RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000061239.13

Sh3bp1-202, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Asxl1P59598 1514 aa24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ppip5k1A2ARP1 1436 aa24.96■■□□□ 1.59
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rundc1Q0VDN7 615 aa24.94■■□□□ 1.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdk13Q69ZA1 1511 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Card11Q8CIS0 1159 aa24.92■■□□□ 1.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Prdm16A2A935 1275 aa24.91■■□□□ 1.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sart1Q9Z315 806 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Robo2Q7TPD3 1470 aa24.89■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cd109Q8R422 1442 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rrp7aQ9D1C9 280 aaKnown RBP24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mrs2Q5NCE8 434 aa24.88■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cdc42bpbQ7TT50 1713 aa24.87■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gapvd1Q6PAR5 1458 aa24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PnisrA2AJT4 805 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp10dQ8K2X1 1416 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AI481877A2ALV5 1481 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp7aQ64430 1491 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Setd1aE9PYH6 1716 aa24.85■■□□□ 1.57
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc4a2P13808 1237 aaKnown RBP24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Exoc6Q8R313 802 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa24.82■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Igf1rQ60751 1373 aa24.81■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 NrdcQ8BHG1 1161 aa24.8■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abca17E9PX95 1733 aa24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep170Q6A065 1588 aa24.79■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Washc2Q6PGL7 1334 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tarbp1E9Q368 1579 aa24.78■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Spag9Q58A65 1321 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 SafbD3YXK2 937 aaKnown RBP24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Calr4Q3TQS0 420 aa24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kidins220E9Q9B7 1793 aa24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wwc2Q6NXJ0 1187 aa24.76■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Grwd1Q810D6 446 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Gm38655A0A286YDK6 273 aa24.74■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nsd2Q8BVE8 1365 aa24.73■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Slc24a1Q91WD8 1130 aa24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP24.71■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ShprhQ7TPQ3 1674 aa24.7■■□□□ 1.55
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kdm5cP41230 1554 aa24.7■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tubgcp6G5E8P0 1769 aa24.7■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Adamts13Q769J6 1426 aa24.69■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pde4cQ3UEI1 686 aa24.67■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zfyve16Q80U44 1528 aa24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zmym4A2A791 1549 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anp32aO35381 247 aa24.65■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Xrn1P97789 1719 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.54
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf608Q56A10 1511 aa24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myt1Q8CFC2 1127 aa24.63■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ythdc2B2RR83 1445 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa24.61■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Map3k5O35099 1380 aa24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ylpm1Q9R0I7 1386 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Uggt2E9Q4X2 1504 aa24.58■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tulp4Q9JIL5 1547 aa24.58■■□□□ 1.53
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Nos1Q9Z0J4 1429 aa24.58■■□□□ 1.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 AnkarA2RT91 1465 aa24.57■■□□□ 1.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abca9Q8K449 1623 aa24.57■■□□□ 1.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Myo5cE9Q1F5 1742 aa24.56■■□□□ 1.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ifnlr1Q8CGK5 535 aa24.54■■□□□ 1.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PtprtQ99M80 1454 aa24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Sbno1Q689Z5 1390 aa24.52■■□□□ 1.52
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ifit1bl1D3Z6F0 470 aa24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abcc6Q9R1S7 1498 aa24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Znf518aB2RRF6 1478 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pola1P33609 1465 aa24.5■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Mroh3A0A1D5RM54 893 aa24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pelp1Q9DBD5 1123 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fndc1E9Q043 1732 aa24.48■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Plch2A2AP18 1501 aa24.46■■□□□ 1.51
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ofd1Q80Z25 1017 aa24.45■■□□□ 1.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Eif5bQ05D44 1216 aaKnown RBP24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Topbp1Q6ZQF0 1515 aa24.43■■□□□ 1.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP24.42■■□□□ 1.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 PrxO55103 1391 aa24.42■■□□□ 1.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Lemd3Q9WU40 921 aa24.41■■□□□ 1.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Iqgap3F8VQ29 1632 aa24.4■■□□□ 1.5
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Fam71e1A1L3C1 212 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Zscan21Q07231 555 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abca6Q8K441 1624 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Abca8aQ8K442 1620 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa24.38■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Depdc5P61460 1591 aa24.37■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tex14Q7M6U3 1450 aa24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Arid3cA6PWV5 409 aa24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa24.36■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Wdr43Q6ZQL4 677 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Ttc21bQ0HA38 1315 aa24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Tmf1B9EKI3 1091 aa24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Kif3bQ61771 747 aa24.35■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Trpm1Q2TV84 1622 aa24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Pank3Q8R2W9 370 aa24.34■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Stard8Q8K031 1019 aa24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 ErbinQ80TH2 1402 aa24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Atp10aO54827 1508 aa24.33■■□□□ 1.49
Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 Srcin1Q9QWI6 1250 aa24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 15.7 ms