RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000371642.1

IL13RA1-201, Transcript of interleukin 13 receptor subunit alpha 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene IL13RA1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL13RA1-201ENST00000371642 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.9■■■■■ 4.46
IL13RA1-201ENST00000371642 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP42.89■■■■■ 4.46
IL13RA1-201ENST00000371642 PTPRKQ15262 1439 aa42.89■■■■■ 4.46
IL13RA1-201ENST00000371642 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.89■■■■■ 4.46
IL13RA1-201ENST00000371642 KIF15Q9NS87 1388 aa42.85■■■■■ 4.45
IL13RA1-201ENST00000371642 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa42.81■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP42.81■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa42.81■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 MROH1Q8NDA8 1641 aa42.79■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 MYO3AQ8NEV4 1616 aa42.79■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 CHIC2Q9UKJ5 165 aa42.78■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 STRCQ7RTU9 1775 aa42.76■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP42.76■■■■■ 4.44
IL13RA1-201ENST00000371642 ERBINQ96RT1 1412 aa42.75■■■■■ 4.43
IL13RA1-201ENST00000371642 PZPP20742 1482 aa42.74■■■■■ 4.43
IL13RA1-201ENST00000371642 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa42.73■■■■■ 4.43
IL13RA1-201ENST00000371642 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP42.73■■■■■ 4.43
IL13RA1-201ENST00000371642 ABCC3O15438 1527 aa42.72■■■■■ 4.43
IL13RA1-201ENST00000371642 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP42.72■■■■■ 4.43
IL13RA1-201ENST00000371642 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
IL13RA1-201ENST00000371642 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP42.68■■■■■ 4.42
IL13RA1-201ENST00000371642 ADGRL2O95490 1459 aa42.68■■■■■ 4.42
IL13RA1-201ENST00000371642 NCOA1Q15788 1441 aa42.67■■■■■ 4.42
IL13RA1-201ENST00000371642 CEP152O94986 1710 aa42.66■■■■■ 4.42
IL13RA1-201ENST00000371642 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa42.64■■■■■ 4.42
IL13RA1-201ENST00000371642 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP42.63■■■■■ 4.42
IL13RA1-201ENST00000371642 TNRQ92752 1358 aa42.63■■■■■ 4.41
IL13RA1-201ENST00000371642 DEPDC5O75140 1603 aa42.6■■■■■ 4.41
IL13RA1-201ENST00000371642 A2ML1A8K2U0 1454 aa42.57■■■■■ 4.41
IL13RA1-201ENST00000371642 DMRT2Q9Y5R5 561 aa42.54■■■■■ 4.4
IL13RA1-201ENST00000371642 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP42.51■■■■■ 4.4
IL13RA1-201ENST00000371642 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP42.51■■■■■ 4.42e-6■■□□□ 11.5
IL13RA1-201ENST00000371642 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa42.5■■■■■ 4.39
IL13RA1-201ENST00000371642 PTPRTO14522 1441 aa42.49■■■■■ 4.39
IL13RA1-201ENST00000371642 ERVK-7P63135 1459 aa42.48■■■■■ 4.39
IL13RA1-201ENST00000371642 PLA2R1Q13018 1463 aa42.48■■■■■ 4.39
IL13RA1-201ENST00000371642 KANK1Q14678 1352 aa42.44■■■■■ 4.38
IL13RA1-201ENST00000371642 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa42.44■■■■■ 4.38
IL13RA1-201ENST00000371642 NLRP1Q9C000 1473 aa42.43■■■■■ 4.38
IL13RA1-201ENST00000371642 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP42.43■■■■■ 4.38
IL13RA1-201ENST00000371642 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa42.43■■■■■ 4.38
IL13RA1-201ENST00000371642 VWDEQ8N2E2 1590 aa42.43■■■■■ 4.38
IL13RA1-201ENST00000371642 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa42.4■■■■■ 4.38
IL13RA1-201ENST00000371642 LMTK2Q8IWU2 1503 aa42.38■■■■■ 4.37
IL13RA1-201ENST00000371642 ROCK1Q13464 1354 aa42.38■■■■■ 4.37
IL13RA1-201ENST00000371642 ITGAEP38570 1179 aa42.37■■■■■ 4.37
IL13RA1-201ENST00000371642 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP42.36■■■■■ 4.37
IL13RA1-201ENST00000371642 PKD2Q13563 968 aa42.34■■■■■ 4.37
IL13RA1-201ENST00000371642 UGGT1Q9NYU2 1555 aa42.34■■■■■ 4.37
IL13RA1-201ENST00000371642 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP42.32■■■■■ 4.37
IL13RA1-201ENST00000371642 CERKQ8TCT0 537 aa42.28■■■■■ 4.36
IL13RA1-201ENST00000371642 FBXO41Q8TF61 875 aa42.27■■■■■ 4.36
IL13RA1-201ENST00000371642 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP42.26■■■■■ 4.36
IL13RA1-201ENST00000371642 EFCAB6Q5THR3 1501 aa42.25■■■■■ 4.35
IL13RA1-201ENST00000371642 UNC13BO14795 1591 aa42.25■■■■■ 4.35
IL13RA1-201ENST00000371642 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP42.24■■■■■ 4.35
IL13RA1-201ENST00000371642 NEURL4Q96JN8 1562 aa42.22■■■■■ 4.35
IL13RA1-201ENST00000371642 UBR1Q8IWV7 1749 aa42.18■■■■■ 4.34
IL13RA1-201ENST00000371642 LTBP4Q8N2S1 1624 aa42.18■■■■■ 4.34
IL13RA1-201ENST00000371642 TET3O43151 1660 aa42.15■■■■■ 4.34
IL13RA1-201ENST00000371642 ANKLE2Q86XL3 938 aa42.13■■■■■ 4.33
IL13RA1-201ENST00000371642 SYNMO15061 1565 aa42.13■■■■■ 4.33
IL13RA1-201ENST00000371642 PIK3C2BO00750 1634 aa42.11■■■■■ 4.33
IL13RA1-201ENST00000371642 NOS1P29475 1434 aa42.11■■■■■ 4.33
IL13RA1-201ENST00000371642 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP42.09■■■■■ 4.33
IL13RA1-201ENST00000371642 GCC2Q8IWJ2 1684 aa42.09■■■■■ 4.33
IL13RA1-201ENST00000371642 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP42.07■■■■■ 4.33
IL13RA1-201ENST00000371642 IQGAP3Q86VI3 1631 aa42.06■■■■■ 4.32
IL13RA1-201ENST00000371642 MED14O60244 1454 aa42.04■■■■■ 4.32
IL13RA1-201ENST00000371642 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP42.03■■■■■ 4.32
IL13RA1-201ENST00000371642 IDI1Q13907 227 aa42■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 ARHGAP23Q9P227 1491 aa41.99■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 IQGAP1P46940 1657 aa41.99■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 SLIT1O75093 1534 aa41.99■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 NUP155O75694 1391 aa41.99■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 E9PCH4 1651 aa41.98■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP41.96■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 NAIPQ13075 1403 aa41.95■■■■■ 4.31
IL13RA1-201ENST00000371642 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP41.94■■■■■ 4.3
IL13RA1-201ENST00000371642 STAG3Q9UJ98 1225 aa41.94■■■■■ 4.3
IL13RA1-201ENST00000371642 ADGRB3O60242 1522 aa41.92■■■■■ 4.3
IL13RA1-201ENST00000371642 IQSEC2Q5JU85 1478 aa41.91■■■■■ 4.3
IL13RA1-201ENST00000371642 LTKP29376 864 aa41.89■■■■■ 4.3
IL13RA1-201ENST00000371642 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.89■■■■■ 4.3
IL13RA1-201ENST00000371642 TMEM2Q9UHN6 1383 aa41.88■■■■■ 4.3
IL13RA1-201ENST00000371642 TXNDC2Q86VQ3 553 aa41.87■■■■■ 4.29
IL13RA1-201ENST00000371642 HFM1A2PYH4 1435 aa41.84■■■■■ 4.29
IL13RA1-201ENST00000371642 EID1Q9Y6B2 187 aa41.81■■■■■ 4.28
IL13RA1-201ENST00000371642 CPS1P31327 1500 aa41.79■■■■■ 4.28
IL13RA1-201ENST00000371642 MYO5BQ9ULV0 1848 aa41.76■■■■■ 4.28
IL13RA1-201ENST00000371642 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.75■■■■■ 4.27
IL13RA1-201ENST00000371642 STRCP1A6NGW2 1772 aa41.71■■■■■ 4.27
IL13RA1-201ENST00000371642 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.69■■■■■ 4.26
IL13RA1-201ENST00000371642 ZFYVE9O95405 1425 aa41.65■■■■■ 4.26
IL13RA1-201ENST00000371642 CHGAP10645 457 aaKnown RBP41.65■■■■■ 4.26
IL13RA1-201ENST00000371642 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.62■■■■■ 4.25
IL13RA1-201ENST00000371642 TRIM52Q96A61 297 aa41.62■■■■■ 4.25
IL13RA1-201ENST00000371642 UBAP1LF5GYI3 381 aa41.58■■■■■ 4.25
IL13RA1-201ENST00000371642 LRRC7Q96NW7 1537 aa41.55■■■■■ 4.24
IL13RA1-201ENST00000371642 SLC26A8Q96RN1 970 aa41.53■■■■■ 4.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.6 ms