RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345015.4

KCNQ1-203, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene KCNQ1, Length 304 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-203ENST00000345015 NPATQ14207 1427 aa18.64■□□□□ 0.57
KCNQ1-203ENST00000345015 GGT6Q6P531 493 aa18.63■□□□□ 0.57
KCNQ1-203ENST00000345015 ZMYM3Q14202 1370 aa18.62■□□□□ 0.57
KCNQ1-203ENST00000345015 KDM5DQ9BY66 1539 aa18.62■□□□□ 0.57
KCNQ1-203ENST00000345015 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-203ENST00000345015 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-203ENST00000345015 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-203ENST00000345015 C3P01024 1663 aa18.58■□□□□ 0.57
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KCNQ1-203ENST00000345015 DEPDC5O75140 1603 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-203ENST00000345015 CHIC2Q9UKJ5 165 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-203ENST00000345015 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
KCNQ1-203ENST00000345015 KANK1Q14678 1352 aa18.55■□□□□ 0.56
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KCNQ1-203ENST00000345015 MROH1Q8NDA8 1641 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-203ENST00000345015 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.54■□□□□ 0.56
KCNQ1-203ENST00000345015 PREX1Q8TCU6 1659 aa18.54■□□□□ 0.56
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KCNQ1-203ENST00000345015 LMTK2Q8IWU2 1503 aa18.53■□□□□ 0.56
KCNQ1-203ENST00000345015 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.52■□□□□ 0.56
KCNQ1-203ENST00000345015 VWDEQ8N2E2 1590 aa18.51■□□□□ 0.55
KCNQ1-203ENST00000345015 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa18.51■□□□□ 0.55
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KCNQ1-203ENST00000345015 HFM1A2PYH4 1435 aa18.46■□□□□ 0.55
KCNQ1-203ENST00000345015 PLPPR3Q6T4P5 718 aa18.45■□□□□ 0.54
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KCNQ1-203ENST00000345015 NLRP1Q9C000 1473 aa18.44■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa18.43■□□□□ 0.54
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KCNQ1-203ENST00000345015 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa18.43■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 TNRQ92752 1358 aa18.42■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 ITGAEP38570 1179 aa18.42■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.4■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 GCC2Q8IWJ2 1684 aa18.4■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 CEP152O94986 1710 aa18.4■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 ERVK-7P63135 1459 aa18.39■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 EFCAB6Q5THR3 1501 aa18.39■□□□□ 0.54
KCNQ1-203ENST00000345015 MYO3AQ8NEV4 1616 aa18.39■□□□□ 0.53
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KCNQ1-203ENST00000345015 PLA2R1Q13018 1463 aa18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-203ENST00000345015 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-203ENST00000345015 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.38■□□□□ 0.53
KCNQ1-203ENST00000345015 TET3O43151 1660 aa18.38■□□□□ 0.53
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KCNQ1-203ENST00000345015 SLC52A1Q9NWF4 448 aa18.35■□□□□ 0.53
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KCNQ1-203ENST00000345015 HRCP23327 699 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-203ENST00000345015 PTPRTO14522 1441 aa18.3■□□□□ 0.52
KCNQ1-203ENST00000345015 UGGT1Q9NYU2 1555 aa18.29■□□□□ 0.52
KCNQ1-203ENST00000345015 STRCQ7RTU9 1775 aa18.28■□□□□ 0.52
KCNQ1-203ENST00000345015 SETD5Q9C0A6 1442 aa18.26■□□□□ 0.51
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KCNQ1-203ENST00000345015 E9PCH4 1651 aa18.25■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 SYNMO15061 1565 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 IDI1Q13907 227 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 ANKLE2Q86XL3 938 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 SLIT1O75093 1534 aa18.23■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 MED14O60244 1454 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 UBR1Q8IWV7 1749 aa18.22■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 ARHGAP23Q9P227 1491 aa18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 PIK3C2BO00750 1634 aa18.21■□□□□ 0.51
KCNQ1-203ENST00000345015 TRIM52Q96A61 297 aa18.19■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 HDGFP51858 240 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 ADGRB3O60242 1522 aa18.18■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 FBXO41Q8TF61 875 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 STAG3Q9UJ98 1225 aa18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 EID1Q9Y6B2 187 aa18.16■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 TRPM2O94759 1503 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa18.15■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.5
KCNQ1-203ENST00000345015 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa18.14■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 MPHOSPH9Q99550 1183 aa18.13■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 NEURL4Q96JN8 1562 aa18.13■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa18.12■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 TXNDC2Q86VQ3 553 aa18.1■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 ZFYVE9O95405 1425 aa18.08■□□□□ 0.49
KCNQ1-203ENST00000345015 CERKQ8TCT0 537 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-203ENST00000345015 IQGAP1P46940 1657 aa18.08■□□□□ 0.48
KCNQ1-203ENST00000345015 LTKP29376 864 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-203ENST00000345015 IQSEC2Q5JU85 1478 aa18.07■□□□□ 0.48
KCNQ1-203ENST00000345015 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa18.05■□□□□ 0.48
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