RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282999.7

SRP19-201, Transcript of signal recognition particle 19, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SRP19, Length 937 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP19-201ENST00000282999 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.25■■□□□ 1.63
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SRP19-201ENST00000282999 PTPRKQ15262 1439 aa25.24■■□□□ 1.63
SRP19-201ENST00000282999 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.22■■□□□ 1.63
SRP19-201ENST00000282999 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
SRP19-201ENST00000282999 ABCC5O15440 1437 aa25.2■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.19■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.19■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 DMRT2Q9Y5R5 561 aa25.19■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 POTEDQ86YR6 584 aa25.18■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 MYO3AQ8NEV4 1616 aa25.18■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 DAPK1P53355 1430 aa25.18■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.17■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 STRCQ7RTU9 1775 aa25.17■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 PZPP20742 1482 aa25.15■■□□□ 1.62
SRP19-201ENST00000282999 KIF15Q9NS87 1388 aa25.14■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 NCOA1Q15788 1441 aa25.12■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 ERBINQ96RT1 1412 aa25.12■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 PTPRTO14522 1441 aa25.11■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.1■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 ABCC3O15438 1527 aa25.09■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.08■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.08■■□□□ 1.61
SRP19-201ENST00000282999 A2ML1A8K2U0 1454 aa25.08■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 PLA2R1Q13018 1463 aa25.08■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 TNRQ92752 1358 aa25.07■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 FBXO41Q8TF61 875 aa25.06■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa25.06■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 ADGRL2O95490 1459 aa25.03■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 NLRP1Q9C000 1473 aa25.02■■□□□ 1.6
SRP19-201ENST00000282999 PKD2Q13563 968 aa25■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 CHIC2Q9UKJ5 165 aa25■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 DEPDC5O75140 1603 aa25■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 CEP152O94986 1710 aa24.99■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.99■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 CERKQ8TCT0 537 aa24.99■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 ERVK-7P63135 1459 aa24.96■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 KANK1Q14678 1352 aa24.96■■□□□ 1.59
SRP19-201ENST00000282999 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa24.95■■□□□ 1.58
SRP19-201ENST00000282999 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.95■■□□□ 1.58
SRP19-201ENST00000282999 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.93■■□□□ 1.58
SRP19-201ENST00000282999 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.9■■□□□ 1.58
SRP19-201ENST00000282999 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.9■■□□□ 1.58
SRP19-201ENST00000282999 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.9■■□□□ 1.58
SRP19-201ENST00000282999 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.9■■□□□ 1.58
SRP19-201ENST00000282999 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.89■■□□□ 1.571e-6■■■■■ 32.9
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SRP19-201ENST00000282999 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.88■■□□□ 1.57
SRP19-201ENST00000282999 LTBP4Q8N2S1 1624 aa24.87■■□□□ 1.57
SRP19-201ENST00000282999 ROCK1Q13464 1354 aa24.85■■□□□ 1.57
SRP19-201ENST00000282999 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.84■■□□□ 1.57
SRP19-201ENST00000282999 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.83■■□□□ 1.57
SRP19-201ENST00000282999 IQSEC2Q5JU85 1478 aa24.83■■□□□ 1.56
SRP19-201ENST00000282999 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
SRP19-201ENST00000282999 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.81■■□□□ 1.56
SRP19-201ENST00000282999 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.78■■□□□ 1.56
SRP19-201ENST00000282999 MED14O60244 1454 aa24.78■■□□□ 1.56
SRP19-201ENST00000282999 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP24.78■■□□□ 1.56
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SRP19-201ENST00000282999 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 NOS1P29475 1434 aa24.73■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 TET3O43151 1660 aa24.72■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 SLIT1O75093 1534 aa24.72■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 PIK3C2BO00750 1634 aa24.72■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 ITGAEP38570 1179 aa24.71■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 IQGAP1P46940 1657 aa24.71■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 SYNMO15061 1565 aa24.71■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.7■■□□□ 1.55
SRP19-201ENST00000282999 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.69■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.69■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 CPS1P31327 1500 aa24.68■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.67■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.66■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 SLC52A1Q9NWF4 448 aa24.66■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 IDI1Q13907 227 aa24.65■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.65■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 EID1Q9Y6B2 187 aa24.64■■□□□ 1.54
SRP19-201ENST00000282999 ADGRB3O60242 1522 aa24.64■■□□□ 1.53
SRP19-201ENST00000282999 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.62■■□□□ 1.53
SRP19-201ENST00000282999 NUP155O75694 1391 aa24.6■■□□□ 1.53
SRP19-201ENST00000282999 LTKP29376 864 aa24.6■■□□□ 1.53
SRP19-201ENST00000282999 E9PCH4 1651 aa24.59■■□□□ 1.53
SRP19-201ENST00000282999 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.54■■□□□ 1.52
SRP19-201ENST00000282999 NAIPQ13075 1403 aa24.53■■□□□ 1.52
SRP19-201ENST00000282999 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa24.5■■□□□ 1.51
SRP19-201ENST00000282999 HFM1A2PYH4 1435 aa24.5■■□□□ 1.51
SRP19-201ENST00000282999 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.48■■□□□ 1.51
SRP19-201ENST00000282999 HDGFP51858 240 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
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