RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559586.5

RABGGTA-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTA, Length 889 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-210ENST00000559586 BAG4O95429 457 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 C22orf31O95567 290 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 KLRC1P26715 233 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 NPAS4Q8IUM7 802 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM167AQ96KS9 214 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP89Q96ST8 783 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 TRPV2Q9Y5S1 764 aa22.47■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM150BA6NC51 233 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 GRM6O15303 877 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 LINC00271P0C7V0 271 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 CD52P31358 61 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 EPHA7Q15375 998 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 CTC1Q2NKJ3 1217 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 ADHFE1Q8IWW8 467 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHA12Q9UN75 941 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 TTC3P53804 2025 aa22.46■■□□□ 1.19
RABGGTA-210ENST00000559586 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 SMIM35A0A1B0GVV1 85 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 H3BQV1 296 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 DCXO43602 365 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 MARCH6O60337 910 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 TXKP42681 527 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ZP2Q05996 745 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 PAK2Q13177 524 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 MCTP1Q6DN14 999 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 NCAPH2Q6IBW4 605 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 LINC01465Q8N7H1 131 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 RGL1Q9NZL6 768 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa22.45■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 P4HBP07237 508 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 QARSP47897 775 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 PSMC5P62195 406 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 HYAL1Q12794 435 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 XKR3Q5GH77 459 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ODR4Q5SWX8 454 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ANO5Q75V66 913 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 NRBP2Q9NSY0 501 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 PADI3Q9ULW8 664 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 PLAGL2Q9UPG8 496 aa22.44■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 MYO7AQ13402 2215 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 C19orf67A6NJJ6 358 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 OR52Z1P0C646 297 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 LTBRP36941 435 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 DYDC2Q96IM9 177 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 FOXD4L1Q9NU39 408 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 LRFN2Q9ULH4 789 aa22.43■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 POTEMA6NI47 508 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 SLITRK3O94933 977 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CRIPAKQ8N1N5 446 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 LXNQ9BS40 222 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CEP131Q9UPN4 1083 aa22.42■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 SYT1P21579 422 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 TMEM62Q0P6H9 643 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 PTGDRQ13258 359 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 C4orf19Q8IY42 314 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 LINC01599Q8WXQ3 324 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 PIEZO1Q92508 2521 aa22.41■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ZBTB39O15060 712 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 MAGEB2O15479 319 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CYP4A11Q02928 519 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ADAM15Q13444 863 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 IL17AQ16552 155 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 PLA2G4FQ68DD2 849 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 KCNH6Q9H252 994 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 IGFLR1Q9H665 355 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CDHR5Q9HBB8 845 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 CD207Q9UJ71 328 aa22.4■■□□□ 1.18
RABGGTA-210ENST00000559586 ARID2Q68CP9 1835 aa22.4■■□□□ 1.18
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