RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000245451.8

BMP4-201, Transcript of bone morphogenetic protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene BMP4, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BMP4-201ENST00000245451 NUP155O75694 1391 aa24.16■■□□□ 1.46
BMP4-201ENST00000245451 DEPDC5O75140 1603 aa24.12■■□□□ 1.45
BMP4-201ENST00000245451 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
BMP4-201ENST00000245451 KIF3BO15066 747 aa24.1■■□□□ 1.45
BMP4-201ENST00000245451 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.09■■□□□ 1.45
BMP4-201ENST00000245451 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa24.08■■□□□ 1.45
BMP4-201ENST00000245451 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.08■■□□□ 1.454e-9■■□□□ 14.1
BMP4-201ENST00000245451 IQGAP3Q86VI3 1631 aa24.08■■□□□ 1.45
BMP4-201ENST00000245451 BCORL1Q5H9F3 1711 aa24.08■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 ATP10AO60312 1499 aa24.07■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.07■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 REREQ9P2R6 1566 aa24.05■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 FOXD1Q16676 465 aa24.04■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.03■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 PKD2Q13563 968 aa24.02■■□□□ 1.44
BMP4-201ENST00000245451 SIN3AQ96ST3 1273 aa23.98■■□□□ 1.43
BMP4-201ENST00000245451 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa23.98■■□□□ 1.43
BMP4-201ENST00000245451 KANK1Q14678 1352 aa23.98■■□□□ 1.43
BMP4-201ENST00000245451 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa23.98■■□□□ 1.43
BMP4-201ENST00000245451 AGLP35573 1532 aa23.97■■□□□ 1.43
BMP4-201ENST00000245451 GGT6Q6P531 493 aa23.95■■□□□ 1.42
BMP4-201ENST00000245451 TET3O43151 1660 aa23.93■■□□□ 1.42
BMP4-201ENST00000245451 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.92■■□□□ 1.42
BMP4-201ENST00000245451 NEUROD1Q13562 356 aa23.92■■□□□ 1.42
BMP4-201ENST00000245451 CEP152O94986 1710 aa23.9■■□□□ 1.42
BMP4-201ENST00000245451 E9PCH4 1651 aa23.9■■□□□ 1.42
BMP4-201ENST00000245451 ABCC3O15438 1527 aa23.89■■□□□ 1.42
BMP4-201ENST00000245451 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.88■■□□□ 1.41
BMP4-201ENST00000245451 PLA2R1Q13018 1463 aa23.86■■□□□ 1.41
BMP4-201ENST00000245451 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.86■■□□□ 1.41
BMP4-201ENST00000245451 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
BMP4-201ENST00000245451 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP23.85■■□□□ 1.41
BMP4-201ENST00000245451 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa23.82■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 NPATQ14207 1427 aa23.8■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 PTPRTO14522 1441 aa23.79■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa23.79■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP23.79■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 MLECQ14165 292 aa23.78■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 PPP6R1Q9UPN7 881 aa23.78■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 TONSLQ96HA7 1378 aa23.78■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa23.78■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 TRPM2O94759 1503 aa23.77■■□□□ 1.4
BMP4-201ENST00000245451 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.76■■□□□ 1.39
BMP4-201ENST00000245451 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.75■■□□□ 1.39
BMP4-201ENST00000245451 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP23.73■■□□□ 1.39
BMP4-201ENST00000245451 CLTCL1P53675 1640 aa23.69■■□□□ 1.38
BMP4-201ENST00000245451 NOS1P29475 1434 aa23.68■■□□□ 1.38
BMP4-201ENST00000245451 L3MBTL2Q969R5 705 aa23.68■■□□□ 1.38
BMP4-201ENST00000245451 CNTLNQ9NXG0 1405 aa23.68■■□□□ 1.38
BMP4-201ENST00000245451 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.67■■□□□ 1.38
BMP4-201ENST00000245451 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
BMP4-201ENST00000245451 SYNMO15061 1565 aa23.64■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 PREX1Q8TCU6 1659 aa23.64■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.62■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 ZMYM3Q14202 1370 aa23.61■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 ERVK-7P63135 1459 aa23.61■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 MROH2AA6NES4 1674 aa23.6■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 PIK3C2BO00750 1634 aa23.59■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa23.58■■□□□ 1.37
BMP4-201ENST00000245451 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa23.58■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 RGL3Q3MIN7 710 aa23.57■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.56■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 ADGRB3O60242 1522 aa23.53■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 KIF1BO60333 1816 aa23.53■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 MADDQ8WXG6 1647 aa23.53■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.52■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 SLC52A1Q9NWF4 448 aa23.52■■□□□ 1.36
BMP4-201ENST00000245451 ADAMTSL3P82987 1691 aa23.51■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 IDI1Q13907 227 aa23.51■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.5■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 C3P01024 1663 aa23.5■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.49■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.47■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.35
BMP4-201ENST00000245451 TNRQ92752 1358 aa23.44■■□□□ 1.34
BMP4-201ENST00000245451 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
BMP4-201ENST00000245451 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa23.44■■□□□ 1.34
BMP4-201ENST00000245451 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.43■■□□□ 1.34
BMP4-201ENST00000245451 IFT172Q9UG01 1749 aa23.42■■□□□ 1.34
BMP4-201ENST00000245451 MYOM2P54296 1465 aa23.39■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 MYO5BQ9ULV0 1848 aa23.38■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 STAC3Q96MF2 364 aa23.38■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 RALGAPBQ86X10 1494 aa23.38■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.37■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 PPLO60437 1756 aa23.37■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa23.37■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa23.36■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 A2ML1A8K2U0 1454 aa23.36■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa23.35■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 NLRP1Q9C000 1473 aa23.35■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 NRXN1Q9ULB1 1477 aa23.34■■□□□ 1.33
BMP4-201ENST00000245451 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.33■■□□□ 1.32
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