RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP30.4■■■□□ 2.46
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP30.38■■■□□ 2.45
PACSIN3-201ENST00000298838 DEPDC5O75140 1603 aa30.36■■■□□ 2.45
PACSIN3-201ENST00000298838 YEATS2Q9ULM3 1422 aa30.36■■■□□ 2.45
PACSIN3-201ENST00000298838 IQGAP3Q86VI3 1631 aa30.34■■■□□ 2.45
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM135AQ9P2D6 1515 aa30.33■■■□□ 2.45
PACSIN3-201ENST00000298838 BCORL1Q5H9F3 1711 aa30.31■■■□□ 2.44
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF3BO15066 747 aa30.3■■■□□ 2.44
PACSIN3-201ENST00000298838 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP30.29■■■□□ 2.442e-6■□□□□ 10.8
PACSIN3-201ENST00000298838 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
PACSIN3-201ENST00000298838 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa30.27■■■□□ 2.44
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP10AO60312 1499 aa30.26■■■□□ 2.43
PACSIN3-201ENST00000298838 MROH1Q8NDA8 1641 aa30.25■■■□□ 2.43
PACSIN3-201ENST00000298838 REREQ9P2R6 1566 aa30.25■■■□□ 2.43
PACSIN3-201ENST00000298838 PKD2Q13563 968 aa30.23■■■□□ 2.43
PACSIN3-201ENST00000298838 KANK1Q14678 1352 aa30.23■■■□□ 2.43
PACSIN3-201ENST00000298838 VWDEQ8N2E2 1590 aa30.21■■■□□ 2.43
PACSIN3-201ENST00000298838 FOXD1Q16676 465 aa30.21■■■□□ 2.43
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa30.18■■■□□ 2.42
PACSIN3-201ENST00000298838 SIN3AQ96ST3 1273 aa30.17■■■□□ 2.42
PACSIN3-201ENST00000298838 TET3O43151 1660 aa30.15■■■□□ 2.42
PACSIN3-201ENST00000298838 AGLP35573 1532 aa30.15■■■□□ 2.42
PACSIN3-201ENST00000298838 NEUROD1Q13562 356 aa30.13■■■□□ 2.41
PACSIN3-201ENST00000298838 GGT6Q6P531 493 aa30.11■■■□□ 2.41
PACSIN3-201ENST00000298838 LMTK2Q8IWU2 1503 aa30.1■■■□□ 2.41
PACSIN3-201ENST00000298838 CEP152O94986 1710 aa30.09■■■□□ 2.41
PACSIN3-201ENST00000298838 E9PCH4 1651 aa30.09■■■□□ 2.41
PACSIN3-201ENST00000298838 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa30.07■■■□□ 2.4
PACSIN3-201ENST00000298838 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa30.06■■■□□ 2.4
PACSIN3-201ENST00000298838 EFCAB6Q5THR3 1501 aa30.05■■■□□ 2.4
PACSIN3-201ENST00000298838 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC3O15438 1527 aa30.04■■■□□ 2.4
PACSIN3-201ENST00000298838 TONSLQ96HA7 1378 aa30.02■■■□□ 2.4
PACSIN3-201ENST00000298838 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.01■■■□□ 2.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.99■■■□□ 2.39
PACSIN3-201ENST00000298838 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.98■■■□□ 2.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PLA2R1Q13018 1463 aa29.97■■■□□ 2.39
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.95■■■□□ 2.39
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.94■■■□□ 2.38
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPM2O94759 1503 aa29.94■■■□□ 2.38
PACSIN3-201ENST00000298838 PTPRTO14522 1441 aa29.92■■■□□ 2.38
PACSIN3-201ENST00000298838 NPATQ14207 1427 aa29.91■■■□□ 2.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.9■■■□□ 2.38
PACSIN3-201ENST00000298838 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-201ENST00000298838 MLECQ14165 292 aa29.87■■■□□ 2.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.86■■■□□ 2.37
PACSIN3-201ENST00000298838 CLTCL1P53675 1640 aa29.81■■■□□ 2.36
PACSIN3-201ENST00000298838 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP29.81■■■□□ 2.36
PACSIN3-201ENST00000298838 L3MBTL2Q969R5 705 aa29.81■■■□□ 2.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP29.81■■■□□ 2.36
PACSIN3-201ENST00000298838 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.8■■■□□ 2.36
PACSIN3-201ENST00000298838 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP29.78■■■□□ 2.36
PACSIN3-201ENST00000298838 NOS1P29475 1434 aa29.77■■■□□ 2.36
PACSIN3-201ENST00000298838 PREX1Q8TCU6 1659 aa29.76■■■□□ 2.35
PACSIN3-201ENST00000298838 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.74■■■□□ 2.35
PACSIN3-201ENST00000298838 KIF1BO60333 1816 aa29.71■■■□□ 2.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SYNMO15061 1565 aa29.71■■■□□ 2.35
PACSIN3-201ENST00000298838 MROH2AA6NES4 1674 aa29.71■■■□□ 2.35
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa29.7■■■□□ 2.35
PACSIN3-201ENST00000298838 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.7■■■□□ 2.34
PACSIN3-201ENST00000298838 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa29.69■■■□□ 2.34
PACSIN3-201ENST00000298838 PIK3C2BO00750 1634 aa29.68■■■□□ 2.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ERVK-7P63135 1459 aa29.68■■■□□ 2.34
PACSIN3-201ENST00000298838 ZMYM3Q14202 1370 aa29.66■■■□□ 2.34
PACSIN3-201ENST00000298838 RGL3Q3MIN7 710 aa29.65■■■□□ 2.34
PACSIN3-201ENST00000298838 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa29.65■■■□□ 2.34
PACSIN3-201ENST00000298838 DCAF11Q8TEB1 546 aa29.61■■■□□ 2.33
PACSIN3-201ENST00000298838 ADGRB3O60242 1522 aa29.61■■■□□ 2.33
PACSIN3-201ENST00000298838 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.61■■■□□ 2.33
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC52A1Q9NWF4 448 aa29.6■■■□□ 2.33
PACSIN3-201ENST00000298838 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa29.59■■■□□ 2.33
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa29.56■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF8Q3BBV2 869 aa29.55■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 C3P01024 1663 aa29.55■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 MADDQ8WXG6 1647 aa29.54■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 IDI1Q13907 227 aa29.53■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 CHGAP10645 457 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 ADAMTSL3P82987 1691 aa29.52■■■□□ 2.32
PACSIN3-201ENST00000298838 IFT172Q9UG01 1749 aa29.51■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 STAC3Q96MF2 364 aa29.51■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.5■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa29.49■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 TNRQ92752 1358 aa29.47■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 RALGAPBQ86X10 1494 aa29.46■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 MYOM2P54296 1465 aa29.46■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 MYO5BQ9ULV0 1848 aa29.46■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 PPLO60437 1756 aa29.45■■■□□ 2.31
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.3
PACSIN3-201ENST00000298838 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.44■■■□□ 2.3
PACSIN3-201ENST00000298838 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa29.43■■■□□ 2.3
PACSIN3-201ENST00000298838 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP29.42■■■□□ 2.3
PACSIN3-201ENST00000298838 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa29.39■■■□□ 2.3
PACSIN3-201ENST00000298838 STAG3Q9UJ98 1225 aa29.39■■■□□ 2.3
PACSIN3-201ENST00000298838 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
PACSIN3-201ENST00000298838 NLRP1Q9C000 1473 aa29.37■■■□□ 2.29
PACSIN3-201ENST00000298838 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.36■■■□□ 2.29
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