RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562199.1

CAPN3-211, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 385 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-211ENST00000562199 MPP1Q00013 466 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 FAPQ12884 760 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 MPP3Q13368 585 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 NEDD9Q14511 834 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 SMUG1Q53HV7 270 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 EMC10Q5UCC4 262 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 METTL11BQ5VVY1 283 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 POMZP3Q6PJE2 187 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 DBX2Q6ZNG2 339 aa6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 TTC39CQ8N584 583 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 ESX1Q8N693 406 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 DESI2Q9BSY9 194 aa6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 TNKS2Q9H2K2 1166 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 RABEP2Q9H5N1 569 aa6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 CD93Q9NPY3 652 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 TUBA8Q9NY65 449 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 CCPG1Q9ULG6 757 aa6.06□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 PTCH1Q13635 1447 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.06□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 A8MVJ9 347 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 F5H423 210 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 FOXO3O43524 673 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 TMEM127O75204 238 aa6.05□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 PRLRP16471 622 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 EPS15P42566 896 aa6.05□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 FCRLBQ6BAA4 426 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 XRRA1Q6P2D8 792 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 MFSD6Q6ZSS7 791 aa6.05□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 EPHX4Q8IUS5 362 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 IPMKQ8NFU5 416 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 POF1BQ8WVV4 589 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 KIF1BPQ96EK5 621 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 CHFRQ96EP1 664 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 PI4K2AQ9BTU6 479 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 TEX13BQ9BXU2 312 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 TSGA10Q9BZW7 698 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 LMAN2LQ9H0V9 348 aa6.05□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 HPF1Q9NWY4 346 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa6.05□□□□□ -1.44
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CAPN3-211ENST00000562199 COG5Q9UP83 839 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 DMTF1Q9Y222 760 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 ZFYVE9O95405 1425 aa6.05□□□□□ -1.44
CAPN3-211ENST00000562199 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.04□□□□□ -1.44
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