RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370500.9

GTF2B-201, Transcript of general transcription factor IIB, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTF2B, Length 1,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2B-201ENST00000370500 ABCC1P33527 1531 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF2B-201ENST00000370500 MLH3Q9UHC1 1453 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF2B-201ENST00000370500 YEATS2Q9ULM3 1422 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF2B-201ENST00000370500 TIAM1Q13009 1591 aa14.85□□□□□ -0.03
GTF2B-201ENST00000370500 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.84□□□□□ -0.03
GTF2B-201ENST00000370500 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.83□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa14.83□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.82□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.81□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 NCOA2Q15596 1464 aa14.8□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa14.8□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 HECW2Q9P2P5 1572 aa14.8□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 ADAMTSL3P82987 1691 aa14.8□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 BCORL1Q5H9F3 1711 aa14.8□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.79□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 REREQ9P2R6 1566 aa14.78□□□□□ -0.04
GTF2B-201ENST00000370500 SYCP2Q9BX26 1530 aa14.77□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 PTPRMP28827 1452 aa14.76□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.75□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 MBD5Q9P267 1494 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 AGLP35573 1532 aa14.74□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.73□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 MLECQ14165 292 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 MIA2Q96PC5 1412 aa14.73□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 MADDQ8WXG6 1647 aa14.72□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 ABCA6Q8N139 1617 aa14.71□□□□□ -0.05
GTF2B-201ENST00000370500 PROM2Q8N271 834 aa14.71□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 MYOM3Q5VTT5 1437 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 ATP7AQ04656 1500 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 TSPY4P0CV99 314 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 TSPY10P0CW01 314 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 PHF12Q96QT6 1004 aa14.7□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa14.69□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.68□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 A2MP01023 1474 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 ARHGEF5Q12774 1597 aa14.67□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 CNTLNQ9NXG0 1405 aa14.65□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
GTF2B-201ENST00000370500 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa14.63□□□□□ -0.07
GTF2B-201ENST00000370500 PLXNC1O60486 1568 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF2B-201ENST00000370500 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.62□□□□□ -0.07
GTF2B-201ENST00000370500 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
GTF2B-201ENST00000370500 GGT6Q6P531 493 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF2B-201ENST00000370500 FGD6Q6ZV73 1430 aa14.59□□□□□ -0.07
GTF2B-201ENST00000370500 MAST1Q9Y2H9 1570 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 PLEKHG5O94827 1062 aa14.58□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 LMTK3Q96Q04 1460 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 KIF3BO15066 747 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 ZMYM3Q14202 1370 aa14.57□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.55□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 ABCC5O15440 1437 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 NPATQ14207 1427 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 FAM135AQ9P2D6 1515 aa14.54□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 MROH2AA6NES4 1674 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa14.53□□□□□ -0.08
GTF2B-201ENST00000370500 DAPK1P53355 1430 aa14.52□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 C3P01024 1663 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 DUOX2Q9NRD8 1548 aa14.51□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 MS4A3Q96HJ5 214 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.5□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.49□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 KIF15Q9NS87 1388 aa14.49□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 HSPA2P54652 639 aa14.48□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 PTPRKQ15262 1439 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 ERBINQ96RT1 1412 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 KDM5DQ9BY66 1539 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 MIER1Q8N108 512 aa14.47□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP14.46□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 NCOA1Q15788 1441 aa14.46□□□□□ -0.09
GTF2B-201ENST00000370500 ASTLQ6HA08 431 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
GTF2B-201ENST00000370500 CROCC2H7BZ55 1655 aa14.46□□□□□ -0.1
GTF2B-201ENST00000370500 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
GTF2B-201ENST00000370500 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.44□□□□□ -0.1
GTF2B-201ENST00000370500 CCDC61Q9Y6R9 512 aa14.44□□□□□ -0.1
GTF2B-201ENST00000370500 ADGRL2O95490 1459 aa14.44□□□□□ -0.1
GTF2B-201ENST00000370500 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
GTF2B-201ENST00000370500 PZPP20742 1482 aa14.43□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 92.8 ms