RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588667.5

ATG4D-208, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATG4D, Length 1,619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-208ENST00000588667 DACT1Q9NYF0 836 aa22.41■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 DGAT1O75907 488 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 VTNP04004 478 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 UBA7P41226 1012 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 SHHQ15465 462 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 C9orf50Q5SZB4 431 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 CSRNP2Q9H175 543 aa22.4■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 MICAL3Q7RTP6 2002 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 A0A087WWV3 80 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 FGBP02675 491 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 DRP2Q13474 957 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 FBXO47Q5MNV8 452 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 CABP7Q86V35 215 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 MTRQ99707 1265 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 SQORQ9Y6N5 450 aa22.39■■□□□ 1.18
ATG4D-208ENST00000588667 NR1I2O75469 434 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ACTN1P12814 892 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF445P59923 1031 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 KIZQ2M2Z5 673 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CNKSR3Q6P9H4 555 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 USP38Q8NB14 1042 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 NUP62CLQ9H1M0 184 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 DNM3Q9UQ16 869 aa22.39■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ARHGEF35A5YM69 484 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 GPR32O75388 356 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 GHRP10912 638 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CDC42EP1Q00587 391 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 GRB10Q13322 594 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 LPIN1Q14693 890 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 OTOP2Q7RTS6 562 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TCP11Q8WWU5 503 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 HERVK_113Q902F9 699 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CALML4Q96GE6 196 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CLIC6Q96NY7 704 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PNMA5Q96PV4 448 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 OSBPL7Q9BZF2 842 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CCSER1Q9C0I3 900 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 GINS2Q9Y248 185 aa22.38■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 USO1O60763 962 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 KINO60870 393 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 EYA4O95677 639 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 GPC3P51654 580 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 NLRP11P59045 1033 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM119Q4V9L6 283 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TSHZ1Q6ZSZ6 1077 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PPP1R16BQ96T49 567 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 BHMT2Q9H2M3 363 aa22.37■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 A0A1B0GVL5 298 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 BAIAP3O94812 1187 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 RASIP1Q5U651 963 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 RESP18Q5W5W9 173 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SHC4Q6S5L8 630 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PADI6Q6TGC4 694 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 MCPH1Q8NEM0 835 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SEPT8Q92599 483 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM143Q96AN5 459 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ADAMTS10Q9H324 1103 aa22.36■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SYCE3A1L190 88 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 E9PMD0 336 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TXLNAP40222 546 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SPECC1Q5M775 1068 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 KCNK18Q7Z418 384 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 DBF4BQ8NFT6 615 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 APBB2Q92870 758 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 OSMRQ99650 979 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CLSTN2Q9H4D0 955 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 FAM13BQ9NYF5 915 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PFKFB1P16118 471 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 NDUFA8P51970 172 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 ZNF410Q86VK4 478 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TMEM40Q8WWA1 233 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 NLRP7Q8WX94 980 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 EPSTI1Q96J88 318 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 SCLT1Q96NL6 688 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 PLIN2Q99541 437 aa22.35■■□□□ 1.17
ATG4D-208ENST00000588667 TNMDQ9H2S6 317 aa22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms