RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574407.5

PHF23-210, Transcript of PHD finger protein 23, humanhuman

TSL 2

Gene PHF23, Length 497 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF23-210ENST00000574407 MMP1P03956 469 aa23.48■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 KCNA5P22460 613 aa23.48■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 FAM102BQ5T8I3 360 aa23.48■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 HCSTQ9UBK5 93 aa23.48■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 DARSP14868 501 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 FGFR4P22455 802 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 SPIRE1Q08AE8 756 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 CAMK1Q14012 370 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 ZNF710Q8N1W2 664 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 P2RX5Q93086 422 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 SCLT1Q96NL6 688 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 BRMS1Q9HCU9 246 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.47■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 TBKBP1A7MCY6 615 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 DDX11L8A8MPP1 907 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 BTBD18B2RXH4 712 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 WNT7AO00755 349 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 ITGB1P05556 798 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 FGFR1P11362 822 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 QARSP47897 775 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 FAM189BP81408 668 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 COL19A1Q14993 1142 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 C8orf34Q49A92 452 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 KLHL23Q8NBE8 558 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 NLRP7Q8WX94 980 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 TMEM161AQ9NX61 479 aa23.46■■□□□ 1.35
PHF23-210ENST00000574407 MAFO75444 373 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 DNAJB1P25685 340 aa23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 NPEPPSP55786 919 aa23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 LEXMQ3ZCV2 418 aa23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 NCAPH2Q6IBW4 605 aa23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 LXNQ9BS40 222 aa23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 RNF19AQ9NV58 838 aa23.45■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 NEK9Q8TD19 979 aa23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 KIF2CQ99661 725 aa23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 RGL1Q9NZL6 768 aa23.44■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 A0A087WZ62 844 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 H3BQ06 376 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 MARCH6O60337 910 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 HYAL1Q12794 435 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 EPHA7Q15375 998 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 NAALADL2Q58DX5 795 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CCDC83Q8IWF9 413 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 SLFN12Q8IYM2 578 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 SPPL3Q8TCT6 385 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa23.43■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP23.42■■□□□ 1.345e-8■■■■■ 29.7
PHF23-210ENST00000574407 IRS1P35568 1242 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CYP4A11Q02928 519 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 TRIM29Q14134 588 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ECHDC2Q86YB7 292 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 RHPN2Q8IUC4 686 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 KSR1Q8IVT5 923 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 DYDC2Q96IM9 177 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CLDND1Q9NY35 253 aa23.42■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 IL9P15248 144 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 DNM2P50570 870 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 GUCY1B3Q02153 619 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 EP400NLQ6ZTU2 488 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ZNF410Q86VK4 478 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 C4orf19Q8IY42 314 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 POF1BQ8WVV4 589 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CEP170P1Q96L14 293 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CWH43Q9H720 699 aa23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 BAG4O95429 457 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 YWHABP31946 246 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 LTBRP36941 435 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CALCRLQ16602 461 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CTC1Q2NKJ3 1217 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 LRRC55Q6ZSA7 311 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 COLGALT1Q8NBJ5 622 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 NLRP4Q96MN2 994 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 CASD1Q96PB1 797 aa23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PHF23-210ENST00000574407 TMEM117Q9H0C3 514 aa23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms