RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307886.7

CTSW-201, Transcript of cathepsin W, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTSW, Length 1,300 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSW-201ENST00000307886 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP24.01■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.99■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa23.98■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.98■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 APLP2Q06481 763 aa23.98■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.97■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 ABCC5O15440 1437 aa23.96■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.96■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 PZPP20742 1482 aa23.96■■□□□ 1.43
CTSW-201ENST00000307886 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 LTBP4Q8N2S1 1624 aa23.93■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.93■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.92■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 PLA2R1Q13018 1463 aa23.92■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.92■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 TNRQ92752 1358 aa23.91■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.9■■□□□ 1.42
CTSW-201ENST00000307886 ABCC3O15438 1527 aa23.89■■□□□ 1.41
CTSW-201ENST00000307886 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.89■■□□□ 1.41
CTSW-201ENST00000307886 PKD2Q13563 968 aa23.88■■□□□ 1.41
CTSW-201ENST00000307886 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.88■■□□□ 1.41
CTSW-201ENST00000307886 DAPK1P53355 1430 aa23.87■■□□□ 1.41
CTSW-201ENST00000307886 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.87■■□□□ 1.41
CTSW-201ENST00000307886 KIF15Q9NS87 1388 aa23.86■■□□□ 1.41
CTSW-201ENST00000307886 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP23.82■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 CEP152O94986 1710 aa23.81■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.81■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.8■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 NLRP1Q9C000 1473 aa23.8■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 ERBINQ96RT1 1412 aa23.8■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.78■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 ERVK-7P63135 1459 aa23.78■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.78■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
CTSW-201ENST00000307886 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.76■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 DEPDC5O75140 1603 aa23.75■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa23.74■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 IQSEC2Q5JU85 1478 aa23.73■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.73■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 ADGRL2O95490 1459 aa23.71■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.71■■□□□ 1.39
CTSW-201ENST00000307886 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
CTSW-201ENST00000307886 MED14O60244 1454 aa23.69■■□□□ 1.38
CTSW-201ENST00000307886 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.69■■□□□ 1.38
CTSW-201ENST00000307886 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.66■■□□□ 1.38
CTSW-201ENST00000307886 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.65■■□□□ 1.38
CTSW-201ENST00000307886 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.38
CTSW-201ENST00000307886 KANK1Q14678 1352 aa23.62■■□□□ 1.37
CTSW-201ENST00000307886 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23.59■■□□□ 1.37
CTSW-201ENST00000307886 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa23.59■■□□□ 1.37
CTSW-201ENST00000307886 IQGAP1P46940 1657 aa23.59■■□□□ 1.37
CTSW-201ENST00000307886 LTKP29376 864 aa23.59■■□□□ 1.37
CTSW-201ENST00000307886 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.58■■□□□ 1.37
CTSW-201ENST00000307886 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.57■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 IDI1Q13907 227 aa23.57■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 SLIT1O75093 1534 aa23.56■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 PIK3C2BO00750 1634 aa23.56■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 SYNMO15061 1565 aa23.56■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 NOS1P29475 1434 aa23.56■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 CPS1P31327 1500 aa23.56■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.55■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.55■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.53■■□□□ 1.36
CTSW-201ENST00000307886 ROCK1Q13464 1354 aa23.51■■□□□ 1.35
CTSW-201ENST00000307886 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.5■■□□□ 1.35
CTSW-201ENST00000307886 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
CTSW-201ENST00000307886 UNC13BO14795 1591 aa23.46■■□□□ 1.35
CTSW-201ENST00000307886 ALKQ9UM73 1620 aa23.46■■□□□ 1.35
CTSW-201ENST00000307886 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
CTSW-201ENST00000307886 TET3O43151 1660 aa23.45■■□□□ 1.35
CTSW-201ENST00000307886 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.44■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 ITGAEP38570 1179 aa23.44■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.44■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 EID1Q9Y6B2 187 aa23.44■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.43■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 TOM1O60784 492 aa23.41■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 GCC2Q8IWJ2 1684 aa23.41■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 ADGRB3O60242 1522 aa23.4■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 PIP4K2BP78356 416 aa23.39■■□□□ 1.34
CTSW-201ENST00000307886 E9PCH4 1651 aa23.39■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.38■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.37■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 DISP3Q9P2K9 1392 aa23.37■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 HSPA1LP34931 641 aa23.35■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.35■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 ILDR2Q71H61 639 aa23.34■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.34■■□□□ 1.33
CTSW-201ENST00000307886 NUP155O75694 1391 aa23.34■■□□□ 1.33
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