RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326431.3

TMIE-201, Transcript of transmembrane inner ear, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMIE, Length 1,824 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIE-201ENST00000326431 IQGAP3Q86VI3 1631 aa34.68■■■■□ 3.14
TMIE-201ENST00000326431 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP34.67■■■■□ 3.14
TMIE-201ENST00000326431 DEPDC5O75140 1603 aa34.66■■■■□ 3.14
TMIE-201ENST00000326431 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa34.63■■■■□ 3.13
TMIE-201ENST00000326431 A2MP01023 1474 aa34.63■■■■□ 3.13
TMIE-201ENST00000326431 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa34.63■■■■□ 3.13
TMIE-201ENST00000326431 PKD2Q13563 968 aa34.62■■■■□ 3.13
TMIE-201ENST00000326431 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP34.62■■■■□ 3.13
TMIE-201ENST00000326431 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa34.61■■■■□ 3.13
TMIE-201ENST00000326431 MROH1Q8NDA8 1641 aa34.54■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 YEATS2Q9ULM3 1422 aa34.54■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 KIF3BO15066 747 aa34.53■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa34.53■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 BCORL1Q5H9F3 1711 aa34.53■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP34.51■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP34.51■■■■□ 3.12
TMIE-201ENST00000326431 TONSLQ96HA7 1378 aa34.5■■■■□ 3.11
TMIE-201ENST00000326431 VWDEQ8N2E2 1590 aa34.49■■■■□ 3.11
TMIE-201ENST00000326431 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP34.48■■■■□ 3.11
TMIE-201ENST00000326431 TET3O43151 1660 aa34.43■■■■□ 3.1
TMIE-201ENST00000326431 E9PCH4 1651 aa34.43■■■■□ 3.1
TMIE-201ENST00000326431 KANK1Q14678 1352 aa34.42■■■■□ 3.1
TMIE-201ENST00000326431 TRHP20396 242 aaPredicted RBP34.41■■■■□ 3.1
TMIE-201ENST00000326431 CEP152O94986 1710 aa34.4■■■■□ 3.1
TMIE-201ENST00000326431 ATP10AO60312 1499 aa34.36■■■■□ 3.09
TMIE-201ENST00000326431 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP34.35■■■■□ 3.09
TMIE-201ENST00000326431 REREQ9P2R6 1566 aa34.34■■■■□ 3.09
TMIE-201ENST00000326431 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa34.33■■■■□ 3.09
TMIE-201ENST00000326431 PLA2R1Q13018 1463 aa34.33■■■■□ 3.09
TMIE-201ENST00000326431 LMTK2Q8IWU2 1503 aa34.3■■■■□ 3.08
TMIE-201ENST00000326431 GGT6Q6P531 493 aa34.3■■■■□ 3.08
TMIE-201ENST00000326431 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa34.29■■■■□ 3.08
TMIE-201ENST00000326431 EFCAB6Q5THR3 1501 aa34.28■■■■□ 3.08
TMIE-201ENST00000326431 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa34.27■■■■□ 3.08
TMIE-201ENST00000326431 L3MBTL2Q969R5 705 aa34.27■■■■□ 3.08
TMIE-201ENST00000326431 CCDC144AA2RUR9 1427 aa34.24■■■■□ 3.07
TMIE-201ENST00000326431 ABCC3O15438 1527 aa34.23■■■■□ 3.07
TMIE-201ENST00000326431 AGLP35573 1532 aa34.22■■■■□ 3.07
TMIE-201ENST00000326431 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP34.2■■■■□ 3.07
TMIE-201ENST00000326431 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa34.19■■■■□ 3.06
TMIE-201ENST00000326431 TRPM2O94759 1503 aa34.19■■■■□ 3.06
TMIE-201ENST00000326431 PTPRTO14522 1441 aa34.18■■■■□ 3.06
TMIE-201ENST00000326431 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP34.16■■■■□ 3.06
TMIE-201ENST00000326431 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa34.15■■■■□ 3.06
TMIE-201ENST00000326431 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP34.15■■■■□ 3.06
TMIE-201ENST00000326431 CLTCL1P53675 1640 aa34.13■■■■□ 3.05
TMIE-201ENST00000326431 NPATQ14207 1427 aa34.1■■■■□ 3.05
TMIE-201ENST00000326431 NBPF8Q3BBV2 869 aa34.02■■■■□ 3.04
TMIE-201ENST00000326431 UGGT1Q9NYU2 1555 aa34.02■■■■□ 3.04
TMIE-201ENST00000326431 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa34■■■■□ 3.03
TMIE-201ENST00000326431 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP34■■■■□ 3.03
TMIE-201ENST00000326431 KIF1BO60333 1816 aa34■■■■□ 3.03
TMIE-201ENST00000326431 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa33.99■■■■□ 3.03
TMIE-201ENST00000326431 RGL3Q3MIN7 710 aa33.97■■■■□ 3.03
TMIE-201ENST00000326431 PPP6R1Q9UPN7 881 aa33.95■■■■□ 3.03
TMIE-201ENST00000326431 CNTLNQ9NXG0 1405 aa33.95■■■■□ 3.03
TMIE-201ENST00000326431 DCAF11Q8TEB1 546 aa33.95■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa33.94■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 MLECQ14165 292 aa33.94■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 PREX1Q8TCU6 1659 aa33.93■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 NOS1P29475 1434 aa33.93■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 SYNMO15061 1565 aa33.92■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa33.91■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 NEURL4Q96JN8 1562 aa33.91■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 MROH2AA6NES4 1674 aa33.9■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP33.89■■■■□ 3.02
TMIE-201ENST00000326431 PIK3C2BO00750 1634 aa33.88■■■■□ 3.01
TMIE-201ENST00000326431 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP33.88■■■■□ 3.01
TMIE-201ENST00000326431 PRAG1Q86YV5 1406 aa33.82■■■■□ 3.01
TMIE-201ENST00000326431 ADGRB3O60242 1522 aa33.82■■■■□ 3
TMIE-201ENST00000326431 RALGAPBQ86X10 1494 aa33.81■■■■□ 3
TMIE-201ENST00000326431 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa33.8■■■■□ 3
TMIE-201ENST00000326431 IFT172Q9UG01 1749 aa33.8■■■■□ 3
TMIE-201ENST00000326431 ERVK-7P63135 1459 aa33.79■■■■□ 3
TMIE-201ENST00000326431 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP33.79■■■■□ 3
TMIE-201ENST00000326431 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP33.75■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 MADDQ8WXG6 1647 aa33.75■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP33.74■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa33.73■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP33.72■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 MYO5BQ9ULV0 1848 aa33.72■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP33.71■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP33.71■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 PPLO60437 1756 aa33.7■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 CHGAP10645 457 aaKnown RBP33.7■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 ZMYM3Q14202 1370 aa33.7■■■□□ 2.99
TMIE-201ENST00000326431 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa33.69■■■□□ 2.98
TMIE-201ENST00000326431 IDI1Q13907 227 aa33.68■■■□□ 2.98
TMIE-201ENST00000326431 SLC52A1Q9NWF4 448 aa33.68■■■□□ 2.98
TMIE-201ENST00000326431 STAC3Q96MF2 364 aa33.67■■■□□ 2.98
TMIE-201ENST00000326431 MYOM2P54296 1465 aa33.66■■■□□ 2.98
TMIE-201ENST00000326431 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa33.65■■■□□ 2.98
TMIE-201ENST00000326431 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP33.63■■■□□ 2.97
TMIE-201ENST00000326431 LAMC1P11047 1609 aa33.61■■■□□ 2.97
TMIE-201ENST00000326431 CARD11Q9BXL7 1154 aa33.6■■■□□ 2.97
TMIE-201ENST00000326431 USP47Q96K76 1375 aa33.6■■■□□ 2.97
TMIE-201ENST00000326431 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa33.59■■■□□ 2.97
TMIE-201ENST00000326431 NBPF1Q3BBV0 1214 aa33.58■■■□□ 2.97
TMIE-201ENST00000326431 C3P01024 1663 aa33.58■■■□□ 2.97
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