RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 PPP6R1Q9UPN7 881 aa32.62■■■□□ 2.81
CITED1-201ENST00000246139 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP32.6■■■□□ 2.81
CITED1-201ENST00000246139 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP32.56■■■□□ 2.8
CITED1-201ENST00000246139 PLA2R1Q13018 1463 aa32.5■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP32.5■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP32.49■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 MAST1Q9Y2H9 1570 aa32.49■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 PTPN23Q9H3S7 1636 aa32.48■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 FGD6Q6ZV73 1430 aa32.48■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa32.47■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP32.46■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 IQSEC2Q5JU85 1478 aa32.46■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 PKD2Q13563 968 aa32.45■■■□□ 2.79
CITED1-201ENST00000246139 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP32.44■■■□□ 2.78
CITED1-201ENST00000246139 A2ML1A8K2U0 1454 aa32.42■■■□□ 2.78
CITED1-201ENST00000246139 ABCC5O15440 1437 aa32.41■■■□□ 2.78
CITED1-201ENST00000246139 DISP3Q9P2K9 1392 aa32.39■■■□□ 2.78
CITED1-201ENST00000246139 KDM5DQ9BY66 1539 aa32.37■■■□□ 2.77
CITED1-201ENST00000246139 ILDR2Q71H61 639 aa32.37■■■□□ 2.77
CITED1-201ENST00000246139 DAPK1P53355 1430 aa32.36■■■□□ 2.77
CITED1-201ENST00000246139 TNRQ92752 1358 aa32.36■■■□□ 2.77
CITED1-201ENST00000246139 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa32.36■■■□□ 2.77
CITED1-201ENST00000246139 PZPP20742 1482 aa32.35■■■□□ 2.77
CITED1-201ENST00000246139 SHANK2Q9UPX8 1470 aa32.35■■■□□ 2.77
CITED1-201ENST00000246139 CROCC2H7BZ55 1655 aa32.31■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 CHIC2Q9UKJ5 165 aa32.31■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 KIF15Q9NS87 1388 aa32.31■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 FAM135AQ9P2D6 1515 aa32.31■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP32.3■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 NEURL4Q96JN8 1562 aa32.3■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 DUOX2Q9NRD8 1548 aa32.29■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP32.28■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 UBAP1LF5GYI3 381 aa32.27■■■□□ 2.76
CITED1-201ENST00000246139 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP32.26■■■□□ 2.75
CITED1-201ENST00000246139 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP32.25■■■□□ 2.75
CITED1-201ENST00000246139 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa32.24■■■□□ 2.75
CITED1-201ENST00000246139 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP32.23■■■□□ 2.75
CITED1-201ENST00000246139 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP32.23■■■□□ 2.75
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa32.22■■■□□ 2.75
CITED1-201ENST00000246139 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP32.21■■■□□ 2.75
CITED1-201ENST00000246139 ERBINQ96RT1 1412 aa32.19■■■□□ 2.74
CITED1-201ENST00000246139 ABCC3O15438 1527 aa32.19■■■□□ 2.74
CITED1-201ENST00000246139 NLRP1Q9C000 1473 aa32.17■■■□□ 2.74
CITED1-201ENST00000246139 MROH1Q8NDA8 1641 aa32.17■■■□□ 2.74
CITED1-201ENST00000246139 UGGT1Q9NYU2 1555 aa32.16■■■□□ 2.74
CITED1-201ENST00000246139 ANKLE2Q86XL3 938 aa32.15■■■□□ 2.74
CITED1-201ENST00000246139 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP32.14■■■□□ 2.74
CITED1-201ENST00000246139 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP32.12■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP32.11■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 VWDEQ8N2E2 1590 aa32.11■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 CEP152O94986 1710 aa32.11■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 ADGRL2O95490 1459 aa32.1■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 KANK1Q14678 1352 aa32.09■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 DEPDC5O75140 1603 aa32.09■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 CPS1P31327 1500 aa32.09■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 MED14O60244 1454 aa32.09■■■□□ 2.73
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CITED1-201ENST00000246139 ERVK-7P63135 1459 aa32.08■■■□□ 2.73
CITED1-201ENST00000246139 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP32.08■■■□□ 2.73
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CITED1-201ENST00000246139 HSPA1LP34931 641 aa32■■■□□ 2.71
CITED1-201ENST00000246139 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP32■■■□□ 2.71
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CITED1-201ENST00000246139 UBR1Q8IWV7 1749 aa31.98■■■□□ 2.71
CITED1-201ENST00000246139 ALKQ9UM73 1620 aa31.98■■■□□ 2.71
CITED1-201ENST00000246139 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa31.98■■■□□ 2.71
CITED1-201ENST00000246139 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa31.97■■■□□ 2.71
CITED1-201ENST00000246139 TOM1O60784 492 aa31.95■■■□□ 2.71
CITED1-201ENST00000246139 ROCK1Q13464 1354 aa31.93■■■□□ 2.7
CITED1-201ENST00000246139 LMTK2Q8IWU2 1503 aa31.9■■■□□ 2.7
CITED1-201ENST00000246139 LTKP29376 864 aa31.89■■■□□ 2.7
CITED1-201ENST00000246139 STAG3Q9UJ98 1225 aa31.88■■■□□ 2.69
CITED1-201ENST00000246139 LRRC7Q96NW7 1537 aa31.88■■■□□ 2.69
CITED1-201ENST00000246139 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
CITED1-201ENST00000246139 ARHGAP23Q9P227 1491 aa31.85■■■□□ 2.69
CITED1-201ENST00000246139 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP31.84■■■□□ 2.69
CITED1-201ENST00000246139 SLIT1O75093 1534 aa31.84■■■□□ 2.69
CITED1-201ENST00000246139 PIK3C2BO00750 1634 aa31.82■■■□□ 2.69
CITED1-201ENST00000246139 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
CITED1-201ENST00000246139 TXNDC2Q86VQ3 553 aa31.81■■■□□ 2.68
CITED1-201ENST00000246139 IDI1Q13907 227 aa31.8■■■□□ 2.68
CITED1-201ENST00000246139 SYNMO15061 1565 aa31.78■■■□□ 2.68
CITED1-201ENST00000246139 EID1Q9Y6B2 187 aa31.78■■■□□ 2.68
CITED1-201ENST00000246139 EFCAB6Q5THR3 1501 aa31.78■■■□□ 2.68
CITED1-201ENST00000246139 UNC13BO14795 1591 aa31.74■■■□□ 2.67
CITED1-201ENST00000246139 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP31.74■■■□□ 2.67
CITED1-201ENST00000246139 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP31.74■■■□□ 2.67
CITED1-201ENST00000246139 SLC52A1Q9NWF4 448 aa31.73■■■□□ 2.67
CITED1-201ENST00000246139 TMEM2Q9UHN6 1383 aa31.72■■■□□ 2.67
CITED1-201ENST00000246139 NOS1P29475 1434 aa31.72■■■□□ 2.67
CITED1-201ENST00000246139 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP31.69■■■□□ 2.66
CITED1-201ENST00000246139 TET3O43151 1660 aa31.68■■■□□ 2.66
CITED1-201ENST00000246139 NUP155O75694 1391 aa31.68■■■□□ 2.66
CITED1-201ENST00000246139 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP31.65■■■□□ 2.66
CITED1-201ENST00000246139 IQGAP3Q86VI3 1631 aa31.62■■■□□ 2.65
CITED1-201ENST00000246139 GCC2Q8IWJ2 1684 aa31.62■■■□□ 2.65
CITED1-201ENST00000246139 CHGAP10645 457 aaKnown RBP31.6■■■□□ 2.65
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