RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549362.1

USP25-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 2

Gene USP25, Length 606 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-210ENST00000549362 UBE2HP62256 183 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 MTMR1Q13613 665 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 DCTN1Q14203 1278 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PPP2R5AQ15172 486 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TESK1Q15569 626 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TMEM177Q53S58 311 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ABHD17CQ6PCB6 329 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 FKBP9P1Q75LS8 142 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ERC1Q8IUD2 1116 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CHST14Q8NCH0 376 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 GPT2Q8TD30 523 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 NETO1Q8TDF5 533 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 COG1Q8WTW3 980 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 FAM168AQ92567 244 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CELF4Q9BZC1 486 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 B4GALT6Q9UBX8 382 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 SMC3Q9UQE7 1217 aa5.07□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PTPRUQ92729 1446 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 METP08581 1390 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 KDRP35968 1356 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TNRQ92752 1358 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ACEP12821 1306 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TTC41PQ6P2S7 1318 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 IGSF1Q8N6C5 1336 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 SALL3Q9BXA9 1300 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 A0A1W2PQ27 194 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 A0A1W2PQ64 194 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 A0A1W2PQC6 194 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 A0A1W2PQD8 194 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PTPDC1A2A3K4 754 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 KRT37O76014 449 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CKMP06732 381 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PDCP20941 246 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 HSPA4P34932 840 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 BCL6P41182 706 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 RAP1GAPP47736 663 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ANKRD1Q15327 319 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ARHGAP44Q17R89 818 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 GORABQ5T7V8 394 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ZPBP2Q6X784 338 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TTLL10Q6ZVT0 673 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 C16orf59Q7L2K0 433 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 MCM10Q7L590 875 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ZBTB46Q86UZ6 589 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PASD1Q8IV76 773 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CNTD1Q8N815 330 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 USP33Q8TEY7 942 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CHTF18Q8WVB6 975 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CHMP4CQ96CF2 233 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TMEM169Q96HH4 297 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ORAI3Q9BRQ5 295 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 YIPF4Q9BSR8 244 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ATP13A1Q9HD20 1204 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 SNX11Q9Y5W9 270 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 U3KQE9 123 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 NALCNQ8IZF0 1738 aa5.06□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 MAP3K5Q99683 1374 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TMEM2Q9UHN6 1383 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 RAD50Q92878 1312 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 C7orf72A4D263 438 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TRAF5O00463 557 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 TSPAN6O43657 245 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ULK1O75385 1050 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 SURF6O75683 361 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CAVIN2O95810 425 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CCDC192P0DO97 292 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 GNAT1P11488 350 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 KRT15P19012 456 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CCND1P24385 295 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CFPP27918 469 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 PSMA5P28066 241 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 ADCYAP1R1P41586 468 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 NEK2P51955 445 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 RBM10P98175 930 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 FAPQ12884 760 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 GAB4Q2WGN9 574 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 MBLAC2Q68D91 279 aa5.05□□□□□ -1.6
USP25-210ENST00000549362 CEP68Q76N32 757 aa5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.5 ms