RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592658.1

CTIF-211, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 952 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-211ENST00000592658 LRRC43Q8N309 656 aa15.05■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 TMTC2Q8N394 836 aa15.05■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 TMEM87BQ96K49 555 aa15.05■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 OSMRQ99650 979 aa15.05■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 DUSP12Q9UNI6 340 aa15.05■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 COL1A2P08123 1366 aa15.05■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 BACH1O14867 736 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 HOXA2O43364 376 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 MCM5P33992 734 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 LIFRP42702 1097 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 TDGQ13569 410 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 KIZQ2M2Z5 673 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 ATAT1Q5SQI0 421 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 ABHD15Q6UXT9 468 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 ANO3Q9BYT9 981 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 DZANK1Q9NVP4 752 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 DLL3Q9NYJ7 618 aa15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 MEIS1O00470 390 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 GPR32O75388 356 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 C22orf31O95567 290 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 ATP4AP20648 1035 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 ZNF484Q5JVG2 852 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 FAM160B1Q5W0V3 765 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 MICU3Q86XE3 530 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 FANCBQ8NB91 859 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 KCNG4Q8TDN1 519 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 LRRC2Q9BYS8 371 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 RIC8AQ9NPQ8 531 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 ZNF302Q9NR11 478 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 IRAK3Q9Y616 596 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 SLC12A7Q9Y666 1083 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 EVPLQ92817 2033 aa15.03■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 CEP250Q9BV73 2442 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 CXCL14O95715 111 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 VTNP04004 478 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 EPCAMP16422 314 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 SREBF1P36956 1147 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 NAPAP54920 295 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 CLLU1OSQ5K130 101 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 PDXDC2PQ6P474 469 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 SIX5Q8N196 739 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 SLC22A17Q8WUG5 538 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 ZBP1Q9H171 429 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 KCNK12Q9HB15 430 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 R4GN57 208 aa15.02■□□□□ -0
CTIF-211ENST00000592658 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 DHX15O43143 795 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 FOSP01100 380 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 ADCY7P51828 1080 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 SWSAP1Q6NVH7 229 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 PPP1R18Q6NYC8 613 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa15.01□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 FAM86B1E9PN63 330 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 SLC27A2O14975 620 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 FAM86B2P0C5J1 330 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 CLK2P49760 499 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 CLCN3P51790 818 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 BCAR1P56945 870 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 TMC5Q6UXY8 1006 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 NIPA1Q7RTP0 329 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 OTOP3Q7RTS5 596 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 GPR149Q86SP6 731 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 SGMS1Q86VZ5 419 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 TEX2Q8IWB9 1127 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 ABI1Q8IZP0 508 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 VPS52Q8N1B4 723 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 AUTS2Q8WXX7 1259 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 FBXL21Q9UKT6 434 aa15□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 FANCMQ8IYD8 2048 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 KRBA1A5PL33 1030 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 SMCO2A6NFE2 343 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 NARSO43776 548 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 CTSAP10619 480 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 ZNF76P36508 570 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 FUT2Q10981 343 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 AP3B2Q13367 1082 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 CCDC149Q6ZUS6 474 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 CKAP2LQ8IYA6 745 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 METTL13Q8N6R0 699 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 LINC01465Q8N7H1 131 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 HELQQ8TDG4 1101 aa14.99□□□□□ -0.01
CTIF-211ENST00000592658 WNT16Q9UBV4 365 aa14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.1 ms