RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589669.1

CCDC130-211, Transcript of coiled-coil domain containing 130, humanhuman

TSL 2

Gene CCDC130, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130-211ENST00000589669 DEFB103AP81534 67 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 PRR20EP86478 221 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 PRR20CP86479 221 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 PRR20DP86480 221 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 PRR20BP86481 221 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 PRR20AP86496 221 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 NPY5RQ15761 445 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 PRR16Q569H4 304 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 RUFY4Q6ZNE9 571 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 BLIDQ8IZY5 108 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 LENG9Q96B70 501 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 OSBPL7Q9BZF2 842 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 SCN5AQ14524 2016 aa14.9□□□□□ -0.02
CCDC130-211ENST00000589669 HBP1O60381 514 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 GRM5P41594 1212 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 AK2P54819 239 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 KRT76Q01546 638 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TAP1Q03518 808 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MGAT3Q09327 533 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ADGRE1Q14246 886 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 FAM160B1Q5W0V3 765 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SWSAP1Q6NVH7 229 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 RNF135Q8IUD6 432 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SMAP1Q8IYB5 467 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 NME8Q8N427 588 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SNIP1Q8TAD8 396 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TBCKQ8TEA7 893 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 DNAJB3Q8WWF6 145 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 APBB2Q92870 758 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 AIFM3Q96NN9 605 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 RIT2Q99578 217 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ARID3AQ99856 593 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TRANK1O15050 2925 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 BACH1O14867 736 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MSH4O15457 936 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 AMHP03971 560 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 CTSHP09668 335 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ATP4AP20648 1035 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 IGBP1P78318 339 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 Q4G0T1 1027 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF484Q5JVG2 852 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 IER5Q5VY09 327 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ATP8B4Q8TF62 1192 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TOP1MTQ969P6 601 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 PHF20Q9BVI0 1012 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ZNF302Q9NR11 478 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 INSL6Q9Y581 213 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SQORQ9Y6N5 450 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 STK36Q9NRP7 1315 aa14.88□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 CTDNEP1O95476 244 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 PSAPP07602 524 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 XBP1P17861 261 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 NEK4P51957 841 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MOXD1Q6UVY6 613 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 SLC5A5Q92911 643 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MBOAT7Q96N66 472 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 UIMC1Q96RL1 719 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TOR4AQ9NXH8 423 aa14.87□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MYO9BQ13459 2157 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ARHGEF15O94989 841 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 KLRC1P26715 233 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 RAB15P59190 212 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 LPIN1Q14693 890 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ME3Q16798 604 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 FBXO47Q5MNV8 452 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 KRT25Q7Z3Z0 450 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 CYP4X1Q8N118 509 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 USP38Q8NB14 1042 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 WASF1Q92558 559 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ZBTB10Q96DT7 871 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 VCANP13611 3396 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TANC1Q9C0D5 1861 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 DOCK5Q9H7D0 1870 aa14.86□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 LCHNA4D1U4 455 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 WDR64B1ANS9 1081 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ZBTB42B2RXF5 422 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 ENPP3O14638 875 aa14.85□□□□□ -0.03
CCDC130-211ENST00000589669 PSMD10O75832 226 aa14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.8 ms