RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319242.7

GFRA4-202, Transcript of GDNF family receptor alpha 4, humanhuman

APPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC

Gene GFRA4, Length 900 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4-202ENST00000319242 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP41.2■■■■■ 4.19
GFRA4-202ENST00000319242 DUOX2Q9NRD8 1548 aa41.19■■■■■ 4.18
GFRA4-202ENST00000319242 HSPA2P54652 639 aa41.18■■■■■ 4.18
GFRA4-202ENST00000319242 PREX1Q8TCU6 1659 aa41.16■■■■■ 4.18
GFRA4-202ENST00000319242 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa41.14■■■■■ 4.18
GFRA4-202ENST00000319242 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa41.13■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.12■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP41.12■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 NPATQ14207 1427 aa41.11■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 NCOA1Q15788 1441 aa41.1■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 KDM5DQ9BY66 1539 aa41.09■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 FAM135AQ9P2D6 1515 aa41.09■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
GFRA4-202ENST00000319242 PTPRKQ15262 1439 aa41.07■■■■■ 4.16
GFRA4-202ENST00000319242 ERBINQ96RT1 1412 aa41.07■■■■■ 4.16
GFRA4-202ENST00000319242 ADGRL2O95490 1459 aa41.05■■■■■ 4.16
GFRA4-202ENST00000319242 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.98■■■■■ 4.15
GFRA4-202ENST00000319242 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.98■■■■■ 4.15
GFRA4-202ENST00000319242 ABCC3O15438 1527 aa40.95■■■■■ 4.15
GFRA4-202ENST00000319242 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP40.94■■■■■ 4.14
GFRA4-202ENST00000319242 PZPP20742 1482 aa40.94■■■■■ 4.14
GFRA4-202ENST00000319242 ITGAEP38570 1179 aa40.91■■■■■ 4.14
GFRA4-202ENST00000319242 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.91■■■■■ 4.14
GFRA4-202ENST00000319242 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
GFRA4-202ENST00000319242 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.88■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 ROCK1Q13464 1354 aa40.85■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.84■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 DEPDC5O75140 1603 aa40.84■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 MYO3AQ8NEV4 1616 aa40.84■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 TNRQ92752 1358 aa40.84■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 CEP152O94986 1710 aa40.83■■■■■ 4.13
GFRA4-202ENST00000319242 KANK1Q14678 1352 aa40.82■■■■■ 4.12
GFRA4-202ENST00000319242 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.78■■■■■ 4.12
GFRA4-202ENST00000319242 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa40.77■■■■■ 4.12
GFRA4-202ENST00000319242 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.75■■■■■ 4.11
GFRA4-202ENST00000319242 STRCQ7RTU9 1775 aa40.74■■■■■ 4.11
GFRA4-202ENST00000319242 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.73■■■■■ 4.11
GFRA4-202ENST00000319242 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.71■■■■■ 4.11
GFRA4-202ENST00000319242 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.71■■■■■ 4.11
GFRA4-202ENST00000319242 DMRT2Q9Y5R5 561 aa40.7■■■■■ 4.11
GFRA4-202ENST00000319242 ERVK-7P63135 1459 aa40.7■■■■■ 4.11
GFRA4-202ENST00000319242 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.69■■■■■ 4.1
GFRA4-202ENST00000319242 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.67■■■■■ 4.1
GFRA4-202ENST00000319242 NLRP1Q9C000 1473 aa40.65■■■■■ 4.1
GFRA4-202ENST00000319242 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.65■■■■■ 4.1
GFRA4-202ENST00000319242 PLA2R1Q13018 1463 aa40.6■■■■■ 4.09
GFRA4-202ENST00000319242 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.59■■■■■ 4.09
GFRA4-202ENST00000319242 CERKQ8TCT0 537 aa40.58■■■■■ 4.09
GFRA4-202ENST00000319242 PTPRTO14522 1441 aa40.58■■■■■ 4.09
GFRA4-202ENST00000319242 PKD2Q13563 968 aa40.56■■■■■ 4.08
GFRA4-202ENST00000319242 UNC13BO14795 1591 aa40.55■■■■■ 4.08
GFRA4-202ENST00000319242 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.54■■■■■ 4.08
GFRA4-202ENST00000319242 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.53■■■■■ 4.08
GFRA4-202ENST00000319242 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.52■■■■■ 4.08
GFRA4-202ENST00000319242 NUP155O75694 1391 aa40.46■■■■■ 4.07
GFRA4-202ENST00000319242 NAIPQ13075 1403 aa40.45■■■■■ 4.07
GFRA4-202ENST00000319242 TET3O43151 1660 aa40.43■■■■■ 4.06
GFRA4-202ENST00000319242 NOS1P29475 1434 aa40.42■■■■■ 4.06
GFRA4-202ENST00000319242 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.42■■■■■ 4.06
GFRA4-202ENST00000319242 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.41■■■■■ 4.06
GFRA4-202ENST00000319242 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.39■■■■■ 4.06
GFRA4-202ENST00000319242 IDI1Q13907 227 aa40.37■■■■■ 4.05
GFRA4-202ENST00000319242 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.37■■■■■ 4.05
GFRA4-202ENST00000319242 SYNMO15061 1565 aa40.36■■■■■ 4.05
GFRA4-202ENST00000319242 HFM1A2PYH4 1435 aa40.35■■■■■ 4.05
GFRA4-202ENST00000319242 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.35■■■■■ 4.05
GFRA4-202ENST00000319242 PIK3C2BO00750 1634 aa40.31■■■■■ 4.04
GFRA4-202ENST00000319242 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.31■■■■■ 4.04
GFRA4-202ENST00000319242 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.31■■■■■ 4.04
GFRA4-202ENST00000319242 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.31■■■■■ 4.04
GFRA4-202ENST00000319242 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.3■■■■■ 4.04
GFRA4-202ENST00000319242 E9PCH4 1651 aa40.28■■■■■ 4.04
GFRA4-202ENST00000319242 MED14O60244 1454 aa40.22■■■■■ 4.03
GFRA4-202ENST00000319242 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.22■■■■■ 4.03
GFRA4-202ENST00000319242 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.22■■■■■ 4.03
GFRA4-202ENST00000319242 SLIT1O75093 1534 aa40.21■■■■■ 4.03
GFRA4-202ENST00000319242 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.2■■■■■ 4.03
GFRA4-202ENST00000319242 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.2■■■■■ 4.03
GFRA4-202ENST00000319242 LTKP29376 864 aa40.19■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.19■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.18■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 TRIM52Q96A61 297 aa40.18■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.18■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.17■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 EID1Q9Y6B2 187 aa40.16■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 ADGRB3O60242 1522 aa40.16■■■■■ 4.02
GFRA4-202ENST00000319242 DISP3Q9P2K9 1392 aa40.11■■■■■ 4.01
GFRA4-202ENST00000319242 ILDR2Q71H61 639 aa40.1■■■■■ 4.01
GFRA4-202ENST00000319242 IQGAP1P46940 1657 aa40.1■■■■■ 4.01
GFRA4-202ENST00000319242 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.06■■■■■ 4
GFRA4-202ENST00000319242 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa40.02■■■■■ 4
GFRA4-202ENST00000319242 SOCS7O14512 581 aa40.02■■■■■ 4
GFRA4-202ENST00000319242 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
GFRA4-202ENST00000319242 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa40■■■■□ 3.99
GFRA4-202ENST00000319242 MYO5BQ9ULV0 1848 aa39.98■■■■□ 3.99
GFRA4-202ENST00000319242 SETD5Q9C0A6 1442 aa39.97■■■■□ 3.99
GFRA4-202ENST00000319242 IQSEC2Q5JU85 1478 aa39.94■■■■□ 3.98
GFRA4-202ENST00000319242 ZFYVE9O95405 1425 aa39.94■■■■□ 3.98
GFRA4-202ENST00000319242 RIMS2Q9UQ26 1411 aa39.94■■■■□ 3.98
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