RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 PLA2R1Q13018 1463 aa26.3■■□□□ 1.8
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SIKE1-201ENST00000060969 IFT172Q9UG01 1749 aa25.7■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 ADGRB3O60242 1522 aa25.7■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 CHGAP10645 457 aaKnown RBP25.69■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 TESK2Q96S53 571 aa25.69■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP25.69■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa25.68■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 STAC3Q96MF2 364 aa25.68■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 IQGAP1P46940 1657 aa25.67■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.67■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 MYOM2P54296 1465 aa25.67■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 DISP3Q9P2K9 1392 aa25.66■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.66■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 NOS1P29475 1434 aa25.66■■□□□ 1.7
SIKE1-201ENST00000060969 SYNMO15061 1565 aa25.65■■□□□ 1.7
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