RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636616.1

EFHC1-223, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 5

Gene EFHC1, Length 1,636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-223	ENST00000636616	SLIT1	O75093	1534 aa		5.94	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CLTCL1	P53675	1640 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CEP170B	Q9Y4F5	1589 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	AQP7	O14520	342 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SNX2	O60749	519 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ADAMTS4	O75173	837 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	HRG	P04196	525 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CD8B	P10966	210 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ITGA4	P13612	1032 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	GUCY1A3	Q02108	690 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	LLGL1	Q15334	1064 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	POMZP3	Q6PJE2	187 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	NFXL1	Q6ZNB6	911 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	OTOP3	Q7RTS5	596 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TMPRSS7	Q7RTY8	843 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRNP27	Q8WVK2	155 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SLC5A5	Q92911	643 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC138	Q96M89	665 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	WDR12	Q9GZL7	423 aa	Known RBP	5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	INVS	Q9Y283	1065 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ZKSCAN5	Q9Y2L8	839 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	FHOD1	Q9Y613	1164 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ADGRB3	O60242	1522 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	MYO3A	Q8NEV4	1616 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	UBR1	Q8IWV7	1749 aa		5.93	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	KLHL33	A6NCF5	533 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TLR5	O60602	858 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	OFD1	O75665	1012 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	WNT11	O96014	354 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ESR1	P03372	595 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SCG5	P05408	212 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CKM	P06732	381 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	AKAP5	P24588	427 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CHKA	P35790	457 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	KCNJ6	P48051	423 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	MECP2	P51608	486 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	OCRL	Q01968	901 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ATAT1	Q5SQI0	421 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	FLCN	Q8NFG4	579 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TCTN2	Q96GX1	697 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TBATA	Q96M53	351 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	DUSP13	Q9UII6	198 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	COQ6	Q9Y2Z9	468 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ARVCF	O00192	962 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	MEIS1	O00470	390 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	HOXC12	P31275	282 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR3	P46089	330 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SCAND1	P57086	179 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	IKZF1	Q13422	519 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	DDB1	Q16531	1140 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	BROX	Q5VW32	411 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	MCTP1	Q6DN14	999 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CFAP161	Q6P656	301 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	PDXDC1	Q6P996	788 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CREG2	Q8IUH2	290 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	USHBP1	Q8N6Y0	703 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SPATA5	Q8NB90	893 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	DEPTOR	Q8TB45	409 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	DCAF4	Q8WV16	495 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CCT6B	Q92526	530 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC140	Q96MF4	163 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	FAM193B	Q96PV7	902 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TBCB	Q99426	244 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	PAK6	Q9NQU5	681 aa	Predicted RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	POLH	Q9Y253	713 aa		5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	5.92	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	MED14	O60244	1454 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	LMTK3	Q96Q04	1460 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616		J3KRW8	73 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TGM5	O43548	720 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CTSK	P43235	329 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	GRK6	P43250	576 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	MAPK9	P45984	424 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	EIF5	P55010	431 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	SEMA5A	Q13591	1074 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC96	Q2M329	555 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	TMEM177	Q53S58	311 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	CCDC149	Q6ZUS6	474 aa		5.91	□□□□□ -1.46
EFHC1-223	ENST00000636616	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		5.91	□□□□□ -1.46

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