RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 PZPP20742 1482 aa29.4■■■□□ 2.3
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UBE2B-201ENST00000265339 A2MP01023 1474 aa29.37■■■□□ 2.29
UBE2B-201ENST00000265339 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.36■■■□□ 2.29
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UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP28.79■■■□□ 2.2
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UBE2B-201ENST00000265339 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa28.56■■■□□ 2.16
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UBE2B-201ENST00000265339 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP28.52■■■□□ 2.16
UBE2B-201ENST00000265339 ADAMTSL3P82987 1691 aa28.52■■■□□ 2.16
UBE2B-201ENST00000265339 IFT172Q9UG01 1749 aa28.51■■■□□ 2.15
UBE2B-201ENST00000265339 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
UBE2B-201ENST00000265339 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.49■■■□□ 2.15
UBE2B-201ENST00000265339 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa28.48■■■□□ 2.15
UBE2B-201ENST00000265339 MYO5BQ9ULV0 1848 aa28.48■■■□□ 2.15
UBE2B-201ENST00000265339 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
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