RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254301.13

LGALS3-201, Transcript of galectin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LGALS3, Length 1,146 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS3-201ENST00000254301 DUOX2Q9NRD8 1548 aa42.31■■■■■ 4.36
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LGALS3-201ENST00000254301 PREX1Q8TCU6 1659 aa42.29■■■■■ 4.36
LGALS3-201ENST00000254301 NPATQ14207 1427 aa42.29■■■■■ 4.36
LGALS3-201ENST00000254301 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP42.28■■■■■ 4.36
LGALS3-201ENST00000254301 KDM5DQ9BY66 1539 aa42.23■■■■■ 4.35
LGALS3-201ENST00000254301 FAM135AQ9P2D6 1515 aa42.23■■■■■ 4.35
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LGALS3-201ENST00000254301 PTPRKQ15262 1439 aa42.21■■■■■ 4.35
LGALS3-201ENST00000254301 NCOA1Q15788 1441 aa42.2■■■■■ 4.35
LGALS3-201ENST00000254301 ERBINQ96RT1 1412 aa42.2■■■■■ 4.35
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LGALS3-201ENST00000254301 ABCC3O15438 1527 aa42.06■■■■■ 4.32
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LGALS3-201ENST00000254301 ITGAEP38570 1179 aa42.03■■■■■ 4.32
LGALS3-201ENST00000254301 TNRQ92752 1358 aa42■■■■■ 4.31
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LGALS3-201ENST00000254301 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa41.97■■■■■ 4.31
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LGALS3-201ENST00000254301 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.96■■■■■ 4.31
LGALS3-201ENST00000254301 ROCK1Q13464 1354 aa41.96■■■■■ 4.31
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LGALS3-201ENST00000254301 CEP152O94986 1710 aa41.88■■■■■ 4.29
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LGALS3-201ENST00000254301 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP41.86■■■■■ 4.29
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LGALS3-201ENST00000254301 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa41.84■■■■■ 4.29
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LGALS3-201ENST00000254301 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.79■■■■■ 4.28
LGALS3-201ENST00000254301 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.78■■■■■ 4.28
LGALS3-201ENST00000254301 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa41.77■■■■■ 4.28
LGALS3-201ENST00000254301 PLA2R1Q13018 1463 aa41.76■■■■■ 4.28
LGALS3-201ENST00000254301 PTPRTO14522 1441 aa41.76■■■■■ 4.28
LGALS3-201ENST00000254301 PKD2Q13563 968 aa41.75■■■■■ 4.27
LGALS3-201ENST00000254301 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP41.72■■■■■ 4.27
LGALS3-201ENST00000254301 UGGT1Q9NYU2 1555 aa41.67■■■■■ 4.26
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LGALS3-201ENST00000254301 UNC13BO14795 1591 aa41.61■■■■■ 4.25
LGALS3-201ENST00000254301 ANKLE2Q86XL3 938 aa41.59■■■■■ 4.25
LGALS3-201ENST00000254301 NUP155O75694 1391 aa41.57■■■■■ 4.25
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LGALS3-201ENST00000254301 TET3O43151 1660 aa41.5■■■■■ 4.23
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LGALS3-201ENST00000254301 SLC52A1Q9NWF4 448 aa41.46■■■■■ 4.23
LGALS3-201ENST00000254301 IQGAP3Q86VI3 1631 aa41.45■■■■■ 4.23
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LGALS3-201ENST00000254301 HFM1A2PYH4 1435 aa41.44■■■■■ 4.22
LGALS3-201ENST00000254301 UBR1Q8IWV7 1749 aa41.42■■■■■ 4.22
LGALS3-201ENST00000254301 FBXO41Q8TF61 875 aa41.42■■■■■ 4.22
LGALS3-201ENST00000254301 GCC2Q8IWJ2 1684 aa41.4■■■■■ 4.22
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LGALS3-201ENST00000254301 SLIT1O75093 1534 aa41.32■■■■■ 4.2
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LGALS3-201ENST00000254301 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa41.1■■■■■ 4.17
LGALS3-201ENST00000254301 CPS1P31327 1500 aa41.05■■■■■ 4.16
LGALS3-201ENST00000254301 RIMS2Q9UQ26 1411 aa41.05■■■■■ 4.16
LGALS3-201ENST00000254301 ZFYVE9O95405 1425 aa41.03■■■■■ 4.16
LGALS3-201ENST00000254301 SETD5Q9C0A6 1442 aa41.02■■■■■ 4.16
LGALS3-201ENST00000254301 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.02■■■■■ 4.16
LGALS3-201ENST00000254301 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
LGALS3-201ENST00000254301 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP41.02■■■■■ 4.16
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