RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596536.5

FCHO1-216, Transcript of FCH domain only 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene FCHO1, Length 3,204 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCHO1-216ENST00000596536 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 FLT3P36888 993 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC50Q8IVM0 306 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TPH2Q8IWU9 490 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 MAB21L3Q8N8X9 362 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 USP38Q8NB14 1042 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 KCNMB3Q9NPA1 279 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 OSGEPQ9NPF4 335 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 NAGPAQ9UK23 515 aa11.62□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 NT5C2P49902 561 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SKOR1P84550 965 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 LLGL1Q15334 1064 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ACCSLQ4AC99 568 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 DAAM2Q86T65 1068 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 FUKQ8N0W3 1084 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF513Q8N8E2 541 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 MAGEC3Q8TD91 643 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PIK3R5Q8WYR1 880 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 NEUROG2Q9H2A3 272 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 GDF3Q9NR23 364 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 KIF4AO95239 1232 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 GNA14O95837 355 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 NR3C1P04150 777 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 CYP2J2P51589 502 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ITIH3Q06033 890 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 METTL13Q8N6R0 699 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TEKT1Q969V4 418 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 AIPL1Q9NZN9 384 aa11.61□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM49P0CI25 452 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TRIM49CP0CI26 452 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ARHGAP44Q17R89 818 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ALS2CLQ60I27 953 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PEX26Q7Z412 305 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 GLYCTKQ8IVS8 523 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 IQCKQ8N0W5 287 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 MYCT1Q8N699 235 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 CAVIN3Q969G5 261 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SH2D3AQ9BRG2 576 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 EDEM3Q9BZQ6 932 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 HAUS2Q9NVX0 235 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TSKSQ9UJT2 592 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 MYH7BA7E2Y1 1941 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 F5H6K3 240 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 KRIT1O00522 736 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 DAPK3O43293 454 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ATP2C2O75185 946 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 LRRN2O75325 713 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SLC8A1P32418 973 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TNNC1P63316 161 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 JAG1P78504 1218 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 KLRC3Q07444 240 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 NR2E1Q9Y466 385 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 LTBP1Q14766 1721 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 MSH4O15457 936 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SART1O43290 800 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 CFBP00751 764 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 NR1D1P20393 614 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 CRKP46108 304 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SPIRE1Q08AE8 756 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ETNPPLQ8TBG4 499 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PAGR1Q9BTK6 254 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TTI1O43156 1089 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 RAB27AP51159 221 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 PPP1R18Q6NYC8 613 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SIAH1Q8IUQ4 282 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 SWAP70Q9UH65 585 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ASTN1O14525 1302 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 EPB41P11171 864 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 TMOD1P28289 359 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 LSP1P33241 339 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 ODF2Q5BJF6 829 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 CCDC174Q6PII3 467 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 FBXO11Q86XK2 927 aa11.59□□□□□ -0.55
FCHO1-216ENST00000596536 C3orf20Q8ND61 904 aa11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms