RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 UACAQ9BZF9 1416 aa15.05■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.04■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.03■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHB8Q9UN66 801 aa15.03■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 SHROOM2Q13796 1616 aa15.03■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 FGD6Q6ZV73 1430 aa15.03■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.02■□□□□ -0
RABGGTB-201ENST00000319942 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP10BO94823 1461 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCA8O94911 1581 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 EMP3P54852 163 aa15.01□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 MIA2Q96PC5 1412 aa14.99□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa14.98□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGEF11O15085 1522 aa14.97□□□□□ -0.01
RABGGTB-201ENST00000319942 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 GOLGA2Q08379 1002 aa14.95□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 SETD5Q9C0A6 1442 aa14.93□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ERCC6L2Q5T890 1561 aa14.92□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC2Q92887 1545 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 CLSPNQ9HAW4 1339 aa14.91□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 HS3ST6Q96QI5 342 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.9□□□□□ -0.02
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 KCNH8Q96L42 1107 aa14.89□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa14.88□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 GSE1Q14687 1217 aa14.87□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FAM205CA6NFA0 338 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.86□□□□□ -0.031e-7■□□□□ 10.3
RABGGTB-201ENST00000319942 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.86□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPN23Q9H3S7 1636 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 RSPH4AQ5TD94 716 aa14.85□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 KDM5BQ9UGL1 1544 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEB3A0JP26 581 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 POTEBQ6S5H4 581 aa14.84□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FKBP8Q14318 412 aa14.83□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 FBXO3Q9UK99 471 aa14.83□□□□□ -0.03
RABGGTB-201ENST00000319942 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 PTPRKQ15262 1439 aa14.83□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 HFM1A2PYH4 1435 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC10Q5T3U5 1492 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPY4P0CV99 314 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 TSPY10P0CW01 314 aa14.82□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 KIF14Q15058 1648 aa14.81□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ADCY10Q96PN6 1610 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ROCK1Q13464 1354 aa14.79□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 DAPK1P53355 1430 aa14.78□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 PSEN1P49768 467 aa14.77□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 ABCC5O15440 1437 aa14.77□□□□□ -0.04
RABGGTB-201ENST00000319942 NAIPQ13075 1403 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 AKNAQ7Z591 1439 aa14.76□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 CYB5RLQ6IPT4 315 aa14.75□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 TRIM52Q96A61 297 aa14.74□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 PLCH2O75038 1416 aa14.73□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.72□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 KLHL34Q8N239 644 aa14.71□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
RABGGTB-201ENST00000319942 G3V3G9 751 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ASXL2Q76L83 1435 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa14.7□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 NCOA1Q15788 1441 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa14.69□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 ARHGAP5Q13017 1502 aa14.68□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 BOLA1Q9Y3E2 137 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 MBD5Q9P267 1494 aa14.66□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 MPHOSPH9Q99550 1183 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 C9orf84Q5VXU9 1444 aa14.65□□□□□ -0.06
RABGGTB-201ENST00000319942 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTB-201ENST00000319942 SHANK2Q9UPX8 1470 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa14.64□□□□□ -0.07
RABGGTB-201ENST00000319942 NEUROD1Q13562 356 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTB-201ENST00000319942 ADGRL2O95490 1459 aa14.63□□□□□ -0.07
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC141Q6ZP82 1450 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms