RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588555.1

SCAMP4-210, Transcript of secretory carrier membrane protein 4, humanhuman

Gene SCAMP4, Length 1,785 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC7A3Q8WY07 619 aa28.7■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CENPFP49454 3210 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 A0A1B0GTH6 734 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 K7ENM7 598 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 MAFO75444 373 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 EDRF1Q3B7T1 1238 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPV1Q8NER1 839 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 SPIRE2Q8WWL2 714 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 RNPEPQ9H4A4 650 aa28.69■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 HTTP42858 3142 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 A6NJR5 290 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 NPTX2P47972 431 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 ALCAMQ13740 583 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 KSR1Q8IVT5 923 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CTAGE1Q96RT6 745 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM184BQ9ULE4 1060 aa28.68■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TGFB1I1O43294 461 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 HBP1O60381 514 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF286BP0CG31 522 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CYBAP13498 195 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 GTF2BQ00403 316 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TLK2Q86UE8 772 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 NR1I3Q14994 352 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 DGKDQ16760 1214 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 HAUS6Q7Z4H7 955 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 SPC24Q8NBT2 197 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC17A8Q8NDX2 589 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CD99L2Q8TCZ2 262 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TRPC6Q9Y210 931 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 Q9Y3F1 56 aa28.67■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 GPR25O00155 361 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 SLC16A4O15374 487 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 ARL2P36404 184 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 MFSD14CQ5VZR4 134 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 FAM114A1Q8IWE2 563 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM143Q96AN5 459 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 IKZF4Q9H2S9 585 aa28.66■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CEP63Q96MT8 703 aa28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 H3BRB1 525 aa28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 COPB1P53618 953 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 SMTNP53814 917 aa28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 SRRDQ9UH36 339 aa28.65■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CALUO43852 315 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 AKR1A1P14550 325 aa28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 DRC7Q8IY82 874 aa28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 ASAP3Q8TDY4 903 aa28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 KIFC3Q9BVG8 833 aa28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 KMT5AQ9NQR1 393 aa28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 TAB2Q9NYJ8 693 aa28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF215Q9UL58 517 aaPredicted RBP28.64■■■□□ 2.18
SCAMP4-210ENST00000588555 CCDC169A6NNP5 214 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 TPM3P06753 285 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 GLRA2P23416 452 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 NFIL3Q16649 462 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 EXOC8Q8IYI6 725 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 TRAPPC12Q8WVT3 735 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 IFT74Q96LB3 600 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 SAGE1Q9NXZ1 904 aa28.63■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 GAS2O43903 313 aaKnown RBP28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 INSRRP14616 1297 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 TRIM32Q13049 653 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 DRP2Q13474 957 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 ZNF484Q5JVG2 852 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 GBP3Q9H0R5 595 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 TEX33O43247 280 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 NR2F2P24468 414 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 ADAM9Q13443 819 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 CREBRFQ8IUR6 639 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 VSTM4Q8IW00 320 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 KCNN1Q92952 543 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 HVCN1Q96D96 273 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 ACCSQ96QU6 501 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 VPS16Q9H269 839 aa28.62■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa28.61■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 TMEM206Q9H813 350 aa28.61■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 COL1A2P08123 1366 aa28.61■■■□□ 2.17
SCAMP4-210ENST00000588555 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 72.4 ms