RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-205	ENST00000577827	TTC13	Q8NBP0	860 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DCAF4	Q8WV16	495 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ANAPC7	Q9UJX3	599 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	FAF1	Q9UNN5	650 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PFDN1	O60925	122 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KRT37	O76014	449 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PRDX5	P30044	214 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CDR2	Q01850	454 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DEUP1	Q05D60	604 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DIXDC1	Q155Q3	683 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SYDE2	Q5VT97	1194 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PDZD4	Q76G19	769 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF564	Q8TBZ8	553 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DDX27	Q96GQ7	796 aa	Known RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KMT5A	Q9NQR1	393 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TMEM51	Q9NW97	253 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SUCLA2	Q9P2R7	463 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MINPP1	Q9UNW1	487 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TTI1	O43156	1089 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ACTN1	P12814	892 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SEC24C	P53992	1094 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PPCS	Q9HAB8	311 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SENP2	Q9HC62	589 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	EPS15L1	Q9UBC2	864 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827		A0A0G2JLW4	131 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	POTEB3	A0JP26	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	POTEC	B2RU33	542 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PHF2	O75151	1096 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CDH16	O75309	829 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ANKRD20A4	Q4UJ75	823 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ANKRD20A8P	Q5CZ79	823 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	POTEB	Q6S5H4	581 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RFX6	Q8HWS3	928 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	GLYCTK	Q8IVS8	523 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CSRNP1	Q96S65	589 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MAD1L1	Q9Y6D9	718 aa		11.12	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	USP17L5	A8MUK1	530 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	GIPC1	O14908	333 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	UCHL3	P15374	230 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PDE1B	Q01064	536 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ASPH	Q12797	758 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TRIM59	Q8IWR1	403 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	NME8	Q8N427	588 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TEX9	Q8N6V9	391 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	STK33	Q9BYT3	514 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	YIPF3	Q9GZM5	350 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	INTS2	Q9H0H0	1204 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	VCPKMT	Q9H867	229 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SPAG7	O75391	227 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CRCP	O75575	148 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	NTRK3	Q16288	839 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	C12orf60	Q5U649	245 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ARHGEF16	Q5VV41	709 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CYB5D1	Q6P9G0	228 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ZC3H18	Q86VM9	953 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ZNF354C	Q86Y25	554 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SYNE4	Q8N205	404 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SERPINI1	Q99574	410 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SLC24A3	Q9HC58	644 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MID2	Q9UJV3	735 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SMG5	Q9UPR3	1016 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PITPNM2	Q9BZ72	1349 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SHPRH	Q149N8	1683 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SNAP23	O00161	211 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	MYBL1	P10243	752 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	SMARCA1	P28370	1054 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	RAD23B	P54727	409 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CRYM	Q14894	314 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ILDR1	Q86SU0	546 aa	Predicted RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	NUDCD1	Q96RS6	583 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	DDX23	Q9BUQ8	820 aa	Known RBP	11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		11.11	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	NOP56	O00567	594 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CP	P00450	1065 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	TMOD1	P28289	359 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	BBS9	Q3SYG4	887 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CCDC125	Q86Z20	511 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		11.1	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	11.1	□□□□□ -0.63
PTPRM-205	ENST00000577827	WDR75	Q8IWA0	830 aa	Known RBP	11.1	□□□□□ -0.63

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