RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000267935.12

COMMD4-201, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COMMD4, Length 1,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-201ENST00000267935 TNRQ92752 1358 aa22.48■■□□□ 1.19
COMMD4-201ENST00000267935 A2ML1A8K2U0 1454 aa22.47■■□□□ 1.19
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COMMD4-201ENST00000267935 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
COMMD4-201ENST00000267935 ANKLE2Q86XL3 938 aa22.46■■□□□ 1.19
COMMD4-201ENST00000267935 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa22.46■■□□□ 1.19
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COMMD4-201ENST00000267935 MIA2Q96PC5 1412 aa22.4■■□□□ 1.18
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COMMD4-201ENST00000267935 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa22.38■■□□□ 1.17
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COMMD4-201ENST00000267935 SHANK2Q9UPX8 1470 aa22.29■■□□□ 1.16
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COMMD4-201ENST00000267935 MAST1Q9Y2H9 1570 aa22.25■■□□□ 1.15
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COMMD4-201ENST00000267935 MED14O60244 1454 aa22.22■■□□□ 1.15
COMMD4-201ENST00000267935 HSPA1LP34931 641 aa22.22■■□□□ 1.15
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COMMD4-201ENST00000267935 ABCC3O15438 1527 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-201ENST00000267935 DUOX2Q9NRD8 1548 aa22.21■■□□□ 1.15
COMMD4-201ENST00000267935 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.21■■□□□ 1.15
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COMMD4-201ENST00000267935 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
COMMD4-201ENST00000267935 KANK1Q14678 1352 aa22.18■■□□□ 1.14
COMMD4-201ENST00000267935 KIF15Q9NS87 1388 aa22.18■■□□□ 1.14
COMMD4-201ENST00000267935 TXNDC2Q86VQ3 553 aa22.18■■□□□ 1.14
COMMD4-201ENST00000267935 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.18■■□□□ 1.14
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COMMD4-201ENST00000267935 ABCC5O15440 1437 aa22.13■■□□□ 1.13
COMMD4-201ENST00000267935 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.13■■□□□ 1.13
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COMMD4-201ENST00000267935 PTPN23Q9H3S7 1636 aa22.06■■□□□ 1.12
COMMD4-201ENST00000267935 CEP152O94986 1710 aa22.06■■□□□ 1.12
COMMD4-201ENST00000267935 LRRC7Q96NW7 1537 aa22.05■■□□□ 1.12
COMMD4-201ENST00000267935 FGD6Q6ZV73 1430 aa22.05■■□□□ 1.12
COMMD4-201ENST00000267935 IDI1Q13907 227 aa22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-201ENST00000267935 UBR1Q8IWV7 1749 aa22.03■■□□□ 1.12
COMMD4-201ENST00000267935 TMEM2Q9UHN6 1383 aa22.02■■□□□ 1.12
COMMD4-201ENST00000267935 SLIT1O75093 1534 aa22.02■■□□□ 1.12
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COMMD4-201ENST00000267935 ARHGAP23Q9P227 1491 aa22.02■■□□□ 1.12
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COMMD4-201ENST00000267935 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
COMMD4-201ENST00000267935 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.01■■□□□ 1.11
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COMMD4-201ENST00000267935 SYNMO15061 1565 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-201ENST00000267935 KCNA6P17658 529 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-201ENST00000267935 CROCC2H7BZ55 1655 aa21.97■■□□□ 1.11
COMMD4-201ENST00000267935 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
COMMD4-201ENST00000267935 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
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COMMD4-201ENST00000267935 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa21.89■■□□□ 1.09
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COMMD4-201ENST00000267935 ADGRL2O95490 1459 aa21.88■■□□□ 1.09
COMMD4-201ENST00000267935 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
COMMD4-201ENST00000267935 FAM135BQ49AJ0 1406 aa21.88■■□□□ 1.09
COMMD4-201ENST00000267935 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP21.87■■□□□ 1.09
COMMD4-201ENST00000267935 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
COMMD4-201ENST00000267935 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP21.84■■□□□ 1.09
COMMD4-201ENST00000267935 CHGAP10645 457 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.09
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