ALKQ9UM73 1620 aa21.65■■□□□ 1.06
CITED1-202ENST00000373619 IDI1Q13907 227 aa21.64■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 ADGRB3O60242 1522 aa21.64■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.63■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 BCANQ96GW7 911 aa21.63■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 TET3O43151 1660 aa21.61■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 NOS1P29475 1434 aa21.61■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.6■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 KCNA6P17658 529 aa21.58■■□□□ 1.05
CITED1-202ENST00000373619 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.57■■□□□ 1.04
CITED1-202ENST00000373619 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
CITED1-202ENST00000373619 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.55■■□□□ 1.04
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