RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361211.9

CSAG1-201, Transcript of chondrosarcoma associated gene 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG1, Length 630 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1-201ENST00000361211 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRKQ15262 1439 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRL2O95490 1459 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.99■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.98■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.98■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.98■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 NCOA1Q15788 1441 aa22.98■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 ERBINQ96RT1 1412 aa22.97■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 FAM135AQ9P2D6 1515 aa22.96■■□□□ 1.27
CSAG1-201ENST00000361211 HSPA2P54652 639 aa22.95■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 NPATQ14207 1427 aa22.93■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.93■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.92■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 ABCC3O15438 1527 aa22.92■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP22.91■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
CSAG1-201ENST00000361211 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 DEPDC5O75140 1603 aa22.89■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 CEP152O94986 1710 aa22.88■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 PZPP20742 1482 aa22.88■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 ITGAEP38570 1179 aa22.88■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.86■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.84■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 ROCK1Q13464 1354 aa22.84■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.83■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.83■■□□□ 1.25
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.81■■□□□ 1.24
CSAG1-201ENST00000361211 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.8■■□□□ 1.24
CSAG1-201ENST00000361211 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
CSAG1-201ENST00000361211 TNRQ92752 1358 aa22.79■■□□□ 1.24
CSAG1-201ENST00000361211 KANK1Q14678 1352 aa22.76■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa22.76■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 ERVK-7P63135 1459 aa22.76■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.76■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 STRCQ7RTU9 1775 aa22.76■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.74■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.74■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 UNC13BO14795 1591 aa22.73■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.23
CSAG1-201ENST00000361211 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.7■■□□□ 1.22
CSAG1-201ENST00000361211 NLRP1Q9C000 1473 aa22.69■■□□□ 1.22
CSAG1-201ENST00000361211 PLA2R1Q13018 1463 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG1-201ENST00000361211 NAIPQ13075 1403 aa22.66■■□□□ 1.22
CSAG1-201ENST00000361211 GCC2Q8IWJ2 1684 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG1-201ENST00000361211 TET3O43151 1660 aa22.65■■□□□ 1.22
CSAG1-201ENST00000361211 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.64■■□□□ 1.22
CSAG1-201ENST00000361211 IQGAP3Q86VI3 1631 aa22.64■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa22.63■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 SYNMO15061 1565 aa22.62■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 HFM1A2PYH4 1435 aa22.61■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 PTPRTO14522 1441 aa22.6■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 NOS1P29475 1434 aa22.6■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 NUP155O75694 1391 aa22.6■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 DMRT2Q9Y5R5 561 aa22.58■■□□□ 1.21
CSAG1-201ENST00000361211 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 E9PCH4 1651 aa22.58■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.57■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 PIK3C2BO00750 1634 aa22.57■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.55■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 PKD2Q13563 968 aa22.55■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 IDI1Q13907 227 aa22.52■■□□□ 1.2
CSAG1-201ENST00000361211 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.48■■□□□ 1.19
CSAG1-201ENST00000361211 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.47■■□□□ 1.19
CSAG1-201ENST00000361211 ADGRB3O60242 1522 aa22.47■■□□□ 1.19
CSAG1-201ENST00000361211 SLIT1O75093 1534 aa22.47■■□□□ 1.19
CSAG1-201ENST00000361211 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
CSAG1-201ENST00000361211 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.46■■□□□ 1.19
CSAG1-201ENST00000361211 MED14O60244 1454 aa22.45■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 LTBP4Q8N2S1 1624 aa22.44■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 TRIM52Q96A61 297 aa22.44■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.44■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 LTKP29376 864 aa22.43■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.42■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 IQGAP1P46940 1657 aa22.42■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.41■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 CERKQ8TCT0 537 aa22.41■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.4■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa22.39■■□□□ 1.18
CSAG1-201ENST00000361211 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.38■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 SETD5Q9C0A6 1442 aa22.38■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 EID1Q9Y6B2 187 aa22.35■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 ZFYVE9O95405 1425 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 TRPM2O94759 1503 aa22.34■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 CLTCL1P53675 1640 aa22.33■■□□□ 1.17
CSAG1-201ENST00000361211 RIMS2Q9UQ26 1411 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG1-201ENST00000361211 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa22.32■■□□□ 1.16
CSAG1-201ENST00000361211 FOXD1Q16676 465 aa22.3■■□□□ 1.16
CSAG1-201ENST00000361211 FBXO41Q8TF61 875 aa22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms