RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 REREQ9P2R6 1566 aa25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 MPHOSPH9Q99550 1183 aa25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP10AO60312 1499 aa25.56■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUP155O75694 1391 aa25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLSPNQ9HAW4 1339 aa25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.55■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.54■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF3BO15066 747 aa25.52■■□□□ 1.68
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.51■■□□□ 1.67
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF20-201ENST00000316412 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF20-201ENST00000316412 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.5■■□□□ 1.67
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
PRAMEF20-201ENST00000316412 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.48■■□□□ 1.67
PRAMEF20-201ENST00000316412 AGLP35573 1532 aa25.46■■□□□ 1.67
PRAMEF20-201ENST00000316412 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
PRAMEF20-201ENST00000316412 PKD2Q13563 968 aa25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF20-201ENST00000316412 TET3O43151 1660 aa25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF20-201ENST00000316412 CEP152O94986 1710 aa25.41■■□□□ 1.66
PRAMEF20-201ENST00000316412 FOXD1Q16676 465 aa25.4■■□□□ 1.66
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF20-201ENST00000316412 KANK1Q14678 1352 aa25.39■■□□□ 1.66
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa25.38■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 E9PCH4 1651 aa25.37■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 GGT6Q6P531 493 aa25.36■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 SIN3AQ96ST3 1273 aa25.35■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCC3O15438 1527 aa25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.33■■□□□ 1.65
PRAMEF20-201ENST00000316412 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.31■■□□□ 1.64
PRAMEF20-201ENST00000316412 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.29■■□□□ 1.64
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLA2R1Q13018 1463 aa25.27■■□□□ 1.64
PRAMEF20-201ENST00000316412 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.26■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEUROD1Q13562 356 aa25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.25■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTPRTO14522 1441 aa25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 NPATQ14207 1427 aa25.21■■□□□ 1.63
PRAMEF20-201ENST00000316412 MLECQ14165 292 aa25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.2■■□□□ 1.62
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRPM2O94759 1503 aa25.18■■□□□ 1.62
PRAMEF20-201ENST00000316412 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.17■■□□□ 1.62
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLTCL1P53675 1640 aa25.13■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 TONSLQ96HA7 1378 aa25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.12■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 MROH2AA6NES4 1674 aa25.11■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 NOS1P29475 1434 aa25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.1■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 SYNMO15061 1565 aa25.08■■□□□ 1.61
PRAMEF20-201ENST00000316412 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.07■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 PIK3C2BO00750 1634 aa25.05■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 KIF1BO60333 1816 aa25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZMYM3Q14202 1370 aa25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERVK-7P63135 1459 aa25.04■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.03■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.02■■□□□ 1.6
PRAMEF20-201ENST00000316412 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF20-201ENST00000316412 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
PRAMEF20-201ENST00000316412 C3P01024 1663 aa25■■□□□ 1.59
PRAMEF20-201ENST00000316412 MADDQ8WXG6 1647 aa24.99■■□□□ 1.59
PRAMEF20-201ENST00000316412 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADGRB3O60242 1522 aa24.93■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 RGL3Q3MIN7 710 aa24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.92■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 IDI1Q13907 227 aa24.91■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTPRMP28827 1452 aa24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 IFT172Q9UG01 1749 aa24.9■■□□□ 1.58
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.89■■□□□ 1.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 DCAF11Q8TEB1 546 aa24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa24.87■■□□□ 1.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNRQ92752 1358 aa24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.85■■□□□ 1.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPLO60437 1756 aa24.84■■□□□ 1.57
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLPPR3Q6T4P5 718 aa24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa24.82■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 PRAG1Q86YV5 1406 aa24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 STAC3Q96MF2 364 aa24.79■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYOM2P54296 1465 aa24.78■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 A2ML1A8K2U0 1454 aa24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 NLRP1Q9C000 1473 aa24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.77■■□□□ 1.56
PRAMEF20-201ENST00000316412 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa24.76■■□□□ 1.55
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