RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359957.7

BRMS1-201, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BRMS1, Length 1,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-201ENST00000359957 ERBINQ96RT1 1412 aa22.28■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
BRMS1-201ENST00000359957 ADGRL2O95490 1459 aa22.26■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 NCOA1Q15788 1441 aa22.26■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 KDM5DQ9BY66 1539 aa22.25■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.24■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 ZMYM3Q14202 1370 aa22.24■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 ITGAEP38570 1179 aa22.23■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.22■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
BRMS1-201ENST00000359957 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 NPATQ14207 1427 aa22.18■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.18■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 LMTK3Q96Q04 1460 aa22.18■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 ROCK1Q13464 1354 aa22.18■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 KANK1Q14678 1352 aa22.18■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa22.16■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 PTPRKQ15262 1439 aa22.15■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
BRMS1-201ENST00000359957 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.13
BRMS1-201ENST00000359957 ABCC3O15438 1527 aa22.14■■□□□ 1.13
BRMS1-201ENST00000359957 DEPDC5O75140 1603 aa22.13■■□□□ 1.13
BRMS1-201ENST00000359957 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.13■■□□□ 1.13
BRMS1-201ENST00000359957 PZPP20742 1482 aa22.12■■□□□ 1.13
BRMS1-201ENST00000359957 CEP152O94986 1710 aa22.11■■□□□ 1.13
BRMS1-201ENST00000359957 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.09■■□□□ 1.13
BRMS1-201ENST00000359957 MYO3AQ8NEV4 1616 aa22.06■■□□□ 1.12
BRMS1-201ENST00000359957 HSPA2P54652 639 aa22.06■■□□□ 1.12
BRMS1-201ENST00000359957 TNRQ92752 1358 aa22.04■■□□□ 1.12
BRMS1-201ENST00000359957 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
BRMS1-201ENST00000359957 UNC13BO14795 1591 aa22.02■■□□□ 1.12
BRMS1-201ENST00000359957 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
BRMS1-201ENST00000359957 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.01■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.01■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.01■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 GCC2Q8IWJ2 1684 aa21.99■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa21.99■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 ERVK-7P63135 1459 aa21.98■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 A2ML1A8K2U0 1454 aa21.97■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 NLRP1Q9C000 1473 aa21.97■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 EFCAB6Q5THR3 1501 aa21.96■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
BRMS1-201ENST00000359957 TET3O43151 1660 aa21.95■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 HFM1A2PYH4 1435 aa21.94■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 NAIPQ13075 1403 aa21.94■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 NUP155O75694 1391 aa21.94■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 IQGAP3Q86VI3 1631 aa21.93■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 DMRT2Q9Y5R5 561 aa21.93■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 UGGT1Q9NYU2 1555 aa21.9■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 PLA2R1Q13018 1463 aa21.9■■□□□ 1.1
BRMS1-201ENST00000359957 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 STRCQ7RTU9 1775 aa21.87■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 PKD2Q13563 968 aa21.85■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM52Q96A61 297 aa21.85■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 PCGF6Q9BYE7 350 aa21.85■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 STAG3Q9UJ98 1225 aa21.85■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 E9PCH4 1651 aa21.84■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 NOS1P29475 1434 aa21.83■■□□□ 1.09
BRMS1-201ENST00000359957 SLC52A1Q9NWF4 448 aa21.81■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 UBR1Q8IWV7 1749 aa21.81■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 SYNMO15061 1565 aa21.81■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 PTPRTO14522 1441 aa21.81■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 PIK3C2BO00750 1634 aa21.8■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 ANKLE2Q86XL3 938 aa21.8■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa21.79■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
BRMS1-201ENST00000359957 IDI1Q13907 227 aa21.76■■□□□ 1.07
BRMS1-201ENST00000359957 SETD5Q9C0A6 1442 aa21.76■■□□□ 1.07
BRMS1-201ENST00000359957 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP21.74■■□□□ 1.07
BRMS1-201ENST00000359957 ADGRB3O60242 1522 aa21.74■■□□□ 1.07
BRMS1-201ENST00000359957 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa21.74■■□□□ 1.07
BRMS1-201ENST00000359957 EID1Q9Y6B2 187 aa21.73■■□□□ 1.07
BRMS1-201ENST00000359957 SLIT1O75093 1534 aa21.71■■□□□ 1.07
BRMS1-201ENST00000359957 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 TMEM2Q9UHN6 1383 aa21.69■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 NEURL4Q96JN8 1562 aa21.69■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 TXNDC2Q86VQ3 553 aa21.68■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 ARHGAP23Q9P227 1491 aa21.68■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 IQGAP1P46940 1657 aa21.67■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 MED14O60244 1454 aa21.67■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa21.67■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 HDGFP51858 240 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa21.65■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 TRPM2O94759 1503 aa21.65■■□□□ 1.06
BRMS1-201ENST00000359957 MYO5BQ9ULV0 1848 aa21.63■■□□□ 1.05
BRMS1-201ENST00000359957 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.63■■□□□ 1.05
BRMS1-201ENST00000359957 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
BRMS1-201ENST00000359957 LTKP29376 864 aa21.61■■□□□ 1.05
BRMS1-201ENST00000359957 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.6■■□□□ 1.05
BRMS1-201ENST00000359957 BCANQ96GW7 911 aa21.59■■□□□ 1.05
BRMS1-201ENST00000359957 CLTCL1P53675 1640 aa21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms