RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259239.7

IMP4-201, Transcript of IMP4, U3 small nucleolar ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene IMP4, Length 1,740 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP4-201ENST00000259239 DEPDC5O75140 1603 aa26.11■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.11■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.1■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.1■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.08■■□□□ 1.77
IMP4-201ENST00000259239 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.05■■□□□ 1.76
IMP4-201ENST00000259239 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.05■■□□□ 1.762e-7■■■□□ 17.7
IMP4-201ENST00000259239 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.04■■□□□ 1.76
IMP4-201ENST00000259239 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
IMP4-201ENST00000259239 FOXD1Q16676 465 aa26.03■■□□□ 1.76
IMP4-201ENST00000259239 KIF3BO15066 747 aa26.02■■□□□ 1.76
IMP4-201ENST00000259239 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
IMP4-201ENST00000259239 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.01■■□□□ 1.75
IMP4-201ENST00000259239 SIN3AQ96ST3 1273 aa26■■□□□ 1.75
IMP4-201ENST00000259239 PKD2Q13563 968 aa25.98■■□□□ 1.75
IMP4-201ENST00000259239 VWDEQ8N2E2 1590 aa25.97■■□□□ 1.75
IMP4-201ENST00000259239 ATP10AO60312 1499 aa25.97■■□□□ 1.75
IMP4-201ENST00000259239 REREQ9P2R6 1566 aa25.96■■□□□ 1.75
IMP4-201ENST00000259239 NEUROD1Q13562 356 aa25.95■■□□□ 1.74
IMP4-201ENST00000259239 CEP152O94986 1710 aa25.95■■□□□ 1.74
IMP4-201ENST00000259239 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa25.94■■□□□ 1.74
IMP4-201ENST00000259239 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa25.94■■□□□ 1.74
IMP4-201ENST00000259239 TET3O43151 1660 aa25.94■■□□□ 1.74
IMP4-201ENST00000259239 KANK1Q14678 1352 aa25.92■■□□□ 1.74
IMP4-201ENST00000259239 E9PCH4 1651 aa25.91■■□□□ 1.74
IMP4-201ENST00000259239 GGT6Q6P531 493 aa25.86■■□□□ 1.73
IMP4-201ENST00000259239 AGLP35573 1532 aa25.86■■□□□ 1.73
IMP4-201ENST00000259239 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.84■■□□□ 1.73
IMP4-201ENST00000259239 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.84■■□□□ 1.73
IMP4-201ENST00000259239 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
IMP4-201ENST00000259239 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.82■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 ABCC3O15438 1527 aa25.82■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 TONSLQ96HA7 1378 aa25.8■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa25.8■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 PLA2R1Q13018 1463 aa25.78■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.77■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa25.77■■□□□ 1.72
IMP4-201ENST00000259239 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa25.75■■□□□ 1.71
IMP4-201ENST00000259239 TRPM2O94759 1503 aa25.73■■□□□ 1.71
IMP4-201ENST00000259239 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.72■■□□□ 1.71
IMP4-201ENST00000259239 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.71■■□□□ 1.71
IMP4-201ENST00000259239 PTPRTO14522 1441 aa25.7■■□□□ 1.7
IMP4-201ENST00000259239 NPATQ14207 1427 aa25.69■■□□□ 1.7
IMP4-201ENST00000259239 CLTCL1P53675 1640 aa25.68■■□□□ 1.7
IMP4-201ENST00000259239 MLECQ14165 292 aa25.67■■□□□ 1.7
IMP4-201ENST00000259239 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
IMP4-201ENST00000259239 L3MBTL2Q969R5 705 aa25.64■■□□□ 1.7
IMP4-201ENST00000259239 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
IMP4-201ENST00000259239 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa25.63■■□□□ 1.69
IMP4-201ENST00000259239 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-201ENST00000259239 PPP6R1Q9UPN7 881 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-201ENST00000259239 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.62■■□□□ 1.69
IMP4-201ENST00000259239 KIF1BO60333 1816 aa25.6■■□□□ 1.69
IMP4-201ENST00000259239 CNTLNQ9NXG0 1405 aa25.57■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 SYNMO15061 1565 aa25.57■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 NOS1P29475 1434 aa25.56■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.54■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 MROH2AA6NES4 1674 aa25.54■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 PIK3C2BO00750 1634 aa25.53■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa25.53■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.68
IMP4-201ENST00000259239 RGL3Q3MIN7 710 aa25.5■■□□□ 1.67
IMP4-201ENST00000259239 ERVK-7P63135 1459 aa25.5■■□□□ 1.67
IMP4-201ENST00000259239 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.49■■□□□ 1.67
IMP4-201ENST00000259239 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa25.47■■□□□ 1.67
IMP4-201ENST00000259239 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
IMP4-201ENST00000259239 ADGRB3O60242 1522 aa25.46■■□□□ 1.67
IMP4-201ENST00000259239 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.46■■□□□ 1.67
IMP4-201ENST00000259239 NBPF8Q3BBV2 869 aa25.45■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 ZMYM3Q14202 1370 aa25.45■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 MYO5BQ9ULV0 1848 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 IFT172Q9UG01 1749 aa25.44■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.43■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 C3P01024 1663 aa25.42■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.42■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 MADDQ8WXG6 1647 aa25.41■■□□□ 1.66
IMP4-201ENST00000259239 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 PPLO60437 1756 aa25.38■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 SLC52A1Q9NWF4 448 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa25.37■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.36■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 IDI1Q13907 227 aa25.36■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP25.35■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.34■■□□□ 1.65
IMP4-201ENST00000259239 MYOM2P54296 1465 aa25.3■■□□□ 1.64
IMP4-201ENST00000259239 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.29■■□□□ 1.64
IMP4-201ENST00000259239 TNRQ92752 1358 aa25.29■■□□□ 1.64
IMP4-201ENST00000259239 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa25.28■■□□□ 1.64
IMP4-201ENST00000259239 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.25■■□□□ 1.63
IMP4-201ENST00000259239 STAC3Q96MF2 364 aa25.25■■□□□ 1.63
IMP4-201ENST00000259239 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-201ENST00000259239 UBR1Q8IWV7 1749 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-201ENST00000259239 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.23■■□□□ 1.63
IMP4-201ENST00000259239 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP25.23■■□□□ 1.63
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