RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP28.01■■■□□ 2.07
VGF-201ENST00000249330 ERBINQ96RT1 1412 aa28.01■■■□□ 2.07
VGF-201ENST00000249330 TEX14Q8IWB6 1497 aa27.99■■■□□ 2.07
VGF-201ENST00000249330 UNC13BO14795 1591 aa27.97■■■□□ 2.07
VGF-201ENST00000249330 ATP7AQ04656 1500 aa27.97■■■□□ 2.07
VGF-201ENST00000249330 NBPF8Q3BBV2 869 aa27.97■■■□□ 2.07
VGF-201ENST00000249330 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP27.94■■■□□ 2.06
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VGF-201ENST00000249330 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa27.9■■■□□ 2.06
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VGF-201ENST00000249330 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa27.86■■■□□ 2.05
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VGF-201ENST00000249330 PLA2R1Q13018 1463 aa27.85■■■□□ 2.05
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VGF-201ENST00000249330 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa27.81■■■□□ 2.04
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VGF-201ENST00000249330 CCDC144AA2RUR9 1427 aa27.8■■■□□ 2.04
VGF-201ENST00000249330 RGL3Q3MIN7 710 aa27.78■■■□□ 2.04
VGF-201ENST00000249330 KDM5CP41229 1560 aa27.78■■■□□ 2.04
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VGF-201ENST00000249330 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP27.77■■■□□ 2.04
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VGF-201ENST00000249330 DEPDC5O75140 1603 aa27.73■■■□□ 2.03
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VGF-201ENST00000249330 KANK1Q14678 1352 aa27.7■■■□□ 2.03
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VGF-201ENST00000249330 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.64■■■□□ 2.02
VGF-201ENST00000249330 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP27.63■■■□□ 2.01
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VGF-201ENST00000249330 CEP152O94986 1710 aa27.51■■■□□ 2
VGF-201ENST00000249330 NBPF1Q3BBV0 1214 aa27.51■■□□□ 1.99
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VGF-201ENST00000249330 EFCAB6Q5THR3 1501 aa27.5■■□□□ 1.99
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VGF-201ENST00000249330 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP27.49■■□□□ 1.99
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VGF-201ENST00000249330 CCDC184Q52MB2 194 aa27.43■■□□□ 1.98
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VGF-201ENST00000249330 BCORL1Q5H9F3 1711 aa27.42■■□□□ 1.98
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VGF-201ENST00000249330 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa27.41■■□□□ 1.98
VGF-201ENST00000249330 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa27.4■■□□□ 1.98
VGF-201ENST00000249330 POLR3GLQ9BT43 218 aa27.4■■□□□ 1.98
VGF-201ENST00000249330 ZBED9Q6R2W3 1325 aa27.39■■□□□ 1.97
VGF-201ENST00000249330 FAM9BQ8IZU0 186 aa27.39■■□□□ 1.97
VGF-201ENST00000249330 MRS2Q9HD23 443 aa27.39■■□□□ 1.97
VGF-201ENST00000249330 CHGAP10645 457 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
VGF-201ENST00000249330 GPRASP1Q5JY77 1395 aa27.31■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.31■■□□□ 1.96
VGF-201ENST00000249330 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa27.29■■□□□ 1.96
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