RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000301323.7

RECQL4-201, Transcript of RecQ like helicase 4, humanhuman

TSL 3

Gene RECQL4, Length 781 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQL4-201ENST00000301323 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.69■■□□□ 1.7
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RECQL4-201ENST00000301323 PTPRKQ15262 1439 aa25.69■■□□□ 1.7
RECQL4-201ENST00000301323 DAPK1P53355 1430 aa25.67■■□□□ 1.7
RECQL4-201ENST00000301323 FBXO41Q8TF61 875 aa25.67■■□□□ 1.7
RECQL4-201ENST00000301323 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
RECQL4-201ENST00000301323 STRCQ7RTU9 1775 aa25.67■■□□□ 1.7
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RECQL4-201ENST00000301323 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.65■■□□□ 1.7
RECQL4-201ENST00000301323 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.64■■□□□ 1.7
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RECQL4-201ENST00000301323 KIF15Q9NS87 1388 aa25.59■■□□□ 1.69
RECQL4-201ENST00000301323 ABCC3O15438 1527 aa25.59■■□□□ 1.69
RECQL4-201ENST00000301323 ERBINQ96RT1 1412 aa25.57■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.57■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 NCOA1Q15788 1441 aa25.56■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 DEPDC5O75140 1603 aa25.54■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.54■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 ADGRL2O95490 1459 aa25.53■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.53■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 CEP152O94986 1710 aa25.52■■□□□ 1.68
RECQL4-201ENST00000301323 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.5■■□□□ 1.67
RECQL4-201ENST00000301323 PLA2R1Q13018 1463 aa25.49■■□□□ 1.67
RECQL4-201ENST00000301323 TNRQ92752 1358 aa25.49■■□□□ 1.67
RECQL4-201ENST00000301323 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.48■■□□□ 1.67
RECQL4-201ENST00000301323 PTPRTO14522 1441 aa25.47■■□□□ 1.67
RECQL4-201ENST00000301323 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.47■■□□□ 1.67
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RECQL4-201ENST00000301323 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.46■■□□□ 1.67
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RECQL4-201ENST00000301323 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25.43■■□□□ 1.66
RECQL4-201ENST00000301323 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.43■■□□□ 1.66
RECQL4-201ENST00000301323 NLRP1Q9C000 1473 aa25.42■■□□□ 1.66
RECQL4-201ENST00000301323 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.42■■□□□ 1.66
RECQL4-201ENST00000301323 CERKQ8TCT0 537 aa25.41■■□□□ 1.66
RECQL4-201ENST00000301323 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.38■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.38■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.34■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.34■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.34■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa25.34■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP25.33■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 LTBP4Q8N2S1 1624 aa25.33■■□□□ 1.65
RECQL4-201ENST00000301323 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.32■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 KANK1Q14678 1352 aa25.31■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 ROCK1Q13464 1354 aa25.31■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 PKD2Q13563 968 aa25.3■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 UNC13BO14795 1591 aa25.3■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.28■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP25.28■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.28■■□□□ 1.64
RECQL4-201ENST00000301323 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
RECQL4-201ENST00000301323 SYNMO15061 1565 aa25.23■■□□□ 1.63
RECQL4-201ENST00000301323 TET3O43151 1660 aa25.23■■□□□ 1.63
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RECQL4-201ENST00000301323 PIK3C2BO00750 1634 aa25.21■■□□□ 1.63
RECQL4-201ENST00000301323 MED14O60244 1454 aa25.21■■□□□ 1.63
RECQL4-201ENST00000301323 NOS1P29475 1434 aa25.2■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 GCC2Q8IWJ2 1684 aa25.19■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 IQSEC2Q5JU85 1478 aa25.18■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.18■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 IQGAP1P46940 1657 aa25.17■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 ARHGAP23Q9P227 1491 aa25.17■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 SLIT1O75093 1534 aa25.17■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 ITGAEP38570 1179 aa25.14■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 ANKLE2Q86XL3 938 aa25.14■■□□□ 1.62
RECQL4-201ENST00000301323 ADGRB3O60242 1522 aa25.12■■□□□ 1.61
RECQL4-201ENST00000301323 E9PCH4 1651 aa25.11■■□□□ 1.61
RECQL4-201ENST00000301323 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP25.11■■□□□ 1.61
RECQL4-201ENST00000301323 CPS1P31327 1500 aa25.07■■□□□ 1.6
RECQL4-201ENST00000301323 IDI1Q13907 227 aa25.05■■□□□ 1.6
RECQL4-201ENST00000301323 TMEM2Q9UHN6 1383 aa25.05■■□□□ 1.6
RECQL4-201ENST00000301323 NAIPQ13075 1403 aa25.03■■□□□ 1.6
RECQL4-201ENST00000301323 NUP155O75694 1391 aa25.02■■□□□ 1.6
RECQL4-201ENST00000301323 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.01■■□□□ 1.59
RECQL4-201ENST00000301323 LTKP29376 864 aa25.01■■□□□ 1.59
RECQL4-201ENST00000301323 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25■■□□□ 1.59
RECQL4-201ENST00000301323 HFM1A2PYH4 1435 aa24.99■■□□□ 1.59
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RECQL4-201ENST00000301323 ZFYVE9O95405 1425 aa24.95■■□□□ 1.58
RECQL4-201ENST00000301323 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.94■■□□□ 1.58
RECQL4-201ENST00000301323 EID1Q9Y6B2 187 aa24.94■■□□□ 1.58
RECQL4-201ENST00000301323 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa24.94■■□□□ 1.58
RECQL4-201ENST00000301323 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.89■■□□□ 1.57
RECQL4-201ENST00000301323 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.88■■□□□ 1.57
RECQL4-201ENST00000301323 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.86■■□□□ 1.57
RECQL4-201ENST00000301323 ALKQ9UM73 1620 aa24.86■■□□□ 1.57
RECQL4-201ENST00000301323 TRPM2O94759 1503 aa24.85■■□□□ 1.57
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