RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000321895.6

CCDC71-201, Transcript of coiled-coil domain containing 71, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC71, Length 1,781 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71-201ENST00000321895 NUP155O75694 1391 aa28.92■■■□□ 2.22
CCDC71-201ENST00000321895 MPHOSPH9Q99550 1183 aa28.92■■■□□ 2.22
CCDC71-201ENST00000321895 DEPDC5O75140 1603 aa28.92■■■□□ 2.22
CCDC71-201ENST00000321895 BCORL1Q5H9F3 1711 aa28.9■■■□□ 2.22
CCDC71-201ENST00000321895 IQGAP3Q86VI3 1631 aa28.88■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP28.88■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.86■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa28.85■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.85■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 REREQ9P2R6 1566 aa28.84■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 ATP10AO60312 1499 aa28.84■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 KIF3BO15066 747 aa28.83■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.83■■■□□ 2.21
CCDC71-201ENST00000321895 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.81■■■□□ 2.2
CCDC71-201ENST00000321895 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.8■■■□□ 2.2
CCDC71-201ENST00000321895 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.79■■■□□ 2.2
CCDC71-201ENST00000321895 KANK1Q14678 1352 aa28.77■■■□□ 2.2
CCDC71-201ENST00000321895 PKD2Q13563 968 aa28.75■■■□□ 2.19
CCDC71-201ENST00000321895 AGLP35573 1532 aa28.74■■■□□ 2.19
CCDC71-201ENST00000321895 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.72■■■□□ 2.19
CCDC71-201ENST00000321895 TET3O43151 1660 aa28.71■■■□□ 2.19
CCDC71-201ENST00000321895 FOXD1Q16676 465 aa28.71■■■□□ 2.19
CCDC71-201ENST00000321895 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.68■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.67■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa28.65■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 CEP152O94986 1710 aa28.65■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 GGT6Q6P531 493 aa28.65■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 E9PCH4 1651 aa28.64■■■□□ 2.18
CCDC71-201ENST00000321895 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.63■■■□□ 2.17
CCDC71-201ENST00000321895 NEUROD1Q13562 356 aa28.62■■■□□ 2.17
CCDC71-201ENST00000321895 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.62■■■□□ 2.17
CCDC71-201ENST00000321895 ABCC3O15438 1527 aa28.61■■■□□ 2.17
CCDC71-201ENST00000321895 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa28.6■■■□□ 2.17
CCDC71-201ENST00000321895 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.58■■■□□ 2.17
CCDC71-201ENST00000321895 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.56■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa28.55■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 PPP6R1Q9UPN7 881 aa28.55■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 PLA2R1Q13018 1463 aa28.53■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 TONSLQ96HA7 1378 aa28.52■■■□□ 2.16
CCDC71-201ENST00000321895 PTPRTO14522 1441 aa28.5■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM2O94759 1503 aa28.49■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.48■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa28.48■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 NPATQ14207 1427 aa28.47■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
CCDC71-201ENST00000321895 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP28.43■■■□□ 2.14
CCDC71-201ENST00000321895 MLECQ14165 292 aa28.41■■■□□ 2.14
CCDC71-201ENST00000321895 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP28.38■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 CLTCL1P53675 1640 aa28.38■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 CNTLNQ9NXG0 1405 aa28.38■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 NOS1P29475 1434 aa28.36■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.35■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 L3MBTL2Q969R5 705 aa28.34■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 PREX1Q8TCU6 1659 aa28.34■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
CCDC71-201ENST00000321895 MROH2AA6NES4 1674 aa28.32■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 SYNMO15061 1565 aa28.3■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.3■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.29■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 KIF1BO60333 1816 aa28.28■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa28.28■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 ERVK-7P63135 1459 aa28.28■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 PIK3C2BO00750 1634 aa28.28■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa28.28■■■□□ 2.12
CCDC71-201ENST00000321895 ZMYM3Q14202 1370 aa28.25■■■□□ 2.11
CCDC71-201ENST00000321895 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa28.24■■■□□ 2.11
CCDC71-201ENST00000321895 ADGRB3O60242 1522 aa28.2■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP28.19■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 SLC52A1Q9NWF4 448 aa28.19■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 RGL3Q3MIN7 710 aa28.19■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa28.16■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.16■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 DCAF11Q8TEB1 546 aa28.16■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 C3P01024 1663 aa28.15■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 MADDQ8WXG6 1647 aa28.15■■■□□ 2.1
CCDC71-201ENST00000321895 IDI1Q13907 227 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 STAC3Q96MF2 364 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 NBPF8Q3BBV2 869 aa28.11■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 IFT172Q9UG01 1749 aa28.1■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.09■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.09■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.08■■■□□ 2.09
CCDC71-201ENST00000321895 TNRQ92752 1358 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.07■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.05■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 MYOM2P54296 1465 aa28.05■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 PPLO60437 1756 aa28.04■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa28.04■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.03■■■□□ 2.08
CCDC71-201ENST00000321895 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.01■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 NLRP1Q9C000 1473 aa27.99■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa27.99■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 A2ML1A8K2U0 1454 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 NRXN1Q9ULB1 1477 aa27.96■■■□□ 2.07
CCDC71-201ENST00000321895 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.2 ms