RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa26.71■■□□□ 1.87
PPP1CC-201ENST00000335007 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa26.68■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa26.67■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa26.66■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 CEP170Q5SW79 1584 aa26.65■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 ADCY10Q96PN6 1610 aa26.65■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 NFKBIBQ15653 356 aa26.65■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 CRBNQ96SW2 442 aa26.64■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM5DQ9BY66 1539 aa26.64■■□□□ 1.86
PPP1CC-201ENST00000335007 CDCA7LQ96GN5 454 aa26.64■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DISP1Q96F81 1524 aa26.64■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 PLIN1O60240 522 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 BRPF3Q9ULD4 1205 aa26.61■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP26.59■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAJC5BQ9UF47 199 aa26.59■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 NUP155O75694 1391 aa26.59■■□□□ 1.85
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa26.57■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.57■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.56■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SHANK2Q9UPX8 1470 aa26.56■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.55■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 SKAP1Q86WV1 359 aa26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 MRC2Q9UBG0 1479 aa26.53■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM161AQ3B820 660 aa26.51■■□□□ 1.83
PPP1CC-201ENST00000335007 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPRGP23470 1445 aa26.49■■□□□ 1.83
PPP1CC-201ENST00000335007 C9orf84Q5VXU9 1444 aa26.48■■□□□ 1.83
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC4A3P48751 1232 aa26.48■■□□□ 1.83
PPP1CC-201ENST00000335007 LAMC1P11047 1609 aa26.48■■□□□ 1.83
PPP1CC-201ENST00000335007 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.47■■□□□ 1.83
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
PPP1CC-201ENST00000335007 C8orf34Q49A92 452 aa26.45■■□□□ 1.82
PPP1CC-201ENST00000335007 C20orf194Q5TEA3 1177 aa26.45■■□□□ 1.82
PPP1CC-201ENST00000335007 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
PPP1CC-201ENST00000335007 GPRASP1Q5JY77 1395 aa26.42■■□□□ 1.82
PPP1CC-201ENST00000335007 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PPP1CC-201ENST00000335007 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa26.4■■□□□ 1.82
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 DISP3Q9P2K9 1392 aa26.36■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PLB1Q6P1J6 1458 aa26.36■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.35■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.35■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM43AQ8N2R8 423 aa26.35■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.34■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 PANK3Q9H999 370 aa26.34■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 IFT140Q96RY7 1462 aa26.34■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 ERBINQ96RT1 1412 aa26.34■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TSPY4P0CV99 314 aa26.34■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 TSPY10P0CW01 314 aa26.34■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 DUSP27Q5VZP5 1158 aa26.33■■□□□ 1.81
PPP1CC-201ENST00000335007 GRIN2AQ12879 1464 aa26.32■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGEF5Q12774 1597 aa26.32■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 TESK2Q96S53 571 aa26.32■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 CLASP1Q7Z460 1538 aa26.32■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 ADAMTS8Q9UP79 889 aa26.31■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.31■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 NBPF1Q3BBV0 1214 aa26.3■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 RSPH6AQ9H0K4 717 aa26.3■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa26.29■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 MYO5CQ9NQX4 1742 aa26.29■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 TMF1P82094 1093 aa26.29■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP26.29■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 A2MP01023 1474 aa26.28■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF521Q96K83 1311 aa26.27■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLGA2Q08379 1002 aa26.27■■□□□ 1.8
PPP1CC-201ENST00000335007 RGS3P49796 1198 aa26.26■■□□□ 1.79
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP26.26■■□□□ 1.79
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
PPP1CC-201ENST00000335007 NUP160Q12769 1436 aa26.23■■□□□ 1.79
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC141Q6ZP82 1450 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHD1A6NEE1 506 aa26.21■■□□□ 1.79
PPP1CC-201ENST00000335007 SYNJ2O15056 1496 aa26.2■■□□□ 1.79
PPP1CC-201ENST00000335007 UNC13BO14795 1591 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 RGL3Q3MIN7 710 aa26.2■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP2R1AP30153 589 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 SLFN5Q08AF3 891 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 ABCA8O94911 1581 aa26.18■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa26.17■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 PLA2R1Q13018 1463 aa26.16■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 WDR7Q9Y4E6 1490 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 BECN1Q14457 450 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.15■■□□□ 1.78
PPP1CC-201ENST00000335007 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP26.14■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.9 ms