RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610468.4

MUC1-222, Transcript of mucin 1, cell surface associated, human

TSL 1 (best)

Gene MUC1, Length 1,162 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MUC1-222	ENST00000610468	SAMM50	Q9Y512	469 aa		15.71	■□□□□ 0.11
MUC1-222	ENST00000610468	PER2	O15055	1255 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ATF7	P17544	494 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PPM1A	P35813	382 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	GPC3	P51654	580 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	JAK3	P52333	1124 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TARBP2	Q15633	366 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	UGCG	Q16739	394 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	B3GNT9	Q6UX72	402 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	BMP8A	Q7Z5Y6	402 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF598	Q86UK7	904 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	LRRC43	Q8N309	656 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	RDM1	Q8NG50	284 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	MRPS27	Q92552	414 aa	Known RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PHF7	Q9BWX1	381 aa	Predicted RBP	15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	SLC26A6	Q9BXS9	759 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	NRBP2	Q9NSY0	501 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		15.7	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	GAS7	O60861	476 aa		15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PSMA5	P28066	241 aa		15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	KCNT2	Q6UVM3	1135 aa		15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	FBXL18	Q96ME1	805 aa		15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	CEP89	Q96ST8	783 aa		15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	UNC45A	Q9H3U1	944 aa		15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		15.69	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	CYP3A7-CYP3A51P	A0A087WV96	503 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468		A0A0U1RQF3	1178 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PSMD10	O75832	226 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ZSCAN20	P17040	1043 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	CYP3A7	P24462	503 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	NHLH1	Q02575	133 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468		Q4G0T1	1027 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM67	Q6ZTA4	783 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF558	Q96NG5	402 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TCF25	Q9BQ70	676 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TRAIP	Q9BWF2	469 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	NIFK	Q9BYG3	293 aa	Known RBP	15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	S1PR5	Q9H228	398 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		15.68	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PLXNA4	Q9HCM2	1894 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	HIDE1	A8MVS5	230 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468		M0R2N6	131 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	CHMP2A	O43633	222 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	REC8	O95072	547 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	STBD1	O95210	358 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	EOMES	O95936	686 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	SRGAP2B	P0DMP2	458 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	NLRP5	P59047	1200 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	NPY5R	Q15761	445 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PLPP4	Q5VZY2	271 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ABI1	Q8IZP0	508 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TBCK	Q8TEA7	893 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	RSPH1	Q8WYR4	309 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	MBOAT7	Q96N66	472 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	SPG21	Q9NZD8	308 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PCDHA4	Q9UN74	947 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TECTA	O75443	2155 aa		15.67	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	LOXHD1	Q8IVV2	1947 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TMEM221	A6NGB7	291 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468		M0R296	226 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	HOXB8	P17481	243 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	PBX3	P40426	434 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ZXDA	P98168	799 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	CDC42EP1	Q00587	391 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	DRP2	Q13474	957 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	XKR3	Q5GH77	459 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ANKRD54	Q6NXT1	300 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	MOXD1	Q6UVY6	613 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	RUFY3	Q7L099	469 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	GJA10	Q969M2	543 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ZNF668	Q96K58	619 aa	Predicted RBP	15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		15.66	■□□□□ 0.1
MUC1-222	ENST00000610468	ENTPD7	Q9NQZ7	604 aa		15.66	■□□□□ 0.1

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