RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPATQ14207 1427 aa30.28■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIF15Q9NS87 1388 aa30.28■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa30.27■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.26■■■□□ 2.44
PTPRCAP-201ENST00000326294 HSPA2P54652 639 aa30.26■■■□□ 2.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRKQ15262 1439 aa30.22■■■□□ 2.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERBINQ96RT1 1412 aa30.22■■■□□ 2.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRL2O95490 1459 aa30.21■■■□□ 2.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO3AQ8NEV4 1616 aa30.19■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa30.19■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHIC2Q9UKJ5 165 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCOA1Q15788 1441 aa30.18■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABCC3O15438 1527 aa30.17■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.16■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEPDC5O75140 1603 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 PZPP20742 1482 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.15■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP152O94986 1710 aa30.14■■■□□ 2.42
PTPRCAP-201ENST00000326294 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa30.1■■■□□ 2.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 STRCQ7RTU9 1775 aa30.09■■■□□ 2.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
PTPRCAP-201ENST00000326294 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP30.07■■■□□ 2.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP30.04■■■□□ 2.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 TNRQ92752 1358 aa30.03■■■□□ 2.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.02■■■□□ 2.4
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa30■■■□□ 2.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa30■■■□□ 2.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 ROCK1Q13464 1354 aa30■■■□□ 2.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.99■■■□□ 2.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERVK-7P63135 1459 aa29.97■■■□□ 2.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 LMTK2Q8IWU2 1503 aa29.96■■■□□ 2.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP29.95■■■□□ 2.39
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.95■■■□□ 2.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 KANK1Q14678 1352 aa29.94■■■□□ 2.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLA2R1Q13018 1463 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 NLRP1Q9C000 1473 aa29.93■■■□□ 2.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGAEP38570 1179 aa29.92■■■□□ 2.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.92■■■□□ 2.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 UNC13BO14795 1591 aa29.91■■■□□ 2.38
PTPRCAP-201ENST00000326294 EFCAB6Q5THR3 1501 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTPRTO14522 1441 aa29.88■■■□□ 2.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 DMRT2Q9Y5R5 561 aa29.85■■■□□ 2.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.84■■■□□ 2.37
PTPRCAP-201ENST00000326294 TET3O43151 1660 aa29.82■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.8■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCC2Q8IWJ2 1684 aa29.79■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 UBR1Q8IWV7 1749 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.78■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 PKD2Q13563 968 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 SYNMO15061 1565 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.77■■■□□ 2.36
PTPRCAP-201ENST00000326294 NOS1P29475 1434 aa29.74■■■□□ 2.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 PIK3C2BO00750 1634 aa29.74■■■□□ 2.35
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PTPRCAP-201ENST00000326294 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP29.71■■■□□ 2.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAIPQ13075 1403 aa29.71■■■□□ 2.35
PTPRCAP-201ENST00000326294 E9PCH4 1651 aa29.69■■■□□ 2.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTBP4Q8N2S1 1624 aa29.67■■■□□ 2.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.66■■■□□ 2.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP29.66■■■□□ 2.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 NUP155O75694 1391 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 HFM1A2PYH4 1435 aa29.65■■■□□ 2.34
PTPRCAP-201ENST00000326294 MED14O60244 1454 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLIT1O75093 1534 aa29.63■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ARHGAP23Q9P227 1491 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 CERKQ8TCT0 537 aa29.62■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRB3O60242 1522 aa29.61■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQGAP1P46940 1657 aa29.6■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 IDI1Q13907 227 aa29.59■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP29.59■■■□□ 2.33
PTPRCAP-201ENST00000326294 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.56■■■□□ 2.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 FBXO41Q8TF61 875 aa29.56■■■□□ 2.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.54■■■□□ 2.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM2Q9UHN6 1383 aa29.53■■■□□ 2.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.52■■■□□ 2.32
PTPRCAP-201ENST00000326294 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.51■■■□□ 2.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.51■■■□□ 2.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.5■■■□□ 2.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTKP29376 864 aa29.49■■■□□ 2.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.47■■■□□ 2.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 TXNDC2Q86VQ3 553 aa29.45■■■□□ 2.31
PTPRCAP-201ENST00000326294 EID1Q9Y6B2 187 aa29.42■■■□□ 2.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPS1P31327 1500 aa29.41■■■□□ 2.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFYVE9O95405 1425 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 STRCP1A6NGW2 1772 aa29.4■■■□□ 2.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRPM2O94759 1503 aa29.39■■■□□ 2.3
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRIM52Q96A61 297 aa29.38■■■□□ 2.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLTCL1P53675 1640 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIMS2Q9UQ26 1411 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
PTPRCAP-201ENST00000326294 SETD5Q9C0A6 1442 aa29.29■■■□□ 2.28
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