RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 MBD5Q9P267 1494 aa28.27■■■□□ 2.12
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CSNK1G2-201ENST00000255641 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa28.26■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa28.25■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP28.24■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 KIF15Q9NS87 1388 aa28.24■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.23■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 BACH2Q9BYV9 841 aa28.23■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDM5CP41229 1560 aa28.23■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCA8O94911 1581 aa28.22■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP28.22■■■□□ 2.11
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CSNK1G2-201ENST00000255641 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP28.2■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 NUP155O75694 1391 aa28.2■■■□□ 2.11
CSNK1G2-201ENST00000255641 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP28.2■■■□□ 2.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 CRBNQ96SW2 442 aa28.19■■■□□ 2.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGL3Q3MIN7 710 aa28.19■■■□□ 2.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.17■■■□□ 2.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP28.14■■■□□ 2.1
CSNK1G2-201ENST00000255641 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.13■■■□□ 2.09
CSNK1G2-201ENST00000255641 RALBP1Q15311 655 aa28.11■■■□□ 2.09
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa28.1■■■□□ 2.09
CSNK1G2-201ENST00000255641 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP28.1■■■□□ 2.09
CSNK1G2-201ENST00000255641 BRPF3Q9ULD4 1205 aa28.09■■■□□ 2.09
CSNK1G2-201ENST00000255641 NLRP13Q86W25 1043 aa28.08■■■□□ 2.09
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
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CSNK1G2-201ENST00000255641 TSPY10P0CW01 314 aa28.07■■■□□ 2.08
CSNK1G2-201ENST00000255641 RALGAPBQ86X10 1494 aa28.06■■■□□ 2.08
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.05■■■□□ 2.08
CSNK1G2-201ENST00000255641 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa28.05■■■□□ 2.08
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa28.05■■■□□ 2.08
CSNK1G2-201ENST00000255641 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
CSNK1G2-201ENST00000255641 ITSN2Q9NZM3 1697 aa28.02■■■□□ 2.08
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADCY10Q96PN6 1610 aa27.99■■■□□ 2.07
CSNK1G2-201ENST00000255641 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP27.98■■■□□ 2.07
CSNK1G2-201ENST00000255641 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.98■■■□□ 2.07
CSNK1G2-201ENST00000255641 MS4A1P11836 297 aa27.98■■■□□ 2.07
CSNK1G2-201ENST00000255641 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP27.98■■■□□ 2.076e-7■■■□□ 15.2
CSNK1G2-201ENST00000255641 PANK3Q9H999 370 aa27.97■■■□□ 2.07
CSNK1G2-201ENST00000255641 C9orf84Q5VXU9 1444 aa27.96■■■□□ 2.07
CSNK1G2-201ENST00000255641 PARD3Q8TEW0 1356 aa27.95■■■□□ 2.07
CSNK1G2-201ENST00000255641 NFKBIBQ15653 356 aa27.95■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 RGS3P49796 1198 aa27.94■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.93■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMTS8Q9UP79 889 aa27.92■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 SHROOM2Q13796 1616 aa27.92■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 PDE3BQ13370 1112 aa27.91■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP27.89■■■□□ 2.06
CSNK1G2-201ENST00000255641 TTC37Q6PGP7 1564 aa27.88■■■□□ 2.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGAP5Q13017 1502 aa27.88■■■□□ 2.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 USP35Q9P2H5 1018 aa27.88■■■□□ 2.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.86■■■□□ 2.05
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CSNK1G2-201ENST00000255641 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa27.85■■■□□ 2.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 GSE1Q14687 1217 aa27.85■■■□□ 2.05
CSNK1G2-201ENST00000255641 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
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CSNK1G2-201ENST00000255641 SYCP2Q9BX26 1530 aa27.82■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 TESK2Q96S53 571 aa27.81■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CROCC2H7BZ55 1655 aa27.81■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLASP1Q7Z460 1538 aa27.81■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC146Q8IYE0 955 aa27.81■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.81■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa27.8■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 E9PCH4 1651 aa27.8■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDM2BQ8NHM5 1336 aa27.78■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 C8orf34Q49A92 452 aa27.78■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa27.77■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 PRAG1Q86YV5 1406 aa27.77■■■□□ 2.04
CSNK1G2-201ENST00000255641 AFAP1Q8N556 730 aa27.76■■■□□ 2.03
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CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC141Q6ZP82 1450 aa27.74■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.73■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 PREX2Q70Z35 1606 aa27.73■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.71■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP27.71■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM161AQ3B820 660 aa27.7■■■□□ 2.03
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP27.69■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCAR3O75815 825 aa27.69■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa27.69■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP27.68■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PPP2R1AP30153 589 aa27.67■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 ERBINQ96RT1 1412 aa27.67■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMF1P82094 1093 aa27.67■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP27.66■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 OSCARQ8IYS5 282 aa27.66■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 SHANK2Q9UPX8 1470 aa27.66■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 A2MP01023 1474 aa27.65■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 FAM135AQ9P2D6 1515 aa27.64■■■□□ 2.02
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLA2R1Q13018 1463 aa27.63■■■□□ 2.01
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa27.63■■■□□ 2.01
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