RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373159.1

TRAPPC3-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 590 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-201ENST00000373159 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.88■□□□□ 0.93
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TRAPPC3-201ENST00000373159 TSPY10P0CW01 314 aa20.87■□□□□ 0.93
TRAPPC3-201ENST00000373159 TNRQ92752 1358 aa20.86■□□□□ 0.93
TRAPPC3-201ENST00000373159 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa20.86■□□□□ 0.93
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TRAPPC3-201ENST00000373159 STAG3Q9UJ98 1225 aa20.46■□□□□ 0.87
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa20.46■□□□□ 0.87
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TRAPPC3-201ENST00000373159 FGD6Q6ZV73 1430 aa20.45■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-201ENST00000373159 CHIC2Q9UKJ5 165 aa20.45■□□□□ 0.86
TRAPPC3-201ENST00000373159 PTPN23Q9H3S7 1636 aa20.45■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-201ENST00000373159 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
TRAPPC3-201ENST00000373159 LMTK2Q8IWU2 1503 aa20.41■□□□□ 0.86
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TRAPPC3-201ENST00000373159 NOS1P29475 1434 aa20.36■□□□□ 0.85
TRAPPC3-201ENST00000373159 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.36■□□□□ 0.85
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TRAPPC3-201ENST00000373159 ADGRL2O95490 1459 aa20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 TET3O43151 1660 aa20.31■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 HDGFP51858 240 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
TRAPPC3-201ENST00000373159 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
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