RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000229390.7

SRSF9-201, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 9, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SRSF9, Length 1,201 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9-201ENST00000229390 MYO3AQ8NEV4 1616 aa41.06■■■■■ 4.16
SRSF9-201ENST00000229390 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
SRSF9-201ENST00000229390 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP41.02■■■■■ 4.16
SRSF9-201ENST00000229390 DAPK1P53355 1430 aa41.01■■■■■ 4.16
SRSF9-201ENST00000229390 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa41.01■■■■■ 4.16
SRSF9-201ENST00000229390 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP41■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 SHANK2Q9UPX8 1470 aa40.99■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP40.99■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 DUOX2Q9NRD8 1548 aa40.98■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 FAM135AQ9P2D6 1515 aa40.98■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP40.98■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 CHIC2Q9UKJ5 165 aa40.98■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 KIF15Q9NS87 1388 aa40.98■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 FBXO41Q8TF61 875 aa40.97■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP40.97■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 NCOA1Q15788 1441 aa40.96■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP40.95■■■■■ 4.15
SRSF9-201ENST00000229390 PZPP20742 1482 aa40.94■■■■■ 4.14
SRSF9-201ENST00000229390 TNRQ92752 1358 aa40.91■■■■■ 4.14
SRSF9-201ENST00000229390 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa40.9■■■■■ 4.14
SRSF9-201ENST00000229390 CERKQ8TCT0 537 aa40.89■■■■■ 4.14
SRSF9-201ENST00000229390 PTPRTO14522 1441 aa40.89■■■■■ 4.14
SRSF9-201ENST00000229390 ABCC3O15438 1527 aa40.88■■■■■ 4.13
SRSF9-201ENST00000229390 MROH1Q8NDA8 1641 aa40.86■■■■■ 4.13
SRSF9-201ENST00000229390 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
SRSF9-201ENST00000229390 A2ML1A8K2U0 1454 aa40.85■■■■■ 4.13
SRSF9-201ENST00000229390 CEP152O94986 1710 aa40.84■■■■■ 4.13
SRSF9-201ENST00000229390 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP40.84■■■■■ 4.13
SRSF9-201ENST00000229390 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa40.83■■■■■ 4.13
SRSF9-201ENST00000229390 ERBINQ96RT1 1412 aa40.82■■■■■ 4.12
SRSF9-201ENST00000229390 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP40.81■■■■■ 4.121e-9■□□□□ 9.9
SRSF9-201ENST00000229390 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.8■■■■■ 4.12
SRSF9-201ENST00000229390 PLA2R1Q13018 1463 aa40.77■■■■■ 4.12
SRSF9-201ENST00000229390 PKD2Q13563 968 aa40.75■■■■■ 4.11
SRSF9-201ENST00000229390 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP40.71■■■■■ 4.11
SRSF9-201ENST00000229390 NLRP1Q9C000 1473 aa40.68■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 DEPDC5O75140 1603 aa40.67■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 ADGRL2O95490 1459 aa40.66■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 ERVK-7P63135 1459 aa40.66■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 KANK1Q14678 1352 aa40.66■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa40.65■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP40.64■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.64■■■■■ 4.1
SRSF9-201ENST00000229390 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP40.63■■■■■ 4.12e-19■□□□□ 8.9
SRSF9-201ENST00000229390 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.6■■■■■ 4.09
SRSF9-201ENST00000229390 LTBP4Q8N2S1 1624 aa40.6■■■■■ 4.09
SRSF9-201ENST00000229390 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP40.57■■■■■ 4.08
SRSF9-201ENST00000229390 ITGAEP38570 1179 aa40.55■■■■■ 4.08
SRSF9-201ENST00000229390 ANKLE2Q86XL3 938 aa40.55■■■■■ 4.08
SRSF9-201ENST00000229390 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.54■■■■■ 4.08
SRSF9-201ENST00000229390 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa40.53■■■■■ 4.08
SRSF9-201ENST00000229390 NEURL4Q96JN8 1562 aa40.5■■■■■ 4.07
SRSF9-201ENST00000229390 VWDEQ8N2E2 1590 aa40.48■■■■■ 4.07
SRSF9-201ENST00000229390 LMTK2Q8IWU2 1503 aa40.45■■■■■ 4.07
SRSF9-201ENST00000229390 UBR1Q8IWV7 1749 aa40.44■■■■■ 4.06
SRSF9-201ENST00000229390 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP40.38■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 EFCAB6Q5THR3 1501 aa40.37■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 ROCK1Q13464 1354 aa40.37■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 PIK3C2BO00750 1634 aa40.35■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 STAG3Q9UJ98 1225 aa40.35■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 MED14O60244 1454 aa40.32■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 IQSEC2Q5JU85 1478 aa40.32■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 IQGAP1P46940 1657 aa40.32■■■■■ 4.05
SRSF9-201ENST00000229390 SYNMO15061 1565 aa40.29■■■■■ 4.04
SRSF9-201ENST00000229390 IDI1Q13907 227 aa40.29■■■■■ 4.04
SRSF9-201ENST00000229390 UNC13BO14795 1591 aa40.27■■■■■ 4.04
SRSF9-201ENST00000229390 TXNDC2Q86VQ3 553 aa40.26■■■■■ 4.04
SRSF9-201ENST00000229390 TET3O43151 1660 aa40.25■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 LTKP29376 864 aa40.25■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 NOS1P29475 1434 aa40.25■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP40.23■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 EID1Q9Y6B2 187 aa40.22■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 SLIT1O75093 1534 aa40.21■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 ARHGAP23Q9P227 1491 aa40.21■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 GCC2Q8IWJ2 1684 aa40.21■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP40.2■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 UBAP1LF5GYI3 381 aa40.2■■■■■ 4.03
SRSF9-201ENST00000229390 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP40.19■■■■■ 4.02
SRSF9-201ENST00000229390 CPS1P31327 1500 aa40.17■■■■■ 4.02
SRSF9-201ENST00000229390 TMEM2Q9UHN6 1383 aa40.16■■■■■ 4.02
SRSF9-201ENST00000229390 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.16■■■■■ 4.02
SRSF9-201ENST00000229390 NUP155O75694 1391 aa40.15■■■■■ 4.02
SRSF9-201ENST00000229390 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP40.15■■■■■ 4.02
SRSF9-201ENST00000229390 IQGAP3Q86VI3 1631 aa40.13■■■■■ 4.02
SRSF9-201ENST00000229390 E9PCH4 1651 aa40.12■■■■■ 4.01
SRSF9-201ENST00000229390 ADGRB3O60242 1522 aa40.11■■■■■ 4.01
SRSF9-201ENST00000229390 STRCP1A6NGW2 1772 aa40.08■■■■■ 4.01
SRSF9-201ENST00000229390 MYO5BQ9ULV0 1848 aa40.05■■■■■ 4
SRSF9-201ENST00000229390 CHGAP10645 457 aaKnown RBP40.02■■■■■ 4
SRSF9-201ENST00000229390 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP40■■■■□ 3.99
SRSF9-201ENST00000229390 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP40■■■■□ 3.99
SRSF9-201ENST00000229390 BCANQ96GW7 911 aa39.98■■■■□ 3.99
SRSF9-201ENST00000229390 PIP4K2BP78356 416 aa39.96■■■■□ 3.99
SRSF9-201ENST00000229390 TOM1O60784 492 aa39.95■■■■□ 3.99
SRSF9-201ENST00000229390 NAIPQ13075 1403 aa39.95■■■■□ 3.99
SRSF9-201ENST00000229390 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa39.94■■■■□ 3.99
SRSF9-201ENST00000229390 SLC26A8Q96RN1 970 aa39.94■■■■□ 3.98
SRSF9-201ENST00000229390 LRRC7Q96NW7 1537 aa39.94■■■■□ 3.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms