RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 KIAA2013Q8IYS2 634 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 FAM168AQ92567 244 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 VWCEQ96DN2 955 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CFAP53Q96M91 514 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PLEKHF1Q96S99 279 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 STARD7Q9NQZ5 370 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 USP40Q9NVE5 1235 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PARP2Q9UGN5 583 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 RFX7Q2KHR2 1363 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa5.63□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 TET1Q8NFU7 2136 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 LCHNA4D1U4 455 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MYADML2A6NDP7 307 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CSF1RP07333 972 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HOXC6P09630 235 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CAP2P40123 477 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 NBL1P41271 181 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ACLYP53396 1101 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 GRB14Q14449 540 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CLUL1Q15846 466 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 LETMD1Q6P1Q0 360 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 AGMOQ6ZNB7 445 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 RNF180Q86T96 592 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 DPP9Q86TI2 863 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ADHFE1Q8IWW8 467 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 RIN3Q8TB24 985 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 NEK9Q8TD19 979 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 SCLYQ96I15 445 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MRIQ9BWK5 157 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MAST4O15021 2626 aa5.62□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 SPEGQ15772 3267 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CYSRT1A8MQ03 144 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 GFRA2O00451 464 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CST3P01034 146 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 C8AP07357 584 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 RARBP10826 455 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CDK7P50613 346 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 JAG1P78504 1218 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 DAB2P98082 770 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PSMD2Q13200 908 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PICALMQ13492 652 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 KCNA10Q16322 511 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CDKAL1Q5VV42 579 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 VPS37DQ86XT2 251 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MFSD4AQ8N468 514 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CHAMP1Q96JM3 812 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HSPA12BQ96MM6 686 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 BTBD7Q9P203 1132 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF236Q9UL36 1845 aa5.61□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 MCM3APO60318 1980 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 SIPA1L1O43166 1804 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 FRYQ5TBA9 3013 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CBX7O95931 251 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PGRP06401 933 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ADORA2AP29274 412 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 BACE1P56817 501 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 RIPK4P57078 832 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ZXDAP98168 799 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 OLFML2BQ68BL8 750 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 C22orf34Q6ZV56 151 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 FBXO33Q7Z6M2 555 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 DEFB128Q7Z7B8 93 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 NPAS4Q8IUM7 802 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 FAM126BQ8IXS8 530 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 HIPK3Q9H422 1215 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 CNNM1Q9NRU3 951 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 SEMA3GQ9NS98 782 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 TMOD4Q9NZQ9 345 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 PRKAG3Q9UGI9 489 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 TLR6Q9Y2C9 796 aa5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP5.6□□□□□ -1.51
TMOD3-210ENST00000561408 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms