RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264719.5

EFR3B-201, Transcript of EFR3 homolog B, humanhuman

TSL 5

Gene EFR3B, Length 1,980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3B-201ENST00000264719 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.13■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.12■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.12■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 KIF13AQ9H1H9 1805 aa23.12■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 KIF3BO15066 747 aa23.11■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 IQGAP3Q86VI3 1631 aa23.1■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 RICTORQ6R327 1708 aa23.09■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa23.08■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 A2MP01023 1474 aa23.08■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.08■■□□□ 1.29
EFR3B-201ENST00000264719 ABCA6Q8N139 1617 aa23.08■■□□□ 1.28
EFR3B-201ENST00000264719 YEATS2Q9ULM3 1422 aa23.05■■□□□ 1.28
EFR3B-201ENST00000264719 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.05■■□□□ 1.28
EFR3B-201ENST00000264719 DEPDC5O75140 1603 aa23.05■■□□□ 1.28
EFR3B-201ENST00000264719 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.02■■□□□ 1.28
EFR3B-201ENST00000264719 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
EFR3B-201ENST00000264719 PLA2R1Q13018 1463 aa23.02■■□□□ 1.28
EFR3B-201ENST00000264719 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa23.02■■□□□ 1.27
EFR3B-201ENST00000264719 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
EFR3B-201ENST00000264719 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
EFR3B-201ENST00000264719 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.97■■□□□ 1.27
EFR3B-201ENST00000264719 GGT6Q6P531 493 aa22.96■■□□□ 1.27
EFR3B-201ENST00000264719 KANK1Q14678 1352 aa22.96■■□□□ 1.27
EFR3B-201ENST00000264719 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.95■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 E9PCH4 1651 aa22.94■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 CCDC144AA2RUR9 1427 aa22.93■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.93■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.93■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.92■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 TET3O43151 1660 aa22.9■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 ATP10AO60312 1499 aa22.9■■□□□ 1.26
EFR3B-201ENST00000264719 TRHP20396 242 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 CEP152O94986 1710 aa22.86■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.86■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 RGL3Q3MIN7 710 aa22.85■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.85■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 PTPRTO14522 1441 aa22.84■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.84■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.83■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.83■■□□□ 1.25
EFR3B-201ENST00000264719 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.83■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 ABCC3O15438 1527 aa22.81■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 TRPM2O94759 1503 aa22.81■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.8■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 NPATQ14207 1427 aa22.79■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.79■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.79■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 CLTCL1P53675 1640 aa22.78■■□□□ 1.24
EFR3B-201ENST00000264719 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.76■■□□□ 1.23
EFR3B-201ENST00000264719 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.75■■□□□ 1.23
EFR3B-201ENST00000264719 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa22.74■■□□□ 1.23
EFR3B-201ENST00000264719 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.74■■□□□ 1.23
EFR3B-201ENST00000264719 REREQ9P2R6 1566 aa22.73■■□□□ 1.23
EFR3B-201ENST00000264719 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.73■■□□□ 1.23
EFR3B-201ENST00000264719 MLECQ14165 292 aa22.72■■□□□ 1.23
EFR3B-201ENST00000264719 AGLP35573 1532 aa22.7■■□□□ 1.22
EFR3B-201ENST00000264719 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.69■■□□□ 1.22
EFR3B-201ENST00000264719 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.68■■□□□ 1.22
EFR3B-201ENST00000264719 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
EFR3B-201ENST00000264719 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.66■■□□□ 1.22
EFR3B-201ENST00000264719 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
EFR3B-201ENST00000264719 NOS1P29475 1434 aa22.64■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.63■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.63■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.61■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 SYNMO15061 1565 aa22.61■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 CHGAP10645 457 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 MIER1Q8N108 512 aa22.61■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.61■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.61■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 MROH2AA6NES4 1674 aa22.6■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 USP47Q96K76 1375 aa22.6■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.58■■□□□ 1.21
EFR3B-201ENST00000264719 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 ADGRB3O60242 1522 aa22.57■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.56■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 KIF1BO60333 1816 aa22.55■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.55■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.55■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 IDI1Q13907 227 aa22.54■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 MADDQ8WXG6 1647 aa22.54■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 PREX1Q8TCU6 1659 aa22.54■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 PIK3C2BO00750 1634 aa22.53■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa22.52■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 ERVK-7P63135 1459 aa22.52■■□□□ 1.2
EFR3B-201ENST00000264719 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.5■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.49■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.47■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 MYOM2P54296 1465 aa22.47■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 ZMYM3Q14202 1370 aa22.47■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 IFT172Q9UG01 1749 aa22.46■■□□□ 1.19
EFR3B-201ENST00000264719 CCDC7Q96M83 1385 aa22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.9 ms